CLUSTAL W(1.5) multiple sequence alignment


REF             -----GCGGATTTAGCTCAGTTGGGAGAGCGCCAGACTGAAAATCTGGAGGTC-CTGTGT
A0380           -----GGGCTCGTAGATCAG-CGGTAGATCGCTTCCTTCGCAAGGAAGAGGCC-CTGGGT
A0500           -----GGGCTCGTAGATCAG-TGGCAGATCGCTTCCTTCGCAAGGAAGAGGCC-CGGGGT
A0501           -----GGGCTCGTAGATCAG-GGGTAGATCACTCCCTTGGCATGGGAGAGGCC-CCGGGT
A0502           -----GGGCCCATAGCTCAG-TGGTAGAGTGCCTCCTTTGCAAGGAGGATGCC-CAGGGT
A1140           -----GGGCCCTAAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGGGTC-GACGGT
A1180           -----GGGCCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGGGTC-GACGGT
A1540           -----GGAGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTC-AGCGGT
A1660           -----GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTC-AGCGGT
A1661           -----GGGGGCATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTC-TGCGGT
A1662           -----GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTC-TGCGGT
A3920           -----GGGGGTATAGTATAATTGGTAGTACAGCAATCTTGCTCAATGCTTGTC--AAGGT
A6360           -----GGGCGTGTGGCGTAGTTGGTAGCGCGTTCGCTTAGCATGCGAAAGGTC-TCCGGT
A6400           -----GGGCGTGTGGCGTAGTCGGTAGCGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAGGTC-TCCGGT
A7680           -----GGGGGCGTAGCTCAGATGGTAGAGCGCTCGCTTAGCATGTGAGAGGTA-CCGGGA
A7681           -----GGGGGCGTAGCTCAGATGGTAGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAGGTA-CCGGGA
A9990           -----GGGGGATTAGCTCAAATGGTAGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAGGTA-GCGGGA
A9991           -----GGGGAATTAGCTCAAATGGTAGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAGGTA-GCGGGA
C0500           GCCAAGGTGGCAGAATTCGGC--CCAACGCATCCGCCTGCAGAGCGGAACCCCCGCCGGT
C1140           -----GGCAACAAGGCCAAGCGGCTAAGGCATGGGTCTGCAACACCCTGATC--ATCGGT
                     *                   *           *                    * 

REF             TCGATCCACAGAATTCGCACCA
A0380           TCAAATCCCAGCGAGTCCACCA
A0500           TCAAATCCCCGCGAGTCCACCA
A0501           TCAAATCCCGGCGAGTCCACCA
A0502           TCGAATCCCTGTGGGTCCACCA
A1140           TCGATCCCGTTAGGGTCCACCA
A1180           TCGATCCCGTTAGGGTCCACCA
A1540           TCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
A1660           TCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
A1661           TCGATCCCGCGCGCTCCCACCA
A1662           TCGATCCCGCATAGCTCCACCA
A3920           TCAAATCCTTGTATCTCCACCA
A6360           TCGACTCCGGACTCGTCCACCA
A6400           TCGATTCCGGACTCGTCCACCA
A7680           TCGATACCCGGCGCCTCCACCA
A7681           TCGATACCCGGCGCCTCCACCA
A9990           TCGATGCCCGCATCCTCCACCA
A9991           TCGATGCCCGCATTCTCCACCA
C0500           TCAAATCCGGCCCTTGGCTCCA
C1140           TCGAATCCGATTGTTGCCTCCA
                ** *  *          * ***