HMMER2.0 NAME trace_test DESC LENG 10 ALPH Amino RF no CS no COM ./hmmbuild -F trace_test.hmm trace_test.slx NSEQ 7 DATE Mon Feb 2 09:14:31 1998 XT -8455 -4 -1000 -1000 -8455 -4 -8455 -4 NULT -4 -8455 NULE 595 -1558 85 338 -294 453 -1158 197 249 902 -1085 -142 -21 -313 45 531 201 384 -1998 -644 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y m->m m->i m->d i->m i->i d->m d->d b->m m->e -585 * -1585 1 2806 -444 -1270 -1265 -1732 -744 -1182 -1034 -1212 -1545 -1010 -869 -1380 -1102 -1325 -156 -259 -640 -2039 -1721 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -111 -6123 -7165 -894 -1115 -701 -1378 -585 * 2 -608 5196 -2368 -2362 -1635 -1253 -1702 -987 -2034 -1540 -1191 -1745 -1831 -1953 -1922 -934 -927 -770 -1855 -1692 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -115 -6127 -7169 -894 -1115 -701 -1378 * * 3 -1130 -2063 3441 243 -2502 -1157 -662 -2514 -843 -2578 -2029 -96 -1658 -421 -1434 -970 -1239 -2138 -2388 -1915 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -120 -6132 -7174 -894 -1115 -701 -1378 * * 4 -988 -1921 379 3052 -2309 -1196 -495 -2108 -350 -2194 -1612 -103 -1621 -210 -770 -862 -1042 -1799 -2207 -1742 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -126 -6138 -7180 -894 -1115 -701 -1378 * * 5 -1602 -1340 -2512 -2455 3740 -2315 -379 -478 -2225 -175 -190 -1874 -2503 -1781 -2079 -1892 -1647 -683 210 1257 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -132 -6144 -7186 -894 -1115 -701 -1378 * * 6 -759 -1104 -1314 -1488 -2461 3330 -1563 -2503 -1721 -2645 -2082 -1325 -1776 -1591 -1791 -959 -1094 -1922 -2199 -2280 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -140 -6152 -7194 -894 -1115 -701 -1378 * * 7 -1192 -1547 -812 -781 -520 -1557 4586 -1881 -457 -1789 -1357 -866 -1913 -669 -600 -1231 -1258 -1678 -918 -90 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -148 -6160 -7202 -894 -1115 -701 -1378 * * 8 -1016 -805 -2637 -2367 -591 -2470 -1853 3039 -2040 329 346 -2180 -2589 -1943 -2070 -1879 -1051 1184 -1698 -1261 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -158 -6170 -7212 -894 -1115 -701 -1378 * * 9 -1028 -1686 -800 -442 -2171 -1521 -263 -1873 3103 -1859 -1251 -547 -1750 74 599 -1004 -972 -1620 -1812 -1528 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -170 -6182 -7224 -894 -1115 -701 -1378 * * 10 -1369 -1199 -2542 -2295 -129 -2453 -1603 488 -1867 2607 742 -2168 -2539 -1724 -1835 -1992 -1384 130 -1284 -897 - * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * - * * * * * * * * 0 //