Pre release Executable.properties, help added, unused properties commented out
[jabaws.git] / binaries / src / muscle / subfam.cpp
index 23f9473..e720cfa 100644 (file)
@@ -170,7 +170,7 @@ void AlignSubFam(SeqVect &vAll, const Tree &GuideTree, unsigned uNodeIndex,
        char CmdLine[4096];\r
        sprintf(CmdLine, "probcons %s > %s 2> /dev/null", InTmp, OutTmp);\r
 //     sprintf(CmdLine, "muscle -in %s -out %s -maxiters 1", InTmp, OutTmp);\r
-       system(CmdLine);\r
+       int NotUsed = system(CmdLine);\r
 \r
        TextFile fOut(OutTmp);\r
        msaOut.FromFile(fOut);\r