JAL-1807 explicit imports (jalview.appletgui)
[jalview.git] / src / jalview / appletgui / AnnotationColourChooser.java
index 0c11322..3d79588 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2b1)
- * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -20,6 +20,9 @@
  */
 package jalview.appletgui;
 
+import jalview.bin.JalviewLite;
+import jalview.datamodel.AlignmentAnnotation;
+import jalview.datamodel.GraphLine;
 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
 import jalview.schemes.AnnotationColourGradient;
 import jalview.schemes.ColourSchemeI;
@@ -61,7 +64,7 @@ public class AnnotationColourChooser extends Panel implements
 
   Hashtable oldgroupColours;
 
-  jalview.datamodel.AlignmentAnnotation currentAnnotation;
+  AlignmentAnnotation currentAnnotation;
 
   boolean adjusting = false;
 
@@ -174,7 +177,7 @@ public class AnnotationColourChooser extends Panel implements
 
     frame = new Frame();
     frame.add(this);
-    jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame,
+    JalviewLite.addFrame(frame,
             MessageManager.getString("label.colour_by_annotation"), 560,
             175);
     validate();
@@ -458,7 +461,7 @@ public class AnnotationColourChooser extends Panel implements
             && currentAnnotation.threshold == null)
     {
       currentAnnotation
-              .setThreshold(new jalview.datamodel.GraphLine(
+              .setThreshold(new GraphLine(
                       (currentAnnotation.graphMax - currentAnnotation.graphMin) / 2f,
                       "Threshold", Color.black));
     }