Adding changes from JWS2 branch. Fixes for Limit in particular
[jabaws.git] / website / dm_javadoc / compbio / data / sequence / package-summary.html
index 1abe4d5..879bbb2 100644 (file)
@@ -2,12 +2,12 @@
 <!--NewPage-->\r
 <HTML>\r
 <HEAD>\r
-<!-- Generated by javadoc (build 1.6.0_14) on Wed Feb 17 16:46:28 GMT 2010 -->\r
+<!-- Generated by javadoc (build 1.6.0_21) on Thu Nov 18 15:38:37 GMT 2010 -->\r
 <TITLE>\r
 compbio.data.sequence\r
 </TITLE>\r
 \r
-<META NAME="date" CONTENT="2010-02-17">\r
+<META NAME="date" CONTENT="2010-11-18">\r
 \r
 <LINK REL ="stylesheet" TYPE="text/css" HREF="../../../stylesheet.css" TITLE="Style">\r
 \r
@@ -55,7 +55,7 @@ function windowTitle()
 \r
 <TR>\r
 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
-&nbsp;PREV PACKAGE&nbsp;\r
+&nbsp;<A HREF="../../../compbio/data/msa/package-summary.html"><B>PREV PACKAGE</B></A>&nbsp;\r
 &nbsp;<A HREF="../../../compbio/metadata/package-summary.html"><B>NEXT PACKAGE</B></A></FONT></TD>\r
 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
   <A HREF="../../../index.html?compbio/data/sequence/package-summary.html" target="_top"><B>FRAMES</B></A>  &nbsp;\r
@@ -82,8 +82,8 @@ function windowTitle()
 <H2>\r
 Package compbio.data.sequence\r
 </H2>\r
-A data model for multiple sequence alignment web services 
- Classes in this package have no dependencies to other sources in the project.\r
+A data model for multiple sequence alignment web services and utility methods
+ that work on the objects of this model.\r
 <P>\r
 <B>See:</B>\r
 <BR>\r
@@ -127,7 +127,7 @@ A data model for multiple sequence alignment web services
 </TR>\r
 <TR BGCOLOR="white" CLASS="TableRowColor">\r
 <TD WIDTH="15%"><B><A HREF="../../../compbio/data/sequence/Program.html" title="enum in compbio.data.sequence">Program</A></B></TD>\r
-<TD>Programmes that can produce alignments</TD>\r
+<TD>The list of programmes that can produce alignments</TD>\r
 </TR>\r
 </TABLE>\r
 &nbsp;\r
@@ -152,17 +152,18 @@ Package compbio.data.sequence Description
 </H2>\r
 \r
 <P>\r
-A data model for multiple sequence alignment web services 
+A data model for multiple sequence alignment web services and utility methods
+ that work on the objects of this model.  
  Classes in this package have no dependencies to other sources in the project. 
- They form a base layer of Jalview Web Services v2.\r
+ They form a base layer of JAva Bioinformatics Analysis Web Services.\r
 <P>\r
 \r
 <P>\r
 <DL>\r
+<DT><B>Version:</B></DT>\r
+  <DD>1.0     January 2010</DD>\r
 <DT><B>Author:</B></DT>\r
-  <DD>Petr Troshin 
-        Date January 2010</DD>\r
+  <DD>Petr Troshin</DD>\r
 </DL>\r
 <HR>\r
 \r
@@ -194,7 +195,7 @@ A data model for multiple sequence alignment web services
 \r
 <TR>\r
 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
-&nbsp;PREV PACKAGE&nbsp;\r
+&nbsp;<A HREF="../../../compbio/data/msa/package-summary.html"><B>PREV PACKAGE</B></A>&nbsp;\r
 &nbsp;<A HREF="../../../compbio/metadata/package-summary.html"><B>NEXT PACKAGE</B></A></FONT></TD>\r
 <TD BGCOLOR="white" CLASS="NavBarCell2"><FONT SIZE="-2">\r
   <A HREF="../../../index.html?compbio/data/sequence/package-summary.html" target="_top"><B>FRAMES</B></A>  &nbsp;\r