JWS-109 & JWS-116 Added the new chaching as new entries to index.jsp and the docs...
[jabaws.git] / website / docs / changelog.html
index 7b72a65..b4de96b 100644 (file)
 <li class="toctree-l1"><a class="reference internal" href="stats.html">Usage Statistics</a></li>
 <li class="toctree-l1"><a class="reference internal" href="citations.html">Citations</a></li>
 <li class="toctree-l1 current"><a class="current reference internal" href="#">Changelog</a><ul>
-<li class="toctree-l2"><a class="reference internal" href="#version-2-2-released-xx-april-2017">Version 2.2 (Released XX April 2017)</a></li>
+<li class="toctree-l2"><a class="reference internal" href="#version-2-2-released-02-june-2017">Version 2.2 (Released 02 June 2017)</a></li>
 <li class="toctree-l2"><a class="reference internal" href="#version-2-1-released-1st-oct-2013">Version 2.1 (Released 1st Oct 2013)</a></li>
 <li class="toctree-l2"><a class="reference internal" href="#version-2-0-1-released-2nd-jul-2013">Version 2.0.1 (Released 2nd Jul 2013)</a></li>
 <li class="toctree-l2"><a class="reference internal" href="#version-2-released-16th-dec-2011">Version 2 (Released 16th Dec 2011)</a></li>
       <li class="wy-breadcrumbs-aside">
         
             
-            <a href="_sources/changelog.rst.txt" rel="nofollow"> View page source</a>
+            <!-- <a href="_sources/changelog.rst.txt" rel="nofollow"> View page source</a> -->
+            <a href="../">Return to the JABAWS homepage</a>
           
         
       </li>
             
   <div class="section" id="changelog">
 <h1>Changelog<a class="headerlink" href="#changelog" title="Permalink to this headline">¶</a></h1>
-<div class="section" id="version-2-2-released-xx-april-2017">
-<span id="v2-2"></span><h2>Version 2.2 (Released XX April 2017)<a class="headerlink" href="#version-2-2-released-xx-april-2017" title="Permalink to this headline">¶</a></h2>
+<div class="section" id="version-2-2-released-02-june-2017">
+<span id="v2-2"></span><h2>Version 2.2 (Released 02 June 2017)<a class="headerlink" href="#version-2-2-released-02-june-2017" title="Permalink to this headline">¶</a></h2>
 <p>The website and documentation were improved:</p>
 <ul class="simple">
 <li><a class="reference external" href="http://www.sphinx-doc.org/en/stable/">Sphinx</a> is now used to generate our documentation pages.</li>
 <li>Documentation was updated to reflect the latest changes introduced in the project.</li>
+<li>Usage Statistics are now cached and refreshed every hour for improved website loading times.</li>
+<li>Service Status are now similarly cached and monitored every 10 minutes.</li>
 <li>Downloading the JABAWS distributions no longer require &#8216;sign in&#8217; or &#8216;sign up&#8217; to a user account.</li>
 <li>The pre-configured JABAWS Amazon Machine Image (AMI), which allowed for JABAWS to be run in the Amazon EC2 cloud, is no longer provided due to very limited use by the scientific community peers.</li>
 </ul>
 <li>ClustalW was updated to version 2.1</li>
 <li>Mafft was updated to version 7.3.10</li>
 <li>T-Coffee was updated to version 11.00.8cbe486</li>
+<li><a class="reference external" href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/aacon/">AACon</a> was updated to version 1.1</li>
 <li>Protein secondary structure prediction with Jpred (version 3.0.3) was dropped from the list of provided services, as the use of the dedicated Jpred REST API (Jpred 4) is encouraged and recommended. This is the version that is currently provided within Jalview 2.9 or later.</li>
 </ul>
 <div class="admonition note">
 <li>Disembl returned swapped strings for HOTLOOPS and REM465</li>
 <li>Jronn failed to process jobs with more than 3 sequences</li>
 <li>JABAWS could not deal with FASTA records with &#8216;&gt;&#8217; symbols in the record identificator</li>
-<li>Change of parameter description for AAcon: parameters have been replaced with options for calculation methods. This allows a user to get several AAcon&#8217;s conservation scores in one call</li>
+<li>Change of parameter description for AACon: parameters have been replaced with options for calculation methods. This allows a user to get several AACon&#8217;s conservation scores in one call</li>
 <li>JABAWS never cleaned up job directories. Now JABAWS deletes the job directory if it exist longer than a period defined in Engine.properties</li>
 <li>Default web security has been incompatible with Tomcat 7.0.31 and newer</li>
 <li>Documentation has been updated</li>
 
   <div role="contentinfo">
     <p><a href="../">JABAWS 2.2</a>
-        &copy; Copyright 2017, Peter Troshin, Alexander Sherstnev, Jim Procter, Alexey Drozdetskiy, Daniel Barton, Suzanne Duce, Fábio Madeira and Geoff Barton.
+        &copy; Copyright 2017, Peter Troshin, Alexander Sherstnev, Jim Procter, Daniel Barton, Fábio Madeira, Alexey Drozdetskiy, Suzanne Duce and Geoff Barton.
 
     </p>
   </div>