X-Git-Url: http://source.jalview.org/gitweb/?a=blobdiff_plain;f=examples%2Ftestdata%2Fphyre2results%2F56da5616b4559c93%2Fss_summary.html;fp=examples%2Ftestdata%2Fphyre2results%2F56da5616b4559c93%2Fss_summary.html;h=aa75543342229d840d26635d98007a2251423a6d;hb=207b06de28859536277608ad94897eaa526b1279;hp=0000000000000000000000000000000000000000;hpb=8537d486848be3e97578248dae6bede12e343fe1;p=jalview.git diff --git a/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/ss_summary.html b/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/ss_summary.html new file mode 100644 index 0000000..aa75543 --- /dev/null +++ b/examples/testdata/phyre2results/56da5616b4559c93/ss_summary.html @@ -0,0 +1,87 @@ +
+ |
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Secondary structure and disorder prediction |   |
  |   | +1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | +M | A | S | V | S | A | T | M | I | S | T | S | F | M | P | R | K | P | A | V | T | S | L | K | P | I | P | N | V | G | E | A | L | F | G | L | K | S | A | N | G | G | K | V | T | C | M | A | S | Y | K | V | K | L | I | T | P | D | G | P | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | +|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | +|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | +? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | +|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | +. | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | +I | E | F | D | C | P | D | N | V | Y | I | L | D | Q | A | E | E | A | G | H | D | L | P | Y | S | C | R | A | G | S | C | S | S | C | A | G | K | I | A | G | G | A | V | D | Q | T | D | G | N | F | L | D | D | D | Q | L | E | E | G | W | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | +|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | +|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | +? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | +|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | +. | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |   | +V | L | T | C | V | A | Y | P | Q | S | D | V | T | I | E | T | H | K | E | A | E | L | V | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure |   | +|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | +|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | +? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | +|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Confidence Key | |||||||||||
High(9) |   | +  | +  | +  | +  | +  | +  | +  | +  | +  | +Low (0) |
? | Disordered ( 37%) |
Alpha helix ( 25%) | |
Beta strand ( 25%) |