X-Git-Url: http://source.jalview.org/gitweb/?a=blobdiff_plain;f=testsrc%2Ftestdata%2Foutput.long;fp=testsrc%2Ftestdata%2Foutput.long;h=0000000000000000000000000000000000000000;hb=4d68b23381e6589b665e40dc012c66e78cd2f7a5;hp=946d06cb3a6d61cdc4616f52fe197b5a68e103f0;hpb=0a982a5ec8f74cf8bcaf923e4a747c863968858d;p=jabaws.git diff --git a/testsrc/testdata/output.long b/testsrc/testdata/output.long deleted file mode 100644 index 946d06c..0000000 --- a/testsrc/testdata/output.long +++ /dev/null @@ -1,788 +0,0 @@ -# P50_HUMAN - 1 M 0.9943 - 2 E 0.9917 - 3 E 0.9879 - 4 P 0.9831 - 5 Q 0.9553 - 6 S 0.9316 - 7 D 0.9208 - 8 P 0.9119 - 9 S 0.8857 - 10 V 0.7951 - 11 E 0.7605 - 12 P 0.8074 - 13 P 0.7342 - 14 L 0.6374 - 15 S 0.6035 - 16 Q 0.5331 - 17 E 0.4781 - 18 T 0.4825 - 19 F 0.4825 - 20 S 0.4879 - 21 D 0.5374 - 22 L 0.4600 - 23 W 0.3668 - 24 K 0.3456 - 25 L 0.4282 - 26 L 0.3578 - 27 P 0.3630 - 28 E 0.3399 - 29 N 0.3578 - 30 N 0.4116 - 31 V 0.3762 - 32 L 0.3668 - 33 S 0.4420 - 34 P 0.4749 - 35 L 0.4556 - 36 P 0.4458 - 37 S 0.5084 - 38 Q 0.5043 - 39 A 0.5043 - 40 M 0.5331 - 41 D 0.4781 - 42 D 0.5623 - 43 L 0.6604 - 44 M 0.5900 - 45 L 0.5084 - 46 S 0.5802 - 47 P 0.5802 - 48 D 0.6174 - 49 D 0.6124 - 50 I 0.6374 - 51 E 0.6827 - 52 Q 0.6906 - 53 W 0.7034 - 54 F 0.7418 - 55 T 0.7817 - 56 E 0.8311 - 57 D 0.8001 - 58 P 0.7912 - 59 G 0.7912 - 60 P 0.7540 - 61 D 0.7951 - 62 E 0.7817 - 63 A 0.7644 - 64 P 0.7912 - 65 R 0.8311 - 66 M 0.8311 - 67 P 0.7912 - 68 E 0.7688 - 69 A 0.7418 - 70 A 0.7232 - 71 P 0.7147 - 72 P 0.6906 - 73 V 0.6715 - 74 A 0.6681 - 75 P 0.6374 - 76 A 0.6516 - 77 P 0.6650 - 78 A 0.6604 - 79 A 0.6124 - 80 P 0.6334 - 81 T 0.6374 - 82 P 0.5514 - 83 A 0.5514 - 84 A 0.5412 - 85 P 0.5514 - 86 A 0.5374 - 87 P 0.5473 - 88 A 0.4825 - 89 P 0.5084 - 90 S 0.5126 - 91 W 0.5229 - 92 P 0.5126 - 93 L 0.5043 - 94 S 0.4379 - 95 S 0.4781 - 96 S 0.4600 - 97 V 0.4781 - 98 P 0.3806 - 99 S 0.4078 - 100 Q 0.3096 - 101 K 0.3263 - 102 T 0.3399 - 103 Y 0.3184 - 104 Q 0.2820 - 105 G 0.2167 - 106 S 0.2122 - 107 Y 0.2080 - 108 G 0.2558 - 109 F 0.2255 - 110 R 0.1921 - 111 L 0.1766 - 112 G 0.1732 - 113 F 0.1205 - 114 L 0.1732 - 115 H 0.0723 - 116 S 0.0701 - 117 G 0.0405 - 118 T 0.0643 - 119 A 0.0771 - 120 K 0.1018 - 121 S 0.0587 - 122 V 0.0884 - 123 T 0.0884 - 124 C 0.1240 - 125 T 0.1088 - 126 Y 0.0554 - 127 S 0.0607 - 128 P 0.0441 - 129 A 0.0387 - 130 L 0.0490 - 131 N 0.0478 - 132 K 0.0231 - 133 M 0.0414 - 134 F 0.0297 - 135 C 0.0701 - 136 Q 0.0502 - 137 L 0.0567 - 138 A 0.0405 - 139 K 0.0363 - 140 T 0.0464 - 141 C 0.0701 - 142 P 0.0832 - 143 V 0.0991 - 144 Q 0.1322 - 145 L 0.1998 - 146 W 0.3146 - 147 V 0.3146 - 148 D 0.3184 - 149 S 0.3578 - 150 T 0.3311 - 151 P 0.3184 - 152 P 0.4203 - 153 P 0.3578 - 154 G 0.3578 - 155 T 0.3578 - 156 R 0.4282 - 157 V 0.5084 - 158 R 0.5802 - 159 A 0.5667 - 160 M 0.5473 - 161 A 0.5514 - 162 I 0.5331 - 163 Y 0.4749 - 164 K 0.4037 - 165 Q 0.4116 - 166 S 0.4203 - 167 Q 0.3184 - 168 H 0.4037 - 169 M 0.4037 - 170 T 0.4282 - 171 E 0.4513 - 172 V 0.4749 - 173 V 0.4116 - 174 R 0.4825 - 175 R 0.4918 - 176 C 0.4879 - 177 P 0.4918 - 178 H 0.4825 - 179 H 0.4245 - 180 E 0.4333 - 181 R 0.4651 - 182 C 0.4879 - 183 S 0.5412 - 184 D 0.5802 - 185 S 0.5126 - 186 D 0.4458 - 187 G 0.5374 - 188 L 0.4600 - 189 A 0.4600 - 190 P 0.4600 - 191 P 0.4600 - 192 Q 0.3992 - 193 H 0.4879 - 194 L 0.4282 - 195 I 0.4333 - 196 R 0.3668 - 197 V 0.3005 - 198 E 0.3096 - 199 G 0.3847 - 200 N 0.3939 - 201 L 0.3630 - 202 R 0.3359 - 203 V 0.2292 - 204 E 0.2292 - 205 Y 0.2748 - 206 L 0.3399 - 207 D 0.2963 - 208 D 0.2963 - 209 R 0.2385 - 210 N 0.2531 - 211 T 0.1805 - 212 F 0.2531 - 213 R 0.2786 - 214 H 0.3456 - 215 S 0.3399 - 216 V 0.3491 - 217 V 0.4037 - 218 V 0.3885 - 219 P 0.3806 - 220 Y 0.2748 - 221 E 0.2700 - 222 P 0.2657 - 223 P 0.2963 - 224 E 0.2865 - 225 V 0.2167 - 226 G 0.2080 - 227 S 0.1844 - 228 D 0.2041 - 229 C 0.1602 - 230 T 0.1416 - 231 T 0.2041 - 232 I 0.1958 - 233 H 0.1018 - 234 Y 0.0744 - 235 N 0.0677 - 236 Y 0.0909 - 237 M 0.0789 - 238 C 0.0723 - 239 N 0.0660 - 240 S 0.1322 - 241 S 0.1532 - 242 C 0.1060 - 243 M 0.1018 - 244 G 0.1060 - 245 G 0.1150 - 246 M 0.0789 - 247 N 0.1266 - 248 R 0.0965 - 249 R 0.1732 - 250 P 0.1766 - 251 I 0.1766 - 252 L 0.1805 - 253 T 0.2820 - 254 I 0.3096 - 255 I 0.2602 - 256 T 0.2080 - 257 L 0.2333 - 258 E 0.2385 - 259 D 0.2385 - 260 S 0.2432 - 261 S 0.1602 - 262 G 0.2122 - 263 N 0.2385 - 264 L 0.2333 - 265 L 0.2558 - 266 G 0.2432 - 267 R 0.2292 - 268 N 0.2209 - 269 S 0.2483 - 270 F 0.2531 - 271 E 0.2432 - 272 V 0.2432 - 273 R 0.2432 - 274 V 0.2432 - 275 C 0.3053 - 276 A 0.3630 - 277 C 0.3578 - 278 P 0.3630 - 279 G 0.3668 - 280 R 0.3263 - 281 D 0.3992 - 282 R 0.4037 - 283 R 0.4556 - 284 T 0.4703 - 285 E 0.5173 - 286 E 0.6219 - 287 E 0.6412 - 288 N 0.7275 - 289 L 0.6984 - 290 R 0.6756 - 291 K 0.7079 - 292 K 0.7192 - 293 G 0.7342 - 294 E 0.7458 - 295 P 0.7501 - 296 H 0.7540 - 297 H 0.7605 - 298 E 0.7605 - 299 L 0.7342 - 300 P 0.7912 - 301 P 0.7951 - 302 G 0.8036 - 303 S 0.8074 - 304 T 0.8074 - 305 K 0.8118 - 306 R 0.7951 - 307 A 0.8118 - 308 L 0.8242 - 309 P 0.8488 - 310 N 0.8650 - 311 N 0.8488 - 312 T 0.8311 - 313 S 0.8424 - 314 S 0.7912 - 315 S 0.7951 - 316 P 0.8001 - 317 Q 0.8001 - 318 P 0.7458 - 319 K 0.7192 - 320 K 0.6984 - 321 K 0.6412 - 322 P 0.6516 - 323 L 0.5900 - 324 D 0.5802 - 325 G 0.5802 - 326 E 0.5762 - 327 Y 0.5623 - 328 F 0.5374 - 329 T 0.4556 - 330 L 0.4556 - 331 Q 0.4333 - 332 I 0.3762 - 333 R 0.3456 - 334 G 0.4037 - 335 R 0.3311 - 336 E 0.3263 - 337 R 0.3311 - 338 F 0.3717 - 339 E 0.3762 - 340 M 0.3717 - 341 F 0.3668 - 342 R 0.3491 - 343 E 0.4203 - 344 L 0.4037 - 345 N 0.4149 - 346 E 0.4037 - 347 A 0.3992 - 348 L 0.4078 - 349 E 0.4651 - 350 L 0.4967 - 351 K 0.5229 - 352 D 0.5802 - 353 A 0.5802 - 354 Q 0.5846 - 355 A 0.6293 - 356 G 0.6412 - 357 K 0.6374 - 358 E 0.6604 - 359 P 0.7317 - 360 G 0.7034 - 361 G 0.7573 - 362 S 0.7573 - 363 R 0.7573 - 364 A 0.7772 - 365 H 0.7605 - 366 S 0.8036 - 367 S 0.7951 - 368 H 0.7817 - 369 L 0.7869 - 370 K 0.7724 - 371 S 0.7869 - 372 K 0.7869 - 373 K 0.7951 - 374 G 0.7644 - 375 Q 0.7912 - 376 S 0.7275 - 377 T 0.7342 - 378 S 0.7275 - 379 R 0.6984 - 380 H 0.7342 - 381 K 0.7605 - 382 K 0.7418 - 383 L 0.7418 - 384 M 0.7275 - 385 F 0.7573 - 386 K 0.7724 - 387 T 0.8118 - 388 E 0.8521 - 389 G 0.8823 - 390 P 0.8984 - 391 D 0.9119 - 392 S 0.9316 - 393 D 0.9512 -# P53_HUMAN - 1 M 0.9854 - 2 E 0.9883 - 3 E 0.9711 - 4 P 0.9677 - 5 Q 0.9725 - 6 S 0.9777 - 7 D 0.9777 - 8 P 0.9396 - 9 S 0.9362 - 10 V 0.9503 - 11 E 0.9211 - 12 P 0.8741 - 13 P 0.8421 - 14 L 0.7547 - 15 S 0.6620 - 16 Q 0.6576 - 17 E 0.6906 - 18 T 0.6620 - 19 F 0.6427 - 20 S 0.5807 - 21 D 0.5707 - 22 L 0.5382 - 23 W 0.5342 - 24 K 0.4476 - 25 L 0.5296 - 26 L 0.5254 - 27 P 0.5211 - 28 E 0.4725 - 29 N 0.4330 - 30 N 0.5533 - 31 V 0.5854 - 32 L 0.4864 - 33 S 0.5139 - 34 P 0.5533 - 35 L 0.5577 - 36 P 0.6576 - 37 S 0.7547 - 38 Q 0.7595 - 39 A 0.6322 - 40 M 0.6531 - 41 D 0.6576 - 42 D 0.6043 - 43 L 0.5533 - 44 M 0.5665 - 45 L 0.5620 - 46 S 0.6755 - 47 P 0.6712 - 48 D 0.6906 - 49 D 0.6906 - 50 I 0.7459 - 51 E 0.8013 - 52 Q 0.7505 - 53 W 0.7459 - 54 F 0.8050 - 55 T 0.8013 - 56 E 0.8792 - 57 D 0.8966 - 58 P 0.8655 - 59 G 0.8198 - 60 P 0.8198 - 61 D 0.9013 - 62 E 0.8421 - 63 A 0.8013 - 64 P 0.9013 - 65 R 0.9415 - 66 M 0.9488 - 67 P 0.9269 - 68 E 0.9013 - 69 A 0.9013 - 70 A 0.8991 - 71 P 0.8991 - 72 P 0.8681 - 73 V 0.8313 - 74 A 0.8713 - 75 P 0.8313 - 76 A 0.8565 - 77 P 0.8655 - 78 A 0.8655 - 79 A 0.8462 - 80 P 0.7718 - 81 T 0.8162 - 82 P 0.7250 - 83 A 0.6948 - 84 A 0.7547 - 85 P 0.7718 - 86 A 0.6851 - 87 P 0.7369 - 88 A 0.7080 - 89 P 0.7505 - 90 S 0.7672 - 91 W 0.7459 - 92 P 0.6269 - 93 L 0.6183 - 94 S 0.6531 - 95 S 0.6712 - 96 S 0.5296 - 97 V 0.5577 - 98 P 0.4292 - 99 S 0.4476 - 100 Q 0.3667 - 101 K 0.3740 - 102 T 0.3704 - 103 Y 0.2884 - 104 Q 0.3392 - 105 G 0.3392 - 106 S 0.3460 - 107 Y 0.3529 - 108 G 0.3807 - 109 F 0.3566 - 110 R 0.3566 - 111 L 0.2884 - 112 G 0.2988 - 113 F 0.2064 - 114 L 0.2988 - 115 H 0.2002 - 116 S 0.1942 - 117 G 0.2129 - 118 T 0.2817 - 119 A 0.2164 - 120 K 0.3182 - 121 S 0.3149 - 122 V 0.3460 - 123 T 0.2503 - 124 C 0.2470 - 125 T 0.3215 - 126 Y 0.2645 - 127 S 0.2470 - 128 P 0.2364 - 129 A 0.2364 - 130 L 0.1643 - 131 N 0.1823 - 132 K 0.1449 - 133 M 0.2002 - 134 F 0.1476 - 135 C 0.1476 - 136 Q 0.1115 - 137 L 0.1881 - 138 A 0.1881 - 139 K 0.1731 - 140 T 0.2034 - 141 C 0.2817 - 142 P 0.2884 - 143 V 0.2951 - 144 Q 0.3286 - 145 L 0.4220 - 146 W 0.4685 - 147 V 0.4582 - 148 D 0.4979 - 149 S 0.4864 - 150 T 0.4685 - 151 P 0.3948 - 152 P 0.4119 - 153 P 0.3910 - 154 G 0.4507 - 155 T 0.4292 - 156 R 0.5017 - 157 V 0.6089 - 158 R 0.6269 - 159 A 0.6089 - 160 M 0.6322 - 161 A 0.5620 - 162 I 0.4831 - 163 Y 0.4685 - 164 K 0.4541 - 165 Q 0.3356 - 166 S 0.3494 - 167 Q 0.3426 - 168 H 0.3840 - 169 M 0.3910 - 170 T 0.4186 - 171 E 0.3286 - 172 V 0.3460 - 173 V 0.4220 - 174 R 0.5098 - 175 R 0.5176 - 176 C 0.5017 - 177 P 0.4409 - 178 H 0.4051 - 179 H 0.4256 - 180 E 0.4801 - 181 R 0.4831 - 182 C 0.4652 - 183 S 0.4541 - 184 D 0.4409 - 185 S 0.4369 - 186 D 0.3840 - 187 G 0.5139 - 188 L 0.4901 - 189 A 0.5017 - 190 P 0.4409 - 191 P 0.4292 - 192 Q 0.3774 - 193 H 0.5139 - 194 L 0.4369 - 195 I 0.3667 - 196 R 0.3774 - 197 V 0.3740 - 198 E 0.3774 - 199 G 0.4476 - 200 N 0.4766 - 201 L 0.3667 - 202 R 0.3460 - 203 V 0.3426 - 204 E 0.3426 - 205 Y 0.3599 - 206 L 0.3840 - 207 D 0.3392 - 208 D 0.4051 - 209 R 0.3249 - 210 N 0.3356 - 211 T 0.3494 - 212 F 0.4292 - 213 R 0.4369 - 214 H 0.4409 - 215 S 0.4330 - 216 V 0.5139 - 217 V 0.5992 - 218 V 0.4619 - 219 P 0.4582 - 220 Y 0.4619 - 221 E 0.3910 - 222 P 0.3910 - 223 P 0.4087 - 224 E 0.4119 - 225 V 0.3426 - 226 G 0.3286 - 227 S 0.2680 - 228 D 0.3149 - 229 C 0.3566 - 230 T 0.3392 - 231 T 0.3117 - 232 I 0.2849 - 233 H 0.2680 - 234 Y 0.2503 - 235 N 0.2258 - 236 Y 0.2783 - 237 M 0.2752 - 238 C 0.2752 - 239 N 0.2884 - 240 S 0.3426 - 241 S 0.2849 - 242 C 0.2849 - 243 M 0.2884 - 244 G 0.2258 - 245 G 0.3019 - 246 M 0.2364 - 247 N 0.3149 - 248 R 0.3356 - 249 R 0.4441 - 250 P 0.4369 - 251 I 0.4369 - 252 L 0.4441 - 253 T 0.4940 - 254 I 0.4619 - 255 I 0.4619 - 256 T 0.4582 - 257 L 0.4831 - 258 E 0.4766 - 259 D 0.3948 - 260 S 0.4017 - 261 S 0.3356 - 262 G 0.3948 - 263 N 0.4087 - 264 L 0.2988 - 265 L 0.3426 - 266 G 0.3053 - 267 R 0.3249 - 268 N 0.3840 - 269 S 0.3774 - 270 F 0.3774 - 271 E 0.3774 - 272 V 0.3774 - 273 R 0.3807 - 274 V 0.3807 - 275 C 0.4369 - 276 A 0.4979 - 277 C 0.5055 - 278 P 0.4541 - 279 G 0.4476 - 280 R 0.4441 - 281 D 0.5296 - 282 R 0.5211 - 283 R 0.5807 - 284 T 0.6183 - 285 E 0.6851 - 286 E 0.8162 - 287 E 0.8375 - 288 N 0.8828 - 289 L 0.8828 - 290 R 0.8991 - 291 K 0.8991 - 292 K 0.8942 - 293 G 0.8966 - 294 E 0.8942 - 295 P 0.8920 - 296 H 0.8765 - 297 H 0.8235 - 298 E 0.8421 - 299 L 0.8421 - 300 P 0.8942 - 301 P 0.8942 - 302 G 0.8966 - 303 S 0.8991 - 304 T 0.8966 - 305 K 0.9081 - 306 R 0.9013 - 307 A 0.9126 - 308 L 0.9057 - 309 P 0.8991 - 310 N 0.9287 - 311 N 0.9308 - 312 T 0.8828 - 313 S 0.8853 - 314 S 0.8853 - 315 S 0.8872 - 316 P 0.8313 - 317 Q 0.7459 - 318 P 0.7672 - 319 K 0.7672 - 320 K 0.7547 - 321 K 0.6806 - 322 P 0.6712 - 323 L 0.6661 - 324 D 0.6755 - 325 G 0.6806 - 326 E 0.6906 - 327 Y 0.5577 - 328 F 0.5456 - 329 T 0.5098 - 330 L 0.4369 - 331 Q 0.4441 - 332 I 0.4541 - 333 R 0.3807 - 334 G 0.4409 - 335 R 0.4409 - 336 E 0.4292 - 337 R 0.3740 - 338 F 0.4476 - 339 E 0.4725 - 340 M 0.4685 - 341 F 0.5254 - 342 R 0.4940 - 343 E 0.5758 - 344 L 0.5620 - 345 N 0.5665 - 346 E 0.5620 - 347 A 0.5577 - 348 L 0.5901 - 349 E 0.6991 - 350 L 0.6991 - 351 K 0.7080 - 352 D 0.7951 - 353 A 0.7799 - 354 Q 0.7916 - 355 A 0.8421 - 356 G 0.8313 - 357 K 0.8421 - 358 E 0.8125 - 359 P 0.8596 - 360 G 0.8565 - 361 G 0.8920 - 362 S 0.8920 - 363 R 0.8942 - 364 A 0.9151 - 365 H 0.9057 - 366 S 0.9151 - 367 S 0.9126 - 368 H 0.9151 - 369 L 0.9230 - 370 K 0.9039 - 371 S 0.8991 - 372 K 0.8681 - 373 K 0.8681 - 374 G 0.7982 - 375 Q 0.8085 - 376 S 0.7951 - 377 T 0.7982 - 378 S 0.8050 - 379 R 0.8198 - 380 H 0.8655 - 381 K 0.8681 - 382 K 0.8713 - 383 L 0.8655 - 384 M 0.8655 - 385 F 0.8596 - 386 K 0.8343 - 387 T 0.8313 - 388 E 0.8235 - 389 G 0.8162 - 390 P 0.8085 - 391 D 0.7755 - 392 S 0.7718 - 393 D 0.7629