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authorJim Procter <jprocter@compbio.dundee.ac.uk>
Mon, 1 Jul 2013 12:55:55 +0000 (13:55 +0100)
committerJim Procter <jprocter@compbio.dundee.ac.uk>
Mon, 1 Jul 2013 12:55:55 +0000 (13:55 +0100)
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website/man_configuration.html
website/man_dev.html
website/man_server_dev.html
website/man_servervm.html
website/man_serverwar.html
website/man_stats.html
website/manual_qs_amazon.html
website/manual_qs_client.html
website/manual_qs_va.html
website/manual_qs_war.html
website/quick_start.html

index fd1b8b8..a238e47 100644 (file)
@@ -51,7 +51,7 @@
 <!--body end -->\r
 </div>\r
 \r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div> <!-- wrapper end-->\r
 \r
 \r
index 4ac519d..53395fc 100644 (file)
@@ -110,7 +110,7 @@ Several testing groups are supported:
 <p class="code">http://www.compbio.ac.uk:8080/ws</p>\r
 <p>JABAWS are the standard JAX-WS web services, which are WS-I basic profile compatible. </p>\r
 </div><!-- content end--> \r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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index 3ab892d..d60e5c5 100644 (file)
@@ -159,7 +159,7 @@ is the Java tool for creating web service bindings; but in addition, offers some
 working with JABAWS. For more information please refer to the <a href="dm_javadoc/index.html">data model javadoc</a>.\r
 </p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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index 15fdd88..822ec3b 100644 (file)
@@ -68,7 +68,7 @@
 <p>Alternatively you can use JABAWS on the <a href="http://docs.amazonwebservices.com/elasticbeanstalk/latest/dg/index.html?GettingStarted.html">Amazon Elastic BeanStalk</a>. You may want to use this option to deploy JABAWS in the cluster configuration.</p>\r
 </div><!-- end of jabaws_on_cloud div -->\r
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-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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index 637996e..004da8b 100644 (file)
@@ -71,7 +71,7 @@
 <p>&nbsp;</p>\r
 </div><!-- end of jabaws_on_cloud div -->\r
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-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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index 1ab14c1..8313b9b 100644 (file)
@@ -84,7 +84,7 @@
 <p>&nbsp;</p>\r
 </div><!-- end of jabaws_on_cloud div -->\r
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-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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index 66550b0..6639ef2 100644 (file)
@@ -91,7 +91,7 @@ Please note that -r and -f options cannot be used together. Alignment is done wi
     <span class="code"> java -jar jabaws-min-client.jar -h=http://myhost.compbio.ac.uk:8080/jabaws -s=MafftWS -parameters</span></p>\r
 <p>The same client can be used to access JABAWS on different hosts. Just point the client to the host you want to use by changing the value of -h key. For example you used <span class="hightlight">-h=http://myhost.compbio.ac.uk:8080/jabaws</span> server, now you want to use another server to <span class="hightlight">-h=http://mylabserver.myuni.edu.</span> This comes handy if your favorite server is off and you need to do the job yesterday. </p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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index 2ce17a8..d60ecb8 100644 (file)
@@ -413,7 +413,7 @@ class="hightlight">log4j.properties</span> and uncomment section of
 <p> Google Analytics can be disabled or adjusted by removing/editing <span class="hightlight">conf/GA.properties</span> Google Analytics (GA) settings file. We would appreciate it greatly if you could leave it on!</p>\r
 <p>All calls to GA are very lightweight, completed asynchronously, create very little overhead and do not influence the server response time or performance.</p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
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index 2c41932..bdd050c 100644 (file)
@@ -352,7 +352,7 @@ For a more detailed description of all available types and their functions pleas
 <p>JABAWS are the standard <a href="http://jax-ws.java.net/">JAX-WS</a> SOAP web services, which are <a href="http://www.ws-i.org/">WS-I</a> basic   profile compatible. This means that you could use whatever tool your language has to work with web services. Below is how you can generate portable artifacts to work with JABAWS from Java. However,  if programming in Java we recommend using our  client library as it provides a handful of useful methods in addition to plain data types. </p>\r
 <p class="code">wsimport -keep http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws/ClustalWS?wsdl</p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
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 \r
index 993589c..f5ef11b 100644 (file)
@@ -210,7 +210,7 @@ Several testing groups are supported:
 </ol>\r
 <p>&nbsp;</p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div> <!-- page end-->\r
 \r
index 4c6d349..b96a9c1 100644 (file)
@@ -142,7 +142,7 @@ but for most production environments, the JABAWS WAR distribution will be  easie
 <h3><a name="vmiaccess" id="vmiaccess"/></a></a>VM Network Settings </h3>\r
 <p>By default the JABAWS VM is configured to use host-only networking. This means that the host can communicate with the VM via a network, but no other machines can. Similarly, the VM cannot communicate with any other computers apart from the host. If you want to connect to the Internet from the VM, configure your VM to use NAT network. However, you will not be able to connect to the VM from the host in such case. If you want to be able to connect to your VM and let VM connect to the internet at the same time you would have to use a Bridged network. In such a case you would have to configure the VM IP address manually (unless of course your network has a DHCP server to do that)</a></p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index 11fb7e7..4445f07 100644 (file)
@@ -236,7 +236,7 @@ modify the paths in <span class=
   <li>If Tomcat still refuses to unpack the war file, unpack it manually into web application folder (the war file is just a zip archive). Restart the Tomcat.</li>\r
 </ul>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index 356ce90..5574c60 100644 (file)
@@ -148,7 +148,7 @@ Each table contains the following information for each web service
 <p><br>\r
 </p>\r
 </div><!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div><!-- page end-->\r
 \r
index 04d7fb5..c7e008f 100644 (file)
@@ -71,7 +71,7 @@
 </ol>\r
 </div><!-- about end-->\r
 </div><!-- content end--> \r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div> <!-- page end-->\r
 \r
index 67ff7e5..0a977ca 100644 (file)
@@ -82,7 +82,7 @@
 </p>\r
 </div><!-- about end-->\r
 </div><!-- content end--> \r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div> <!-- page end-->\r
 \r
index 33a892f..64709c3 100644 (file)
@@ -88,7 +88,7 @@
 </div>\r
 </div><!-- about end-->\r
 </div><!-- content end--> \r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
 </div> <!-- page end-->\r
 \r
index d836ce0..7e4b74d 100644 (file)
@@ -99,7 +99,7 @@
 \r
 <!--  TODO put JABAWS CMD test instructions here -->\r
 </div> <!-- content end-->\r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end -->\r
 \r
 \r
index 2dc5cf2..8a4ecc1 100644 (file)
@@ -59,7 +59,7 @@
 </tr>\r
 </table>\r
 </div><!-- content end--> \r
-<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
+<div id="copyright">Last update: 28 June 2013<br/>Sasha Sherstnev, Peter Troshin, Jim Procter and Geoff Barton, The Barton Group, University of Dundee, UK</div>\r
 </div><!-- wrapper end-->\r
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