From: cmzmasek@gmail.com Date: Tue, 8 Apr 2014 02:32:11 +0000 (+0000) Subject: inprogress X-Git-Url: http://source.jalview.org/gitweb/?a=commitdiff_plain;h=532ef0e3c3770d2b414c6237376239fd282cb471;p=jalview.git inprogress --- diff --git a/forester/test_data/S15613.nex b/forester/test_data/S15613.nex new file mode 100644 index 0000000..2813c74 --- /dev/null +++ b/forester/test_data/S15613.nex @@ -0,0 +1,588 @@ +#NEXUS + +[!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. + + +Generated on April 07, 2014; 19:45 GMT + +TreeBASE (cc) 1994-2008 + +Study reference: +Sevcik J., Kasprak D., Mantic M., Sevcikova T., & Tothova A. 2014. Molecular phylogeny +of the fungus gnat family Diadocidiidae and its position within the infraorder +Bibionomorpha (Diptera). Zoologica Scripta, . + +TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S15613] + +BEGIN TAXA; + TITLE Taxa1; + DIMENSIONS NTAX=48; + TAXLABELS + Arachnocampa_flava + Asiorrhina_parasiatica + Bibio_marci + Bibio_xanthopus + Bolitophila_cinerea_ + Bolitophila_hybrida + Bolitophila_occlusa + Bolitophila_sp. + Bradysia_amoena + Bradysia_distincta + Chiasmoneura_anthracina + Coboldia_fuscipes + Coboldia_sp. + Cramptonomyia_spenceri + Cratyna_nobilis + Diadocidia_ferruginosa + Diadocidia_globosa + Diadocidia_hybrida_ + Diadocidia_spinosula + Diadocidia_trispinosa_ + Diadocidia_valida + Ditomyia_fasciata_ + Dolichosciara_flavipes + Exechia_seriata + Keroplatus_testaceus + Lestremia_sp. + Lestremiinae_gen._sp. + Lygistorrhina_sanctaecatherinae + Lygistorrhina_sp. + Macrocera_sp. + Matileola_sp + Mikiola_fagi + Mycetophila_alea + Mycomya_circumdata + Neoempheria_winnertzi + Nepaletricha_sp. + Novakia_scatopsiformis + Oligotrophini_gen._sp. + Plecia_sp. + Plecia_sp._OUT2 + Rutylapa_ruficornis_ + Scatopse_notata + Sciara_humeralis + Sciophila_thoracica + Sylvicola_fenestralis + Symmerus_annulatus + Symmerus_nobilis + Trichosia_edwardsi + ; +END; + +BEGIN TAXA; + TITLE Taxa2; + DIMENSIONS NTAX=47; + TAXLABELS + Arachnocampa_flava + Asiorrhina_parasiatica + Bibio_marci + Bibio_xanthopus + Bolitophila_cinerea_ + Bolitophila_hybrida + Bolitophila_occlusa + Bolitophila_sp. + Bradysia_amoena + Bradysia_distincta + Chiasmoneura_anthracina + Coboldia_fuscipes + Coboldia_sp. + Cramptonomyia_spenceri + Cratyna_nobilis + Diadocidia_ferruginosa + Diadocidia_globosa + Diadocidia_hybrida_ + Diadocidia_spinosula + Diadocidia_trispinosa_ + Diadocidia_valida + Ditomyia_fasciata_ + Dolichosciara_flavipes + Exechia_seriata + Keroplatus_testaceus + Lestremia_sp. + Lestremiinae_gen._sp. + Lygistorrhina_sanctaecatherinae + Lygistorrhina_sp. + Macrocera_sp. + Matileola_sp. + Mikiola_fagi + Mycetophila_alea + Mycomya_circumdata + Neoempheria_winnertzi + Novakia_scatopsiformis + Oligotrophini_gen._sp. + Plecia_sp. + Plecia_sp._OUT2 + Rutylapa_ruficornis_ + Scatopse_notata + Sciara_humeralis + Sciophila_thoracica + Sylvicola_fenestralis + Symmerus_annulatus + Symmerus_nobilis + Trichosia_edwardsi + ; +END; + +BEGIN TAXA; + TITLE Taxa3; + DIMENSIONS NTAX=18; + TAXLABELS + Diadicidia_fissa + Diadocidia_borealis_ + Diadocidia_bruneicola + Diadocidia_cizeki_ + Diadocidia_ferruginosa + Diadocidia_globosa + Diadocidia_hybrida_ + Diadocidia_queenslandensis + Diadocidia_sp._SJ18 + Diadocidia_sp._SJ20 + Diadocidia_sp._SJ9 + Diadocidia_spinosula + Diadocidia_stanfordensis + Diadocidia_trispinosa_ + Diadocidia_valida + Mycetophila_alea + Mycomya_circumdata + Sciophila_thoracica + ; +END; + +BEGIN CHARACTERS; +[! 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+Cratyna_nobilis 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+Diadocidia_hybrida_ 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+Diadocidia_spinosula 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+Diadocidia_trispinosa_ 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+Diadocidia_valida 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+Ditomyia_fasciata_ 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+Dolichosciara_flavipes 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+Exechia_seriata 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+Keroplatus_testaceus 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+Lestremia_sp. 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+Macrocera_sp. ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTATAAAAAAACTATGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTAAATTTTTAATCTATATAATAGGATCAAATATTCAATAATTTTTGTAAATTTATATAAAAGTTTTTTAAATTTTATTATCTCCCCAATAAAATAATTTATTTTTAAACTATATTATTATTAATTAAATATAAAATTAAAAAATTATTAAACTCTATAGGGGCTTCTCGTCCTCTAATTAAATTTTAGCTTTTTAACTAAAAAATAAAATTTTAA-AAATTTTTTATGAGACAGGGAATGTTTCATTCAACCCTTC-TACAAGCTTTCTTTTAAAAAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? +Matileola_sp. 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+Mikiola_fagi 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+Trichosia_edwardsi 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+Mycomya_circumdata 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+Bolitophila_occlusa 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+Dolichosciara_flavipes 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+Exechia_seriata 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+Keroplatus_testaceus 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+Lestremia_sp. 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+Lygistorrhina_sanctaecatherinae 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+Lygistorrhina_sp. 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+Macrocera_sp. 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+Matileola_sp 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+Mikiola_fagi TTATTTTAGATATAATAATTTTTATTAATAATTAA-----TAATAAAAATTAATAAATTTGGCAGTATTTT-TTAAAATTAGAGGATTATGTTATGTAATAGATAATACACTATAAAATATATTTAATTTATATTTATTGTATATCGTTGTTTTAAATTAATTTTTGAAAAT-----ATTAATAAAAATTTTAAAAAAAAATAAATCAAATCAACATACATATTATAATTAAAATAATGTAATACATTTATTTGAATTTAATGGATTAATTTTTTAAAAAATTTAATAAAATTGGATTTAAAAGTAAAAATATATTATTTTTGAATTATATTAAAAATATGTATAAGAATTATTAAAAATATGAACTTATTAATAAAATTATGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTAATTTTTTAATCAATAAAATAAGATCAAATAAACATAAATTAATGATTTTTAAATAAAAAGTTAAATAAATTTAATTATCTCCCCAACAAAATAATTTTAATTATATA--ATAAATTTTTAACAATAATATTTAAAATAATTTTATAAAATTCTATAGGGTCTTCTCGTCCCTTTTTTTGATTTCAGCTTTTTAACTAAAATATAAAATTCAAA--TTTTTAAATTAAAAAAGACTTTATCTCATTAAACCATTCATTCCAGATTTCAATTAAAAATAAACCGCTTAGGGGTTAAGCCCGATGAACCCGAATATCTGATGTGAGAAATTCAATACAGTTTCTGATTTTGGATTTGTATAGTATGCACTTTTCTCAGTAAGACATTGTAATCCATTGATATGATGATTTAACATACGGACAAATGTTATGATTATTCTATCAGTGATATGTCATATGAATAAAATTTTTGTACCTGTTTAAATAGTCGATGGATTTTATCATGCTTTTGCGTTTCGTATCATTAATTTTTTTGGTGATAGCAGAAATGCATGTATTCGATTAACAATGCGATAGATTTGGGATGCCTTCGGGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATATGTGCAAGTCATTGAGTATTTTGTTGAAACTTAATGGCGTAATTAAAATGACTATATTTTGGGATCACAAGTAATGTTATGCATTATTTTTCAATCCCGGGGCGTTCCGAACATGATGTAAGCAATTAGTCCTCTGTTCAAGAGCGCACCTTGAGCACATATGCTGT +Mycetophila_alea 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+Mycomya_circumdata 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+Neoempheria_winnertzi 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+Nepaletricha_sp. 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+Novakia_scatopsiformis 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+Oligotrophini_gen._sp. 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+Plecia_sp. 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+Plecia_sp._OUT2 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+Rutylapa_ruficornis_ TTATTAAAAAAAAAAAAAATTTGAGTAGTAATAGTTATTTTCTTGAAACTTAAAAAATTTGGCGGTATTTTAATCTATTCAGAGGAACTTGTTTTATAATTGATGATCCTCATTTTATCTTACTTAATTTTTTTAATTTGTATATCGTTGTCATAAGAAAATCTTAAAAAAGAAAAATTTTCTAATTTAATTAATATTTTATATGTCAGATCAAGGTGCAGTTTATAATTAAGTAAATGAGTTACAATTAATAATATTAATTGAATAATAAATTTAAAATTTTATTTGAAGGAGGATTTGATAGTAATAGAAAATAATTTTGATTATAGCTCTAAAATATGCGCAATCTTTTTTATAAATATGAACTTAAAAAAAAAATAACGCTGTTATCCCTAAAGTAATTTAAATTTTTAATCAAAAAAAATGGATCATAAATTCATTAATCTATGTATAAAATAATAAAAGTTTATTAAATTTTATTGTCGCCCCAACAAAATAATTATTTAATATAAATTATTATAATTCTTTATTAATTAATAATAATAATTATAAAACTTTATAGGGTCTTCTCGTCCTTTAATTATATTTTAGCTTTTTAACTAAAAAATAAAATTTTATTTAATTTTATTTGAAACAGTTTATATTTCATTCAACCATTCATACAAGTTTTCAATTAAAAAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTTAATTGGTATGCACTTTTCTCAGTAAGACATTGCAATCCATTAGTAT----ATTTATCAAACGGCCCTTTGTATTGTTTATTCTAGCTGTAATATATTATATGAATAATGCAACGGTGACCTGATAAATAACTGATGGAGTTTATCATGCTTTGTAATTACGATTTATAAGTAATA--TATAAATGCAGTAATGCATGTATTTGATTAGCAATGCGATAGATTTGGGATACCTTCGGGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGAAGTCTAACATGTGTGCAAGTCATTGGGTATAT--TTGAAACCTAAAGGCGCAATTAAAATAACTAT---ATGGGATTACAAGTAAATATATAAGTTACTTCTCCATCCCGGGGCGTTCTGAACATG???????????????????????????????????????????????????? +Scatopse_notata TTTAAATGTAAATTTTATATTATGGTAGTATTAGTTATATTCTTCAAACTAAAAAATTTTGGCGGTATTTTAGTCTTTTCAGAGGAACCTGTTCTATAATTGATAGTCCACATTTTATCTTACTTAATTTATTCAGTTTGTATATCGTCGTCATCAGAATATCTTAATTAAGAATAATTTTCTAAAATTTTTATTAAAAATAATGTCAGATCAAGGTGCAGCTTATAATTAAGCAAATGGGTTACAATAAATTTATTTATATGGATTAGAATATGAAATTATTTTATTAAAGTGGATTTGAAAGTAAAATAATATTTAATTGATTATAGCTCTAAAATATGCGCAATCATTTTTATCGATTAGAACTCTCTAAAAATATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTAAATTATTAATCAATATTAATGGATCAAATATACAAAAATCATTGATTTAAAATATAATAGTTATTTAAATATTACTATCACCCCAATAAAATAATTTTTTATATTATACTTAAATTAATCTTTATAAATTTAATATTAAAATTATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTAAATTTAATTTTAGCTTTTTTACTAAAATATTAATTTCAAAAAAATTTTTATTGAAACAGTTAATTTCTCATTCAACCATTCATACGAGCCTTCAATTAAAAGAAAACCATTTAGGGGTTAAGCCCGATGAACCCGAATATCTGAAATGAGAAATTCAATATTATTTATAGCATATAATATAAATAGTGTGCACTTTTCTCAGTAAGACATTGCAATCCATTAGTTTTATTATTTATCATAAGGCCATTTGTATTGTTCATTATTTTATATATATTATGTATGGATAATAAATTTGTGACCAGATAAATAGCTGATGGTGTTTATCATATATGTGTAACACATTTATATGTATTTTATGTATATTGTAGTGTTATATGTATTTGATTGGCAATGCGTTTGATTTGGGATACCTTCGGGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGTGCGCAAGTCATTAGG---ATATTTAAAACCTAAGGGCATAATTAACGTAACTGTATTATGGGATTACAAATAATTTAAAAAATTATTTTTTCATCTCAGGGCGTTTTGAACATGTTTGGCATTTTTAGACCTCTGTTCAAAAGCGTACCTTGAGCGTACATGCTGT +Sciara_humeralis 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+Sciophila_thoracica 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+Sylvicola_fenestralis 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+Symmerus_annulatus 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+Symmerus_nobilis 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+Trichosia_edwardsi 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+; +END; + +BEGIN TREES; + TITLE Family_Diadocidiidae_MLT; + LINK TAXA = Taxa3; + TRANSLATE + 1 Mycetophila_alea, + 2 Mycomya_circumdata, + 3 Sciophila_thoracica, + 4 Diadocidia_ferruginosa, + 5 Diadocidia_hybrida_, + 6 Diadocidia_queenslandensis, + 7 Diadocidia_borealis_, + 8 Diadocidia_stanfordensis, + 9 Diadocidia_cizeki_, + 10 Diadocidia_bruneicola, + 11 Diadocidia_globosa, + 12 Diadocidia_sp._SJ18, + 13 Diadicidia_fissa, + 14 Diadocidia_sp._SJ20, + 15 Diadocidia_valida, + 16 Diadocidia_trispinosa_, + 17 Diadocidia_spinosula, + 18 Diadocidia_sp._SJ9; + TREE Imported_tree_0 = [&R] (((((17:0.48039661496919533,4:0.5277066725142551)99:0.11387210280054613,(9:0.417385622521944,((14:0.16921918121315574,12:0.16112328009253227)62:0.07359541664746626,10:0.5221442900752924)91:0.07879116673942362)100:0.2957105418996293)100:0.29205762994621826,((5:0.32884393433374687,13:0.490020417603451)96:0.3411872220130145,(16:0.18462031920373298,7:0.09588586218902741)100:0.43037963877540325)34:0.08672855182273365)11:0.052247906565250295,(15:0.4659065316010573,8:0.3959796191512233)64:0.08016697370277737)35:0.046155235758028164,((18:0.3780965861638973,11:0.3683653029806064)100:1.0427640913124412,(3:0.8520803009140692,(1:1.0691559991923614,2:1.2818387081034353)100:0.34977258223141655)100:0.8758928229108802)62:0.25652990192347697,6:0.6716176196878193); + + + +END; +BEGIN TREES; + TITLE Family_Diadocidiidae_BAT; + LINK TAXA = Taxa3; + TRANSLATE + 1 Mycetophila_alea, + 2 Mycomya_circumdata, + 3 Sciophila_thoracica, + 4 Diadocidia_ferruginosa, + 5 Diadocidia_hybrida_, + 6 Diadocidia_queenslandensis, + 7 Diadocidia_borealis_, + 8 Diadocidia_stanfordensis, + 9 Diadocidia_cizeki_, + 10 Diadocidia_bruneicola, + 11 Diadocidia_globosa, + 12 Diadocidia_sp._SJ18, + 13 Diadicidia_fissa, + 14 Diadocidia_sp._SJ20, + 15 Diadocidia_valida, + 16 Diadocidia_trispinosa_, + 17 Diadocidia_spinosula, + 18 Diadocidia_sp._SJ9; + TREE con_50_majrule = [&R] (3:0.310669,(1:0.406847,2:0.473432)1.00:0.131497,((((((4:0.184003,17:0.181118)1.00:0.044195,(9:0.151184,(10:0.18953,(12:0.058777,14:0.060811)0.59:0.024106)1.00:0.033324)1.00:0.114372)1.00:0.10959,((5:0.125848,13:0.174225)1.00:0.122438,(7:0.03394,16:0.078191)1.00:0.150136)0.58:0.030113)0.51:0.023783,(8:0.133759,15:0.164463)0.80:0.030541)0.51:0.025509,6:0.240687)0.98:0.105569,(11:0.12698,18:0.139136)1.00:0.366112)1.00:0.324626); + TREE con_50_majrule = [&R] (3:0.310669,(1:0.406847,2:0.473432):0.131497,((((((4:0.184003,17:0.181118):0.044195,(9:0.151184,(10:0.18953,(12:0.058777,14:0.060811):0.024106):0.033324):0.114372):0.10959,((5:0.125848,13:0.174225):0.122438,(7:0.03394,16:0.078191):0.150136):0.030113):0.023783,(8:0.133759,15:0.164463):0.030541):0.025509,6:0.240687):0.105569,(11:0.12698,18:0.139136):0.366112):0.324626); + + + +END; +BEGIN TREES; + TITLE BI_with_Nepaletricha; + LINK TAXA = Taxa1; + TRANSLATE + 1 Bolitophila_cinerea_, + 2 Neoempheria_winnertzi, + 3 Mycetophila_alea, + 4 Exechia_seriata, + 5 Bolitophila_occlusa, + 6 Symmerus_nobilis, + 7 Asiorrhina_parasiatica, + 8 Matileola_sp, + 9 Chiasmoneura_anthracina, + 10 Keroplatus_testaceus, + 11 Rutylapa_ruficornis_, + 12 Mycomya_circumdata, + 13 Novakia_scatopsiformis, + 14 Bibio_marci, + 15 Plecia_sp._OUT2, + 16 Scatopse_notata, + 17 Coboldia_fuscipes, + 18 Lestremia_sp., + 19 Oligotrophini_gen._sp., + 20 Mikiola_fagi, + 21 Dolichosciara_flavipes, + 22 Bradysia_distincta, + 23 Sciophila_thoracica, + 24 Diadocidia_ferruginosa, + 25 Diadocidia_hybrida_, + 26 Diadocidia_globosa, + 27 Ditomyia_fasciata_, + 28 Diadocidia_valida, + 29 Diadocidia_trispinosa_, + 30 Diadocidia_spinosula, + 31 Arachnocampa_flava, + 32 Bibio_xanthopus, + 33 Bolitophila_hybrida, + 34 Bolitophila_sp., + 35 Coboldia_sp., + 36 Cratyna_nobilis, + 37 Cramptonomyia_spenceri, + 38 Lestremiinae_gen._sp., + 39 Lygistorrhina_sanctaecatherinae, + 40 Lygistorrhina_sp., + 41 Macrocera_sp., + 42 Plecia_sp., + 43 Sciara_humeralis, + 44 Sylvicola_fenestralis, + 45 Symmerus_annulatus, + 46 Trichosia_edwardsi, + 47 Bradysia_amoena, + 48 Nepaletricha_sp.; + TREE con_50_majrule = [&R] 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+ + + +END; +BEGIN TREES; + TITLE BI_without_Nepaletricha; + LINK TAXA = Taxa2; + TRANSLATE + 1 Bolitophila_cinerea_, + 2 Neoempheria_winnertzi, + 3 Mycetophila_alea, + 4 Exechia_seriata, + 5 Bolitophila_occlusa, + 6 Symmerus_nobilis, + 7 Asiorrhina_parasiatica, + 8 Matileola_sp., + 9 Chiasmoneura_anthracina, + 10 Keroplatus_testaceus, + 11 Rutylapa_ruficornis_, + 12 Mycomya_circumdata, + 13 Novakia_scatopsiformis, + 14 Bibio_marci, + 15 Plecia_sp._OUT2, + 16 Scatopse_notata, + 17 Coboldia_fuscipes, + 18 Lestremia_sp., + 19 Oligotrophini_gen._sp., + 20 Mikiola_fagi, + 21 Dolichosciara_flavipes, + 22 Bradysia_distincta, + 23 Sciophila_thoracica, + 24 Diadocidia_ferruginosa, + 25 Diadocidia_hybrida_, + 26 Diadocidia_globosa, + 27 Ditomyia_fasciata_, + 28 Diadocidia_valida, + 29 Diadocidia_trispinosa_, + 30 Diadocidia_spinosula, + 31 Arachnocampa_flava, + 32 Bibio_xanthopus, + 33 Bolitophila_hybrida, + 34 Bolitophila_sp., + 35 Coboldia_sp., + 36 Cratyna_nobilis, + 37 Cramptonomyia_spenceri, + 38 Lestremiinae_gen._sp., + 39 Lygistorrhina_sanctaecatherinae, + 40 Lygistorrhina_sp., + 41 Macrocera_sp., + 42 Plecia_sp., + 43 Sciara_humeralis, + 44 Sylvicola_fenestralis, + 45 Symmerus_annulatus, + 46 Trichosia_edwardsi, + 47 Bradysia_amoena; + TREE con_50_majrule = [&R] (44:0.297765,((((14:0.042304,32:0.035691)1.00:0.260477,(15:0.174438,42:0.063045)1.00:0.197717)0.97:0.039742,37:0.11881)1.00:0.048442,(((((18:0.189186,((19:0.066249,20:0.084149)1.00:0.124636,38:0.019229)1.00:0.256912)1.00:0.384594,(9:0.089172,41:0.254491)0.99:0.163051)0.73:0.039541,(((6:0.053786,45:0.061399)1.00:0.142211,27:0.257155)1.00:0.214838,(7:0.212373,(8:0.13502,(39:0.069081,40:0.090937)0.61:0.058315)1.00:0.140473)1.00:0.103892)0.99:0.059659,(10:0.145224,11:0.130742)1.00:0.073725,31:0.155878)0.97:0.028531,((((21:0.029766,36:0.081617)0.53:0.022373,(22:0.060035,47:0.065284)0.70:0.017684)0.95:0.073051,(43:0.126112,46:0.091591)0.76:0.050936)1.00:0.098971,(((((24:0.03245,30:0.052057)1.00:0.044653,29:0.056373)0.75:0.011401,28:0.042555)0.56:0.010244,25:0.059269)1.00:0.042784,26:0.129175)1.00:0.041261)0.98:0.031057,(((2:0.07434,12:0.115856)1.00:0.029844,((3:0.110459,4:0.066074)1.00:0.07601,13:0.086985)0.55:0.011986)1.00:0.050407,23:0.136504)1.00:0.037131)0.88:0.012485,(1:0.020168,(5:0.039697,(33:0.016975,34:0.004318)0.81:0.005839)0.61:0.010523)1.00:0.033954)0.82:0.021077)1.00:0.113086,((16:0.06934,17:0.04447)1.00:0.048991,35:0.068091)1.00:0.249805); + TREE con_50_majrule = [&R] (44:0.297765,((((14:0.042304,32:0.035691):0.260477,(15:0.174438,42:0.063045):0.197717):0.039742,37:0.11881):0.048442,(((((18:0.189186,((19:0.066249,20:0.084149):0.124636,38:0.019229):0.256912):0.384594,(9:0.089172,41:0.254491):0.163051):0.039541,(((6:0.053786,45:0.061399):0.142211,27:0.257155):0.214838,(7:0.212373,(8:0.13502,(39:0.069081,40:0.090937):0.058315):0.140473):0.103892):0.059659,(10:0.145224,11:0.130742):0.073725,31:0.155878):0.028531,((((21:0.029766,36:0.081617):0.022373,(22:0.060035,47:0.065284):0.017684):0.073051,(43:0.126112,46:0.091591):0.050936):0.098971,(((((24:0.03245,30:0.052057):0.044653,29:0.056373):0.011401,28:0.042555):0.010244,25:0.059269):0.042784,26:0.129175):0.041261):0.031057,(((2:0.07434,12:0.115856):0.029844,((3:0.110459,4:0.066074):0.07601,13:0.086985):0.011986):0.050407,23:0.136504):0.037131):0.012485,(1:0.020168,(5:0.039697,(33:0.016975,34:0.004318):0.005839):0.010523):0.033954):0.021077):0.113086,((16:0.06934,17:0.04447):0.048991,35:0.068091):0.249805); + + + +END;