Update classpath

fix query log info, jobs by counter

add class with structure

fix data report, protein report

Restore one servlet

Restore libraries for JSP tags

First working "writing" code for Cassandra 2.0

Add new still not-working code for native binary protocol version

Conflicts:
server/compbio/statistic/StatisticsProt.java

Improve JSP pages

Conflicts:
website/ReportLength.jsp

Update basic jars: from Thrift to native banary protocol (2)

Update basic jars: from Thrift to native banary protocol

New JPS code

Some new servlet code

Merge branch 'master' of https://source.jalview.org/git/proteocache

Remove surplus code

Fix problem with dates

nothing change

done time execution for queries, query by counter of job, total in column in query by execution time of job

Fix problem with too many open files and problem with not-flushed
info

Add still not-working code for the 2nd cassandra call

Make internal variable private

Fix bug with wrong source file

Remove surplus code and add format of the source file

Apply formatting

Simplify servlets

Optimize code

Apply formatting to the JSP pages

Add another parser for local files with metainformation

Add some necessary files

Modify project configuration

Add first banch of JSPs

Modify servlet configuration

First working code

Remove JABAWS testing code

Remove old libraries

Delete JABAWS testing codes

Some lost files

Add testing dirs

Rename projecet

First commit into ProteoCache (some basic files from JABAWS)