Replace binaries with one compatible with the dundee cluster
[jabaws.git] / binaries / src / ViennaRNA / RNAforester / src /
drwxr-xr-x   ..
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-rw-r--r-- 3004 Arguments.h
-rw-r--r-- 953 Makefile.am
-rw-r--r-- 19084 Makefile.in
-rwxr-xr-x 5293613 RNAforester
-rw-r--r-- 2722 algebra.h
-rw-r--r-- 2910 alignment.h
-rw-r--r-- 28782 alignment.t.cpp
-rw-r--r-- 802 debug.h
-rw-r--r-- 476 fold.h
-rw-r--r-- 1659 fold_vars.h
-rw-r--r-- 7512 glib.c
-rw-r--r-- 2074 graphtypes.h
-rw-r--r-- 31938 main.cpp
-rw-r--r-- 977 match.defs
-rw-r--r-- 1233 matrix.h
-rw-r--r-- 430 misc.h
-rw-r--r-- 605 misc.t.cpp
-rw-r--r-- 3055 pairs.c
-rw-r--r-- 517 part_func.h
-rw-r--r-- 1449 pointer.c
-rw-r--r-- 3582 ppforest.h
-rw-r--r-- 5187 ppforest.t.cpp
-rw-r--r-- 1435 ppforestali.h
-rw-r--r-- 4187 ppforestbase.cpp
-rw-r--r-- 7106 ppforestbase.h
-rw-r--r-- 1775 ppforestsz.h
-rw-r--r-- 1674 ppforestsz.t.cpp
-rw-r--r-- 10491 progressive_align.cpp
-rw-r--r-- 1489 progressive_align.h
-rw-r--r-- 2620 readgraph.c
-rw-r--r-- 2247 rna_algebra.cpp
-rw-r--r-- 16246 rna_algebra.h
-rw-r--r-- 4332 rna_alignment.cpp
-rw-r--r-- 2347 rna_alignment.h
-rw-r--r-- 498 rna_alphabet.cpp
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-rw-r--r-- 29739 rna_profile_alignment.cpp
-rw-r--r-- 5025 rna_profile_alignment.h
-rw-r--r-- 4349 rnaforest.cpp
-rw-r--r-- 1791 rnaforest.h
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-rw-r--r-- 2592 rnaforestsz.cpp
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-rw-r--r-- 2377 rnafuncs.h
-rw-r--r-- 1310 term.c
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-rw-r--r-- 4571 treeedit.t.cpp
-rw-r--r-- 101 types.h
-rw-r--r-- 2398 unpairs.c
-rw-r--r-- 1883 utils.h
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