included instructions to use ps2pdf to reduce the size of file generated by pdflatex...
[jalview-manual.git] / TheJalviewTutorial.tex
index db1e65f..1bcef5a 100644 (file)
@@ -3,7 +3,8 @@
 \usepackage[format=hang,margin=10pt]{caption}
 \usepackage{footnote}
 \usepackage{graphicx}
-\usepackage{amssymb}
+\usepackage{fouriernc}
+%\usepackage{amssymb}
 \usepackage{epstopdf}
 \usepackage{hyperref}
 \usepackage{subfigure}
@@ -149,8 +150,8 @@ colouring.} and includes a javascript API to allow customisable display of align
 
 
 Jalview 2.8 was released in November 2012. The Jalview Desktop in this version
-provides access to protein and nucleic acid sequence, alignment and structure databases, and
-includes the Jmol\footnote{ Provided under the LGPL licence at
+provides access to protein and nucleic acid sequence, alignment and structure
+databases, and includes the Jmol\footnote{ Provided under the LGPL licence at
 \url{http://www.jmol.org}} viewer for molecular structures, and the VARNA\footnote{Provided under GPL licence at \url{http://varna.lri.fr}} program for the visualization of RNA secondary structure. A
 Distributed Annotation System (DAS) client\footnote{jDAS - released under Apache license (v2.0) at \url{http://code.google.com/p/jdas}} which facilitates the retrieval and display of third party sequence
 annotation in association with sequences and any associated structure. It also