help/help/html/colourSchemes/gecos-blossom.html

   1 <html>
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  21  -->
  22 <head>
  23 <title>Blossom Colour Scheme</title>
  24 <style type="text/css">
  25 <!--
  26 td {
  27         text-align: center;
  28 }
  29 -->
  30 </style>
  31 </head>
  32
  33 <body>
  34   <p>
  35     <strong><a name="gecos-blossom">Blossom</a></strong>
  36   </p>
  37   <p>
  38   This colour scheme was generated by the gecos software. See<br/>
  39   Kunzmann, P., Mayer, B.E. & Hamacher, K. Substitution matrix based color schemes for sequence alignment visualization. <em>BMC Bioinformatics</em> <strong>21</strong>, 209 (2020). https://doi.org/10.1186/s12859-020-3526-6<br/>
  40   and https://gecos.biotite-python.org/ .<br/>
  41   Gecos sets perceptual differences in the colour scheme according to differences in the substitution matrix.
  42   </p>
  43   <p>
  44     blossom is a light color scheme with high contrast, based on BLOSUM62.
  45   </p>
  46   <div align="center">
  47     <table width="400" border="1">
  48
  49 <tr>
  50     <td bgcolor="#8bc4b4">A</td>
  51     <td bgcolor="#0893fe">C</td>
  52     <td bgcolor="#5fa505">D</td>
  53     <td bgcolor="#dbb501">E</td>
  54 </tr>
  55 <tr>
  56     <td bgcolor="#f74fa8">F</td>
  57     <td bgcolor="#00d382">G</td>
  58     <td bgcolor="#ff5701">H</td>
  59     <td bgcolor="#9abaf3">I</td>
  60 </tr>
  61 <tr>
  62     <td bgcolor="#fea527">K</td>
  63     <td bgcolor="#cda5dc">L</td>
  64     <td bgcolor="#f5a1b8">M</td>
  65     <td bgcolor="#b5c206">N</td>
  66 </tr>
  67 <tr>
  68     <td bgcolor="#10d631">P</td>
  69     <td bgcolor="#bf8527">Q</td>
  70     <td bgcolor="#fc9502">R</td>
  71     <td bgcolor="#7e9d59">S</td>
  72 </tr>
  73 <tr>
  74     <td bgcolor="#00a29c">T</td>
  75     <td bgcolor="#87c0e4">V</td>
  76     <td bgcolor="#fe08fb">W</td>
  77     <td bgcolor="#ff4e7a">Y</td>
  78 </tr>
  79
  80     </table>
  81   </div>
  82 </body>
  83 </html>