Merge branch 'patch/JAL-4036_uniprot_fts_legacy_endpoint' into develop
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 label.quit_jalview = Quit Jalview?
36 action.expand_views = Expand Views
37 action.gather_views = Gather Views
38 action.page_setup = Page Setup...
39 action.reload = Reload
40 action.load = Load
41 action.open = Open
42 action.cancel = Cancel
43 action.create = Create
44 action.update = Update
45 action.delete = Delete
46 action.clear = Clear
47 action.accept = Accept
48 action.select_ddbb = --- Select Database ---
49 action.undo = Undo
50 action.redo = Redo
51 action.reset = Reset
52 action.remove_left = Remove left
53 action.remove_right = Remove right
54 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
55 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
56 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
57 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
58 action.boxes = Boxes
59 action.text = Text
60 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
61 action.by_id = By Id
62 action.by_length = By Length
63 action.by_group = By Group
64 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
65 action.set_as_reference = Set as Reference 
66 action.remove = Remove
67 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
68 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
69 action.user_defined = User Defined...
70 action.by_conservation = By Conservation
71 action.wrap = Wrap
72 action.show_gaps = Show Gaps
73 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
74 action.find = Find
75 action.undefine_groups = Undefine Groups
76 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
77 action.copy = Copy
78 action.cut = Cut
79 action.font = Font...
80 action.scale_above = Scale Above
81 action.scale_left = Scale Left
82 action.scale_right = Scale Right
83 action.by_tree_order = By Tree Order
84 action.sort = Sort
85 action.calculate_tree = Calculate Tree...
86 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
87 action.help = Help
88 action.by_annotation = By Annotation...
89 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
90 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
91 action.show = Show
92 action.hide = Hide
93 action.ok = OK
94 action.set_defaults = Defaults
95 action.create_group = Create Group
96 action.remove_group = Remove Group
97 action.edit_group = Edit Group
98 action.border_colour = Border colour
99 action.edit_new_group = Edit New Group
100 action.hide_sequences = Hide Sequences
101 action.sequences = Sequences
102 action.ids = IDS
103 action.ids_sequences = IDS and sequences
104 action.reveal_all = Reveal All
105 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
106 action.find_all = Find all
107 action.find_next = Find next
108 action.file = File
109 action.view = View
110 action.annotations = Annotations
111 action.change_params = Change Parameters
112 action.apply = Apply
113 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
114 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
115 action.by_chain = By Chain
116 action.by_sequence = By Sequence
117 action.paste_annotations = Paste Annotations
118 action.format = Format
119 action.select = Select
120 action.new_view = New View
121 action.new_structure_view_with = Open new structure view with {0}
122 action.close = Close
123 action.add = Add
124 action.save_as = Save as...
125 action.save = Save
126 action.change_font = Change Font
127 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
128 action.colour = Colour
129 action.calculate = Calculate
130 action.select_all = Select all
131 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
132 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
133 action.deselect_all = Deselect all
134 action.invert_selection = Invert selection
135 action.using_jmol = Using Jmol
136 action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
137 action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
138 action.link = Link
139 action.group_link = Group Link
140 action.show_chain = Show Chain
141 action.show_group = Show Group
142 action.fetch_db_references = Fetch DB References
143 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
144 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
145 label.structures_manager = Structures Manager
146 label.url = URL
147 label.url\: = URL:
148 label.input_file_url = Enter URL or Input File
149 label.select_feature = Select feature
150 label.name = Name
151 label.name\: = Name:
152 label.name_param = Name: {0}
153 label.group = Group
154 label.group\: = Group:
155 label.group_name = Group Name
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157 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
158 label.colour = Colour:
159 label.description = Description
160 label.description\: = Description:
161 label.start = Start:
162 label.end = End:
163 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
164 label.service_action = Service Action:
165 label.post_url = POST URL:
166 label.url_suffix = URL Suffix
167 label.per_seq = per Sequence
168 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
169 label.amend = Amend
170 label.undo_command = Undo {0}
171 label.redo_command = Redo {0}
172 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
173 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
174 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
175 label.choose_calculation = Choose Calculation
176 label.calc_title = {0} Using {1}
177 label.tree_calc_av = Average Distance
178 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
179 label.score_model_pid = % Identity
180 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
181 label.score_model_pam250 = PAM 250
182 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
183 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
184 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
185 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
186 label.status_bar = Status bar
187 label.out_to_textbox = Output to Textbox
188 label.occupancy = Occupancy
189 # delete Clustal - use FileFormat name instead
190 label.clustal = Clustal
191 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
192 label.colourScheme_clustal = Clustalx
193 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
194 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
195 label.colourScheme_zappo = Zappo
196 label.colourScheme_taylor = Taylor
197 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
198 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
199 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
200 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
201 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
202 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
203 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
204 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
205 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
206 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
207 label.blc = BLC
208 label.fasta = Fasta
209 label.msf = MSF
210 label.pfam = PFAM
211 label.pileup = Pileup
212 label.pir = PIR
213 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
214 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
215 label.show_annotations = Show annotations
216 label.hide_annotations = Hide annotations
217 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
218 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
219 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
220 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
221 label.hide_all = Hide all
222 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
223 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
224 label.colour_text = Colour Text
225 label.show_non_conserved = Show nonconserved
226 label.overview_window = Overview Window
227 label.none = None
228 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
229 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
230 label.nucleotide = Nucleotide
231 label.protein = Protein
232 label.nucleotides = Nucleotides
233 label.proteins = Proteins
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235 label.to_new_alignment = To New Alignment
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237 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
238 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
239 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
240 label.input_from_textbox = Input from textbox
241 label.centre_column_labels = Centre column labels
242 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
243 label.documentation = Documentation
244 label.about = About...
245 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
246 action.feature_settings = Feature Settings...
247 label.all_columns = All Columns
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249 label.selected_columns = Selected Columns 
250 label.selected_sequences = Selected Sequences
251 label.except_selected_sequences = All except selected sequences
252 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
253 label.selected_region = Selected Region
254 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
255 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
256 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
257 label.group_consensus = Group Consensus
258 label.group_conservation = Group Conservation
259 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
260 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
261 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
262 label.apply_all_groups = Apply to all groups
263 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
264 label.show_first = Show first
265 label.show_last = Show last
266 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
267 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
268 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
269 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
270 label.structure_viewer = Default structure viewer
271 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
272 label.viewer_path = Path to {0} program
273 label.viewer_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
274 label.invalid_viewer_path = Path not found or not executable
275 label.viewer_missing = Structure viewer not found.<br/>Please enter the path to the executable (if installed),<br/>or download and install the program.
276 label.open_viewer_failed = Error opening {0} - is it installed?\nCheck configured path in Structure tab of Jalview''s Preferences 
277 label.min_colour = Minimum Colour
278 label.max_colour = Maximum Colour
279 label.no_colour = No Colour
280 label.use_original_colours = Use Original Colours
281 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
282 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
283 label.selection = Selection
284 label.group_colour = Group Colour
285 label.sequence = Sequence
286 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
287 label.min_value = Min value
288 label.max_value = Max value
289 label.no_value = No value
290 label.new_feature = New Feature
291 label.match_case = Match Case
292 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
293 label.labels = Labels
294 label.output_values = Output Values...
295 label.output_points = Output points...
296 label.output_transformed_points = Output transformed points
297 label.input_data = Input Data...
298 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
299 label.protein_matrix = Protein matrix
300 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
301 label.show_distances = Show distances
302 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
303 label.fit_to_window = Fit To Window
304 label.newick_format = Newick Format
305 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
306 label.colours = Colours
307 label.view_mapping = View Mapping
308 label.wireframe = Wireframe
309 label.depthcue = Depthcue
310 label.z_buffering = Z Buffering
311 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
312 label.all_chains_visible = All Chains Visible
313 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
314 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
315 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
316 label.removed_columns = Removed {0} columns.
317 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
318 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
319 label.order_by_params = Order by {0}
320 label.html_content = <html>{0}</html>
321 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
322 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
323 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
324 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
325 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
326 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
327 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
328 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
329 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
330 label.paste_your = Paste your
331 label.finished_searching = Finished searching
332 label.subsequence_matches_found = {0} subsequence matches found
333 label.search_results= Search results {0} : {1}
334 label.found_match_for = Found match for {0}
335 label.font = Font:
336 label.size = Size:
337 label.style = Style:
338 label.calculating = Calculating....
339 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
340 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
341 label.set_this_label_text = set this label text
342 label.sequences_from = Sequences from {0}
343 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
344 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
345 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
346 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
347 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
348 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
349 label.source_to_target = {0} ... {1}
350 label.per_sequence_only= Per-sequence only
351 label.to_file = to File
352 label.to_textbox = to Textbox
353 label.jalview = Jalview
354 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
355 label.status = Status
356 label.channels = Channels
357 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
358 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
359 label.groovy_console = Groovy Console...
360 label.lineart = Lineart
361 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
362 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
363 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
364 label.invert_selection = Invert Selection
365 label.optimise_order = Optimise Order
366 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
367 label.load_colours = Load Colours
368 label.save_colours = Save Colours
369 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
370 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
371 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
372 label.database_param = Database: {0}
373 label.example = Example
374 label.example_param = Example: {0}
375 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
376 label.file_format_not_specified = File format not specified
377 label.couldnt_save_file = Couldn''t save file: {0}
378 label.error_saving_file = Error Saving File
379 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
380 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
381 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
382 label.invalid_selection = Invalid Selection
383 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
384 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
385 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
386 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
387 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
388 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
389 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
390 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
391 label.translation_failed = Translation Failed
392 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
393 label.implementation_error  = Implementation error:
394 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
395 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
396 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
397 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
398 label.view_name_original = Original
399 label.enter_view_name = Enter View Name
400 label.enter_label = Enter label
401 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
402 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
403 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
404 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
405 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
406 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn''t read the pasted text {0}
407 label.error_parsing_text = Error parsing text
408 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
409 label.input_alignment = Input Alignment
410 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
411 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
412 label.url_not_found = URL not found
413 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
414 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
415 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
416 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
417 label.invalid_url = Invalid URL !
418 label.error_loading_file = Error loading file
419 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
420 label.file_open_error = File open error
421 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
422 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
423 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
424 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
425 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
426 label.alignment_props = Alignment Properties
427 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
428 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
429 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
430 label.annotations = Annotations
431 label.structure_options = Structure Options
432 label.features = Features
433 label.overview_params = Overview {0}
434 label.paste_newick_file = Paste Newick file
435 label.load_tree_from_file = From File - 
436 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
437 label.selection_output_command = Selection output - {0}
438 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
439 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
440 label.pca_details = PCA details
441 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
442 label.user_defined_colours = User defined colours
443 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
444 label.jaview_build_date = Build date: {0}
445 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
446 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
447 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
448 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
449 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
450 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
451 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
452 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
453 label.right_click = Right click
454 label.to_add_annotation = to add annotation
455 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
456 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
457 label.label = Label
458 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
459 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
460 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
461 label.calculating_pca= Calculating PCA
462 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
463 label.jalview_applet = Jalview applet
464 label.loading_data = Loading data
465 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
466 label.calculating_tree = Calculating tree
467 label.state_queueing = queuing
468 label.state_running = running
469 label.state_completed = finished
470 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
471 label.state_job_error = job error!
472 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
473 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
474 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
475 label.structure_type = Structure type
476 label.settings_for_type = Settings for {0}
477 label.view_full_application = View in Full Application
478 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
479 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
480 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
481 label.load_vcf_file = Load VCF File
482 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
483 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
484 label.export_features = Export Features...
485 label.export_annotations = Export Annotations...
486 label.to_upper_case = To Upper Case
487 label.to_lower_case = To Lower Case
488 label.toggle_case = Toggle Case
489 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
490 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
491 label.edit_sequence = Edit Sequence
492 label.edit_sequences = Edit Sequences
493 label.insert_gap = Insert 1 gap
494 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
495 label.delete_gap = Delete 1 gap
496 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
497 label.sequence_details = Sequence Details
498 label.viewer_help = {0} Help
499 label.close_viewer = Close Viewer
500 label.confirm_close_viewer = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the {1} window as well?
501 label.all = All
502 label.sort_by = Sort alignment by
503 label.sort_by_score = Sort by Score
504 label.sort_by_density = Sort by Density
505 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
506 label.sort_ann_by = Sort annotations by
507 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
508 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
509 label.reveal = Reveal
510 label.hide_columns = Hide Columns
511 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
512 label.load_tree_file = Load a tree file
513 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
514 label.standard_databases = Standard Databases
515 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
516 label.fetch_uniprot_references = Fetch Uniprot references
517 label.search_3dbeacons = Search 3D-Beacons
518 label.find_models_from_3dbeacons = Search 3D-Beacons for 3D structures and models
519 label.3dbeacons = 3D-Beacons
520 label.fetch_references_for = Fetch database references for {0} sequences ?
521 label.fetch_references_for_3dbeacons = 3D Beacons needs to fetch Uniprot References for {0} sequences.  Do you want to continue ?
522 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
523 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
524 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
525 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
526 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
527 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
528 label.adjust_threshold = Adjust threshold
529 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
530 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
531 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
532 label.open_url_param = Open URL {0}
533 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
534 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
535 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
536 label.dark_colour = Dark Colour
537 label.light_colour = Light Colour
538 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
539 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
540 label.copy_format_from = Copy format from
541 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
542 label.select_all_views = Select all views
543 label.select_many_views = Select many views
544 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
545 label.open_local_file = Open local file
546 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
547 label.listen_for_selections = Listen for selections
548 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
549 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
550 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
551 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
552 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
553 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
554 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
555 label.no_services = <No Services>
556 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
557 label.from_url = from URL
558 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
559 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
560 label.from_textbox = from Textbox
561 label.window = Window
562 label.preferences = Preferences
563 label.tools = Tools
564 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
565 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
566 label.collect_garbage = Collect Garbage
567 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
568 label.show_java_console = Show Java Console
569 label.show_jalview_news = Show Jalview News
570 label.take_snapshot = Take snapshot
571 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
572 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
573 label.monospaced_font= Monospaced
574 label.quality = Quality
575 label.maximize_window = Maximize Window
576 label.conservation = Conservation
577 label.consensus = Consensus
578 label.histogram = Histogram
579 label.logo = Logo
580 label.non_positional_features = List Non-positional Features
581 label.database_references = List Database References
582 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
583 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
584 label.gap_symbol = Gap Symbol
585 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
586 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
587 label.address = Address
588 label.host = Host
589 label.port = Port
590 label.default_browser_unix_windows = Default Browser (Unix, Windows)
591 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
592 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
593 label.check_for_latest_version = Check for latest version
594 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
595 label.no_proxy = No proxy servers
596 label.system_proxy = System proxy servers (http={0}; https={1})
597 label.use_proxy_server = Use these proxy servers
598 label.auth_required = Authentication required
599 label.username = Username
600 label.password = Password
601 label.proxy_password_required = Proxy password required
602 label.not_stored = not stored in Preferences file
603 label.rendering_style = {0} rendering style
604 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
605 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
606 label.smooth_font = Smooth Font
607 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
608 label.pad_gaps = Pad Gaps
609 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
610 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
611 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
612 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
613 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
614 label.right_align_ids = Right Align Ids
615 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
616 label.open_overview = Open Overview
617 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
618 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
619 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
620 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
621 label.visual = Visual
622 label.connections = Connections
623 label.output = Output
624 label.editing = Editing
625 label.web_services = Web Services
626 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
627 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
628 label.fetch_viewer_attributes = Fetch {0} attributes
629 label.fetch_viewer_attributes_tip = Copy {0} attribute to Jalview feature
630 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
631 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
632 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
633 label.new_service_url = New Service URL
634 label.edit_service_url = Edit Service URL
635 label.delete_service_url = Delete Service URL
636 label.details = Details
637 label.options = Options
638 label.parameters = Parameters
639 label.proxy_servers = Proxy Servers
640 label.file_output = File Output
641 label.select_input_type = Select input type
642 label.set_options_for_type = Set options for type
643 label.data_input_parameters = Data input parameters
644 label.data_returned_by_service = Data returned by service
645 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
646 label.parsing_errors = Parsing errors
647 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
648 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
649 label.input_parameter_name = Input Parameter name
650 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
651 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
652 label.brief_description_service = Brief description of service
653 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
654 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
655 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
656 label.gap_character = Gap character
657 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
658 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
659 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
660 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
661 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
662 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
663 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
664 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
665 label.input_output = Input/Output
666 label.cut_paste = Cut'n'Paste
667 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
668 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
669 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
670 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
671 label.from_file = From File
672 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
673 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
674 label.text_colour = Text Colour...
675 label.structure = Structure
676 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
677 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
678 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
679 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
680 label.sequence_name = Sequence Name
681 label.sequence_description = Sequence Description
682 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
683 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
684 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
685 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
686 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
687 label.web_browser_not_found = Web browser not found
688 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
689 label.html = HTML
690 label.wrap = Wrap
691 label.show_database_refs = Show Database Refs
692 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
693 label.save_png_image = Save As PNG Image
694 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
695 label.export_image = Export Image
696 label.vamsas_store = VAMSAS store
697 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
698 label.reverse = Reverse
699 label.reverse_complement = Reverse Complement
700 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
701 label.extract_scores = Extract Scores
702 label.get_cross_refs = Get Cross-References
703 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
704 label.add_sequences = Add Sequences
705 label.new_window = New Window
706 label.split_window = Split Window
707 label.set_as_default = Set as Default
708 label.show_labels = Show labels
709 action.background_colour = Background Colour...
710 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
711 label.link_name = Link Name
712 label.pdb_file = PDB file
713 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
714 label.let_viewer_manage_structure_colours = Let viewer manage structure colours
715 label.colour_with_viewer = Colour in structure viewer
716 label.superpose_structures = Superpose Structures
717 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
718 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
719 label.create_viewer_attributes = Write Jalview features
720 label.create_viewer_attributes_tip = Set structure residue attributes for Jalview features
721 label.attributes_set = {0} attribute values set on {1}
722 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
723 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
724 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
725 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
726 label.case_sensitive = Case Sensitive
727 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
728 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
729 label.index_by_host = Index by Host
730 label.index_by_type = Index by Type
731 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
732 label.display_warnings = Display Warnings
733 label.move_url_up = Move URL Up
734 label.move_url_down = Move URL Down
735 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
736 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
737 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
738 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
739 label.sequences_updated = Sequences updated
740 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
741 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
742 label.paste_new_window = Paste To New Window
743 label.settings_for_param = Settings for {0}
744 label.view_params = View {0}
745 label.aacon_calculations = AACon Calculations
746 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
747 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
748 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
749 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
750 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
751 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
752 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
753 label.all_views = All Views
754 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
755 label.realign_with_params = Realign with {0}
756 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
757 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
758 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
759 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
760 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
761 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
762 label.view_documentation = View documentation
763 label.select_return_type = Select return type
764 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
765 label.features_for_params = Features for - {0}
766 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
767 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
768 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
769 label.varna_params = VARNA - {0}
770 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
771 label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
772 label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
773 label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
774 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
775 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
776 label.points_for_params = Points for {0}
777 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
778 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
779 label.select_background_colour = Select Background Colour
780 label.invalid_font = Invalid Font
781 label.search_db_all = Search all of {0}
782 label.search_db_index = Search {0} index {1}
783 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
784 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0} separated by a semi-colon ";"
785 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
786 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
787 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
788 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
789 label.example_query_param = Example query: {0}
790 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
791 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
792 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
793 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
794 label.select_columns_containing = Select columns containing
795 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
796 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
797 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
798 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
799 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
800 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
801 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
802 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
803 label.use_sequence_id_4 = 
804 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
805 label.switch_server = Switch server
806 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
807 label.services_at = Services at {0}
808 label.rest_client_submit = {0} using {1}
809 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
810 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
811 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
812 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
813 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
814 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
815 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
816 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
817 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
818 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
819 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
820 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
821 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
822 label.user_preset = User Preset
823 label.service_preset = Service Preset
824 label.run_with_preset = Run {0} with preset
825 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
826 action.by_title_param = By {0}
827 label.source_from_db_source = Sources from {0}
828 label.from_msname = from {0}
829 label.superpose_with = Superpose with
830 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
831 label.add_new_row = Add New Row
832 label.edit_label_description = Edit Label/Description
833 label.hide_row = Hide This Row
834 label.delete_row = Delete This Row
835 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
836 label.export_annotation = Export Annotation
837 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
838 label.helix = Helix
839 label.sheet = Sheet
840 label.rna_helix = RNA Helix
841 label.remove_annotation = Remove Annotation
842 label.colour_by = Colour by...
843 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
844 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
845 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
846 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
847 label.multiharmony = Multi-Harmony
848 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
849 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
850 label.prompt_each_time = Prompt each time
851 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
852 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
853 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
854 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
855 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
856 label.invalid_name = Invalid name
857 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
858 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
859 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
860 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn''t be located.
861 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
862 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
863 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
864 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
865 label.feature_type = Feature Type
866 label.show = Show
867 label.service_url = Service URL
868 label.copied_sequences = Copied sequences
869 label.cut_sequences = Cut Sequences
870 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
871 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
872 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
873 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
874 label.save_features_to_file = Save Features to File
875 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
876 label.save_pdb_file = Save PDB File
877 label.save_text_to_file = Save Text to File
878 label.save_state = Save State
879 label.restore_state = Restore State
880 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
881 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
882 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
883 label.select_startup_file = Select startup file
884 label.select_default_browser = Select default web browser
885 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
886 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
887 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
888 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
889 label.save_as_html = Save as HTML
890 label.recently_opened = Recently Opened
891 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
892 label.tree = Tree
893 label.tree_from = Tree from {0}
894 label.webservice_job_title = {0} using {1}
895 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
896 label.visible = Visible
897 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
898 label.visible_region_of = visible region of
899 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
900 label.loading_file = Loading File: {0}
901 label.edit_params = Edit {0}
902 label.as_percentage = As Percentage
903 error.not_implemented = Not implemented
904 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
905 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
906 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
907 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
908 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
909 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
910 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
911 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
912 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
913 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
914 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
915 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
916 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
917 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
918 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
919 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
920 error.implementation_error = Implementation error
921 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
922 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
923 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
924 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
925 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
926 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
927 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
928 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
929 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
930 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
931 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
932 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
933 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
934 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
935 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
936 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
937 label.cancelled_params = Cancelled {0}
938 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
939 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
940 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
941 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
942 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
943 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
944 error.invalid_value_for_option = Invalid value ''{0}'' for option ''{1}''
945 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
946 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
947 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
948 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
949 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
950 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
951 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
952 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
953 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
954 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
955 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
956 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
957 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
958 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
959 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
960 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
961 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
962 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
963 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
964 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
965 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
966 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
967 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
968 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
969 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
970 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
971 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
972 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
973 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
974 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can''t locate either oldname ({0}) or presetName ({1}) in the datastore!"
975 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
976 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
977 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
978 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
979 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
980 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
981 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
982 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn''t encode {0} as UTF-8.
983 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
984 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
985 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
986 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
987 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
988 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
989 label.no_highlighted_regions_marked = No highlighted regions marked
990 label.toggled = Toggled
991 label.marked = Marked
992 label.containing = containing
993 label.not_containing = not containing
994 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
995 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
996 label.submission_params = Submission {0}
997 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
998 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
999 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1000 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1001 label.pca_calculating = Calculating PCA
1002 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1003 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1004 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1005 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1006 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1007 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1008 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1009 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1010 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1011 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1012 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1013 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1014 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1015 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1016 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1017 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1018 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1019 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1020 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1021 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1022 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1023 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1024 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1025 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1026 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1027 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1028 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1029 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1030 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1031 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1032 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1033 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1034 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1035 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1036 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1037 label.mapped = mapped
1038 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1039 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn''t parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1040 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1041 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1042 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn''t access datasource ({0})
1043 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn''t process data as RNAML file ({0})
1044 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1045 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1046 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1047 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1048 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1049 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1050 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn''t store sequence mappings for {0}
1051 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1052 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1053 exception.browser_unable_to_launch = Unable to launch browser: {0}
1054 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1055 exception.browser_os_not_supported = Launching browser on this operating system not supported.  Use URL\n{0}
1056 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1057 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1058 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1059 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1060 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1061 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1062 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1063 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1064 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1065 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1066 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1067 label.remove_gaps = Remove Gaps
1068 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1069 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1070 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1071 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1072 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1073 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1074 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1075 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1076 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1077 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1078 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1079 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1080 warn.service_not_supported = Service not supported!
1081 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1082 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1083 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1084 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn''t support this program.\n{0}
1085 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1086 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1087 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1088 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1089 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1090 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1091 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1092 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1093 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1094 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1095 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1096 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1097 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1098 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1099 label.eps_file = EPS file
1100 label.png_image = PNG image
1101 status.export_complete = {0} Export completed
1102 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1103 status.refreshing_news = Refreshing news
1104 status.opening_params = Opening {0}
1105 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1106 status.finshed_querying = Finished querying
1107 status.parsing_results = Parsing results.
1108 status.processing = Processing...
1109 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1110 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1111 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1112 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1113 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1114 status.searching_3d_beacons = Searching 3D Beacons
1115 status.no_structures_discovered_from_3d_beacons = No models discovered from 3D Beacons
1116 status.opening_file_for = opening file for
1117 status.colouring_structures = Colouring structures
1118 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1119 label.font_too_small = Font size is too small
1120 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1121 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1122 label.out_of_memory = Out of memory
1123 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1124 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1125 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1126 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1127 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1128 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1129 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1130 label.test_server = Test Server?
1131 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1132 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1133 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1134 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1135 label.file_already_exists = File exists
1136 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1137 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1138 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1139 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1140 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1141 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1142 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1143 label.delete_all = Delete all sequences
1144 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1145 label.add_annotations_for = Add annotations for
1146 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1147 label.choose_annotations = Choose Annotations
1148 label.find = Find
1149 label.in = in
1150 label.invalid_search = Search string invalid
1151 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1152 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1153 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1154 label.show_group_logo = Show Group Logo
1155 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1156 label.show_histogram = Show Histogram
1157 label.show_logo = Show Logo
1158 label.normalise_logo = Normalise Logo
1159 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1160 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1161 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1162 label.open_split_window = Open split window
1163 action.no = No
1164 action.yes = Yes
1165 label.for = for
1166 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1167 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1168 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1169 label.alpha_helix = Alpha Helix
1170 label.beta_strand = Beta Strand
1171 label.turn = Turn
1172 label.select_all = Select All
1173 label.structures_filter = Structures Filter
1174 label.search_filter = Search Filter
1175 label.include_description= Include Description
1176 action.back = Back
1177 label.hide_insertions = Hide Insertions
1178 label.mark_as_representative = Mark as representative
1179 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1180 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1181 label.result = result
1182 label.results = results
1183 label.structure_chooser = Structure Chooser
1184 label.invert = Invert 
1185 label.select_pdb_file = Select PDB File
1186 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1187 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1188 label.search_result = Search Result
1189 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1190 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1191 label.start_jalview = Start Jalview
1192 label.biojs_html_export = BioJS
1193 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1194 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1195 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1196 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1197 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1198 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1199 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1200 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1201 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1202 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1203 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1204 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1205 action.export_groups = Export Groups
1206 action.export_annotations = Export Annotations
1207 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1208 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1209 action.export_features = Export Features
1210 label.export_settings = Export Settings
1211 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1212 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1213 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1214 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1215 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1216 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1217 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1218 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1219 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1220 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1221 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1222 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1223 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1224 label.run_groovy = Run Groovy console script
1225 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1226 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1227 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1228 action.next_page= >> 
1229 action.prev_page= << 
1230 label.next_page_tooltip=Next Page
1231 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1232 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1233 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1234 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1235 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1236 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1237 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1238 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1239 label.column = Column
1240 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1241 label.operation_failed = Operation failed
1242 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1243 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1244 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1245 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1246 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1247 action.customfilter = Custom only
1248 action.showall = Show All
1249 label.insert = Insert:
1250 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1251 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1252 label.primary = Double Click
1253 label.inmenu = In Menu
1254 label.id = ID
1255 label.database = Database
1256 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1257 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1258 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1259 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1260 label.urllinks = Links
1261 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1262 label.togglehidden = Show hidden regions
1263 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1264 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1265 label.consensus_descr = PID
1266 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1267 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1268 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1269 label.show_experimental = Enable experimental features
1270 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1271 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1272 label.overview_settings = Overview settings
1273 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1274 label.gap_colour = Gap colour:
1275 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1276 label.hidden_colour = Hidden colour:
1277 label.select_gap_colour = Select gap colour
1278 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1279 label.overview = Overview
1280 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1281 label.oview_calc = Recalculating overview...
1282 label.feature_details = Feature details
1283 label.matchCondition_contains = Contains
1284 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1285 label.matchCondition_matches = Matches
1286 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1287 label.matchCondition_present = Is present
1288 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1289 label.matchCondition_eq = =
1290 label.matchCondition_ne = not =
1291 label.matchCondition_lt = <
1292 label.matchCondition_le = <=
1293 label.matchCondition_gt = >
1294 label.matchCondition_ge = >=
1295 label.numeric_required = The value should be numeric
1296 label.filter = Filter
1297 label.filters = Filters
1298 label.join_conditions = Join conditions with
1299 label.delete_condition = Delete this condition
1300 label.score = Score
1301 label.colour_by_label = Colour by label
1302 label.variable_colour = Variable colour...
1303 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1304 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1305 option.autosearch = Autosearch
1306 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1307 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1308 label.simple_colour = Simple Colour
1309 label.colour_by_text = Colour by text
1310 label.graduated_colour = Graduated Colour
1311 label.by_text_of = By text of
1312 label.by_range_of = By range of
1313 label.or = Or
1314 label.and = And
1315 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1316 label.best_quality = Best Quality
1317 label.best_resolution = Best Resolution
1318 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1319 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1320 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1321 label.cached_structures = Cached Structures
1322 label.free_text_search = Free Text Search
1323 label.annotation_name = Annotation Name
1324 label.annotation_description = Annotation Description 
1325 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1326 label.alignment = alignment
1327 label.pca = PCA
1328 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1329 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1330 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1331 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1332 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1333 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1334 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1335 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1336 label.continue_operation = Continue operation?
1337 label.backups = Backups
1338 label.backup = Backup
1339 label.backup_files = Backup Files
1340 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1341 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1342 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1343 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1344 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1345 label.scheme_examples = Scheme examples
1346 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1347 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1348 label.keep_files = Deleting old backup files
1349 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1350 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1351 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1352 label.always_ask = Always ask
1353 label.auto_delete = Automatically delete
1354 label.filename = filename
1355 label.braced_oldest = (oldest)
1356 label.braced_newest = (most recent)
1357 label.configuration = Configuration
1358 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1359 label.schemes = Schemes
1360 label.customise = Customise
1361 label.custom = Custom
1362 label.default = Default
1363 label.single_file = Single backup
1364 label.keep_all_versions = Keep all versions
1365 label.rolled_backups = Rolled backup files
1366 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1367 label.custom_description = Your own saved scheme
1368 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1369 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1370 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1371 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1372 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1373 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1374 label.include_backup_files = Include backup files
1375 label.cancel_changes = Cancel changes
1376 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1377 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1378 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1379 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1380 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1381 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1382 label.delete = Delete
1383 label.rename = Rename
1384 label.keep = Keep
1385 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1386 label.annotation_name = Annotation Name
1387 label.annotation_description = Annotation Description 
1388 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1389 label.alignment = alignment
1390 label.pca = PCA
1391 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1392 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1393 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu
1394 label.show_linked_features = Show {0} features
1395 label.on_top = on top
1396 label.include_linked_features = Include {0} features
1397 label.include_linked_tooltip = Include visible {0} features<br>converted to local sequence coordinates
1398 label.features_not_shown = {0} feature(s) not shown
1399 label.no_features_to_sort_by = No features to sort by
1400 label.ignore_hidden = Ignore hidden columns
1401 label.ignore_hidden_tooltip = Ignore any characters in hidden columns when matching
1402 label.log_level = Log level
1403 label.log_level_tooltip = Temporarily set the log level for this console. The log level will revert to {0} when this Java console is closed.
1404 label.copy_to_clipboard = Copy to clipboard
1405 label.copy_to_clipboard_tooltip = Copy all of the log text in this console to the system clipboard
1406 label.startup = Startup
1407 label.memory = Memory
1408 label.customise_memory_settings = Customise maximum memory settings
1409 label.memory_setting_text = New memory settings will only come into effect the next time you start Jalview
1410 label.maximum_memory_used = Maximum memory limited to both
1411 label.percent_of_physical_memory = Maximum percent of physical memory
1412 label.maximum_memory = Maximum absolute memory
1413 label.maximum_memory_tooltip = Enter memory as an integer number optionally followed by 'b', 'k', 'm', 'g' or 't'
1414 label.adjustments_for_this_computer = Adjustments for this computer
1415 label.memory_example_text = Maximum memory that would be used with these settings on this computer
1416 label.memory_example_tooltip = The memory allocated to Jalview is the smaller of the percentage of physical memory (default 90%) and the maximum absolute memory (default 32GB). If your computer's memory cannot be ascertained then the maximum absolute memory defaults to 8GB (if not customised).<br>Jalview will always try and reserve 512MB for the OS and at least 512MB for itself.