bin/jalview/datamodel/StructureViewerModel.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.datamodel");
   2 Clazz.load (["java.util.HashMap"], "jalview.datamodel.StructureViewerModel", ["java.util.ArrayList"], function () {
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
   4 this.x = 0;
   5 this.y = 0;
   6 this.width = 0;
   7 this.height = 0;
   8 this.alignWithPanel = false;
   9 this.colourWithAlignPanel = false;
  10 this.colourByViewer = false;
  11 this.stateData = "";
  12 this.viewId = null;
  13 this.type = null;
  14 this.fileData = null;
  15 if (!Clazz.isClassDefined ("jalview.datamodel.StructureViewerModel.StructureData")) {
  16 jalview.datamodel.StructureViewerModel.$StructureViewerModel$StructureData$ ();
  17 }
  18 Clazz.instantialize (this, arguments);
  19 }, jalview.datamodel, "StructureViewerModel");
  20 Clazz.prepareFields (c$, function () {
  21 this.fileData =  new java.util.HashMap ();
  22 });
  23 Clazz.makeConstructor (c$,
  24 function (x, y, width, height, alignWithPanel, colourWithAlignPanel, colourByViewer, viewId, type) {
  25 this.x = x;
  26 this.y = y;
  27 this.width = width;
  28 this.height = height;
  29 this.alignWithPanel = alignWithPanel;
  30 this.colourWithAlignPanel = colourWithAlignPanel;
  31 this.colourByViewer = colourByViewer;
  32 this.viewId = viewId;
  33 this.type = type;
  34 }, "~N,~N,~N,~N,~B,~B,~B,~S,~S");
  35 Clazz.defineMethod (c$, "getX",
  36 function () {
  37 return this.x;
  38 });
  39 Clazz.defineMethod (c$, "setX",
  40 function (x) {
  41 this.x = x;
  42 }, "~N");
  43 Clazz.defineMethod (c$, "getY",
  44 function () {
  45 return this.y;
  46 });
  47 Clazz.defineMethod (c$, "setY",
  48 function (y) {
  49 this.y = y;
  50 }, "~N");
  51 Clazz.defineMethod (c$, "getWidth",
  52 function () {
  53 return this.width;
  54 });
  55 Clazz.defineMethod (c$, "setWidth",
  56 function (width) {
  57 this.width = width;
  58 }, "~N");
  59 Clazz.defineMethod (c$, "getHeight",
  60 function () {
  61 return this.height;
  62 });
  63 Clazz.defineMethod (c$, "setHeight",
  64 function (height) {
  65 this.height = height;
  66 }, "~N");
  67 Clazz.defineMethod (c$, "isAlignWithPanel",
  68 function () {
  69 return this.alignWithPanel;
  70 });
  71 Clazz.defineMethod (c$, "setAlignWithPanel",
  72 function (alignWithPanel) {
  73 this.alignWithPanel = alignWithPanel;
  74 }, "~B");
  75 Clazz.defineMethod (c$, "isColourWithAlignPanel",
  76 function () {
  77 return this.colourWithAlignPanel;
  78 });
  79 Clazz.defineMethod (c$, "setColourWithAlignPanel",
  80 function (colourWithAlignPanel) {
  81 this.colourWithAlignPanel = colourWithAlignPanel;
  82 }, "~B");
  83 Clazz.defineMethod (c$, "isColourByViewer",
  84 function () {
  85 return this.colourByViewer;
  86 });
  87 Clazz.defineMethod (c$, "setColourByViewer",
  88 function (colourByViewer) {
  89 this.colourByViewer = colourByViewer;
  90 }, "~B");
  91 Clazz.defineMethod (c$, "getStateData",
  92 function () {
  93 return this.stateData;
  94 });
  95 Clazz.defineMethod (c$, "setStateData",
  96 function (stateData) {
  97 this.stateData = stateData;
  98 }, "~S");
  99 Clazz.defineMethod (c$, "getFileData",
 100 function () {
 101 return this.fileData;
 102 });
 103 Clazz.defineMethod (c$, "setFileData",
 104 function (fileData) {
 105 this.fileData = fileData;
 106 }, "java.util.Map");
 107 Clazz.defineMethod (c$, "getViewId",
 108 function () {
 109 return this.viewId;
 110 });
 111 Clazz.defineMethod (c$, "getType",
 112 function () {
 113 return this.type;
 114 });
 115 c$.$StructureViewerModel$StructureData$ = function () {
 116 Clazz.pu$h ();
 117 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
 118 Clazz.prepareCallback (this, arguments);
 119 this.filePath = null;
 120 this.pdbId = null;
 121 this.seqList = null;
 122 Clazz.instantialize (this, arguments);
 123 }, jalview.datamodel.StructureViewerModel, "StructureData");
 124 Clazz.makeConstructor (c$,
 125 function (a, b) {
 126 this.filePath = a;
 127 this.pdbId = b;
 128 this.seqList =  new java.util.ArrayList ();
 129 }, "~S,~S");
 130 Clazz.defineMethod (c$, "getFilePath",
 131 function () {
 132 return this.filePath;
 133 });
 134 Clazz.defineMethod (c$, "setFilePath",
 135 function (a) {
 136 this.filePath = a;
 137 }, "~S");
 138 Clazz.defineMethod (c$, "getPdbId",
 139 function () {
 140 return this.pdbId;
 141 });
 142 Clazz.defineMethod (c$, "setPdbId",
 143 function (a) {
 144 this.pdbId = a;
 145 }, "~S");
 146 Clazz.defineMethod (c$, "getSeqList",
 147 function () {
 148 return this.seqList;
 149 });
 150 Clazz.defineMethod (c$, "setSeqList",
 151 function (a) {
 152 this.seqList = a;
 153 }, "java.util.List");
 154 c$ = Clazz.p0p ();
 155 };
 156 });