bin/jalview/util/Format.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.util");
   2 Clazz.load (null, "jalview.util.Format", ["java.lang.Character", "$.IllegalArgumentException", "$.StringBuffer"], function () {
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
   4 this.width = 0;
   5 this.precision = 0;
   6 this.pre = null;
   7 this.post = null;
   8 this.leading_zeroes = false;
   9 this.show_plus = false;
  10 this.alternate = false;
  11 this.show_space = false;
  12 this.left_align = false;
  13 this.fmt = '\0';
  14 this.formatString = null;
  15 Clazz.instantialize (this, arguments);
  16 }, jalview.util, "Format");
  17 Clazz.makeConstructor (c$,
  18 function (s) {
  19 this.formatString = s;
  20 this.width = 0;
  21 this.precision = -1;
  22 this.pre = "";
  23 this.post = "";
  24 this.leading_zeroes = false;
  25 this.show_plus = false;
  26 this.alternate = false;
  27 this.show_space = false;
  28 this.left_align = false;
  29 this.fmt = ' ';
  30 var length = s.length;
  31 var parse_state = 0;
  32 var i = 0;
  33 while (parse_state == 0) {
  34 if (i >= length) {
  35 parse_state = 5;
  36 } else if (s.charAt (i) == '%') {
  37 if (i < (length - 1)) {
  38 if (s.charAt (i + 1) == '%') {
  39 this.pre = this.pre + '%';
  40 i++;
  41 } else {
  42 parse_state = 1;
  43 }} else {
  44 throw  new IllegalArgumentException ();
  45 }} else {
  46 this.pre = this.pre + s.charAt (i);
  47 }i++;
  48 }
  49 while (parse_state == 1) {
  50 if (i >= length) {
  51 parse_state = 5;
  52 } else if (s.charAt (i) == ' ') {
  53 this.show_space = true;
  54 } else if (s.charAt (i) == '-') {
  55 this.left_align = true;
  56 } else if (s.charAt (i) == '+') {
  57 this.show_plus = true;
  58 } else if (s.charAt (i) == '0') {
  59 this.leading_zeroes = true;
  60 } else if (s.charAt (i) == '#') {
  61 this.alternate = true;
  62 } else {
  63 parse_state = 2;
  64 i--;
  65 }i++;
  66 }
  67 while (parse_state == 2) {
  68 if (i >= length) {
  69 parse_state = 5;
  70 } else if (('0' <= s.charAt (i)) && (s.charAt (i) <= '9')) {
  71 this.width = ((this.width * 10) + s.charCodeAt (i)) - 48;
  72 i++;
  73 } else if (s.charAt (i) == '.') {
  74 parse_state = 3;
  75 this.precision = 0;
  76 i++;
  77 } else {
  78 parse_state = 4;
  79 }}
  80 while (parse_state == 3) {
  81 if (i >= length) {
  82 parse_state = 5;
  83 } else if (('0' <= s.charAt (i)) && (s.charAt (i) <= '9')) {
  84 this.precision = ((this.precision * 10) + s.charCodeAt (i)) - 48;
  85 i++;
  86 } else {
  87 parse_state = 4;
  88 }}
  89 if (parse_state == 4) {
  90 if (i >= length) {
  91 parse_state = 5;
  92 } else {
  93 this.fmt = s.charAt (i);
  94 }i++;
  95 }if (i < length) {
  96 this.post = s.substring (i, length);
  97 }}, "~S");
  98 c$.getHexString = Clazz.defineMethod (c$, "getHexString",
  99 function (color) {
 100 var r;
 101 var g;
 102 var b;
 103 r = Integer.toHexString (color.getRed ());
 104 if (r.length < 2) {
 105 r = "0" + r;
 106 }g = Integer.toHexString (color.getGreen ());
 107 if (g.length < 2) {
 108 g = "0" + g;
 109 }b = Integer.toHexString (color.getBlue ());
 110 if (b.length < 2) {
 111 b = "0" + b;
 112 }return r + g + b;
 113 }, "java.awt.Color");
 114 c$.printDouble = Clazz.defineMethod (c$, "printDouble",
 115 function (s, fmt, x) {
 116 s.print ( new jalview.util.Format (fmt).formDouble (x));
 117 }, "java.io.PrintStream,~S,~N");
 118 c$.printLong = Clazz.defineMethod (c$, "printLong",
 119 function (s, fmt, x) {
 120 s.print ( new jalview.util.Format (fmt).formLong (x));
 121 }, "java.io.PrintStream,~S,~N");
 122 c$.printChar = Clazz.defineMethod (c$, "printChar",
 123 function (s, fmt, x) {
 124 s.print ( new jalview.util.Format (fmt).formChar (x));
 125 }, "java.io.PrintStream,~S,~S");
 126 c$.print = Clazz.defineMethod (c$, "print",
 127 function (s, fmt, x) {
 128 s.print ( new jalview.util.Format (fmt).form (x));
 129 }, "java.io.PrintStream,~S,~S");
 130 c$.atoi = Clazz.defineMethod (c$, "atoi",
 131 function (s) {
 132 return jalview.util.Format.atol (s);
 133 }, "~S");
 134 c$.atol = Clazz.defineMethod (c$, "atol",
 135 function (s) {
 136 var i = 0;
 137 while ((i < s.length) && Character.isWhitespace (s.charAt (i))) {
 138 i++;
 139 }
 140 if ((i < s.length) && (s.charAt (i) == '0')) {
 141 if (((i + 1) < s.length) && ((s.charAt (i + 1) == 'x') || (s.charAt (i + 1) == 'X'))) {
 142 return jalview.util.Format.parseLong (s.substring (i + 2), 16);
 143 } else {
 144 return jalview.util.Format.parseLong (s, 8);
 145 }} else {
 146 return jalview.util.Format.parseLong (s, 10);
 147 }}, "~S");
 148 c$.parseLong = Clazz.defineMethod (c$, "parseLong",
 149 ($fz = function (s, base) {
 150 var i = 0;
 151 var sign = 1;
 152 var r = 0;
 153 while ((i < s.length) && Character.isWhitespace (s.charAt (i))) {
 154 i++;
 155 }
 156 if ((i < s.length) && (s.charAt (i) == '-')) {
 157 sign = -1;
 158 i++;
 159 } else if ((i < s.length) && (s.charAt (i) == '+')) {
 160 i++;
 161 }while (i < s.length) {
 162 var ch = s.charAt (i);
 163 if (('0' <= ch) && (ch.charCodeAt (0) < (48 + base))) {
 164 r = ((r * base) + ch.charCodeAt (0)) - 48;
 165 } else if (('A' <= ch) && (ch.charCodeAt (0) < ((65 + base) - 10))) {
 166 r = ((r * base) + ch.charCodeAt (0)) - 65 + 10;
 167 } else if (('a' <= ch) && (ch.charCodeAt (0) < ((97 + base) - 10))) {
 168 r = ((r * base) + ch.charCodeAt (0)) - 97 + 10;
 169 } else {
 170 return r * sign;
 171 }i++;
 172 }
 173 return r * sign;
 174 }, $fz.isPrivate = true, $fz), "~S,~N");
 175 c$.atof = Clazz.defineMethod (c$, "atof",
 176 function (s) {
 177 var i = 0;
 178 var sign = 1;
 179 var r = 0;
 180 var p = 1;
 181 var state = 0;
 182 while ((i < s.length) && Character.isWhitespace (s.charAt (i))) {
 183 i++;
 184 }
 185 if ((i < s.length) && (s.charAt (i) == '-')) {
 186 sign = -1;
 187 i++;
 188 } else if ((i < s.length) && (s.charAt (i) == '+')) {
 189 i++;
 190 }while (i < s.length) {
 191 var ch = s.charAt (i);
 192 if (('0' <= ch) && (ch <= '9')) {
 193 if (state == 0) {
 194 r = ((r * 10) + ch.charCodeAt (0)) - 48;
 195 } else if (state == 1) {
 196 p = p / 10;
 197 r = r + (p * (ch.charCodeAt (0) - 48));
 198 }} else if (ch == '.') {
 199 if (state == 0) {
 200 state = 1;
 201 } else {
 202 return sign * r;
 203 }} else if ((ch == 'e') || (ch == 'E')) {
 204 var e = jalview.util.Format.parseLong (s.substring (i + 1), 10);
 205 return sign * r * Math.pow (10, e);
 206 } else {
 207 return sign * r;
 208 }i++;
 209 }
 210 return sign * r;
 211 }, "~S");
 212 Clazz.defineMethod (c$, "formDouble",
 213 function (x) {
 214 var r;
 215 if (this.precision < 0) {
 216 this.precision = 6;
 217 }var s = 1;
 218 if (x < 0) {
 219 x = -x;
 220 s = -1;
 221 }if (this.fmt == 'f') {
 222 r = this.fixed_format (x);
 223 } else if ((this.fmt == 'e') || (this.fmt == 'E') || (this.fmt == 'g') || (this.fmt == 'G')) {
 224 r = this.exp_format (x);
 225 } else {
 226 throw  new IllegalArgumentException ();
 227 }return this.pad (this.sign (s, r));
 228 }, "~N");
 229 Clazz.defineMethod (c$, "formLong",
 230 function (x) {
 231 var r;
 232 var s = 0;
 233 if ((this.fmt == 'd') || (this.fmt == 'i')) {
 234 if (x < 0) {
 235 r = ("" + x).substring (1);
 236 s = -1;
 237 } else {
 238 r = "" + x;
 239 s = 1;
 240 }} else if (this.fmt == 'o') {
 241 r = jalview.util.Format.convert (x, 3, 7, "01234567");
 242 } else if (this.fmt == 'x') {
 243 r = jalview.util.Format.convert (x, 4, 15, "0123456789abcdef");
 244 } else if (this.fmt == 'X') {
 245 r = jalview.util.Format.convert (x, 4, 15, "0123456789ABCDEF");
 246 } else {
 247 throw  new IllegalArgumentException ();
 248 }return this.pad (this.sign (s, r));
 249 }, "~N");
 250 Clazz.defineMethod (c$, "formChar",
 251 function (c) {
 252 if (this.fmt != 'c') {
 253 throw  new IllegalArgumentException ();
 254 }var r = "" + c;
 255 return this.pad (r);
 256 }, "~S");
 257 Clazz.defineMethod (c$, "form",
 258 function (s) {
 259 if (this.fmt != 's') {
 260 throw  new IllegalArgumentException ();
 261 }if (this.precision >= 0) {
 262 s = s.substring (0, this.precision);
 263 }return this.pad (s);
 264 }, "~S");
 265 c$.repeat = Clazz.defineMethod (c$, "repeat",
 266 ($fz = function (c, n) {
 267 if (n <= 0) {
 268 return "";
 269 }var s =  new StringBuffer (n);
 270 for (var i = 0; i < n; i++) {
 271 s.append (c);
 272 }
 273 return s.toString ();
 274 }, $fz.isPrivate = true, $fz), "~S,~N");
 275 c$.convert = Clazz.defineMethod (c$, "convert",
 276 ($fz = function (x, n, m, d) {
 277 if (x == 0) {
 278 return "0";
 279 }var r = "";
 280 while (x != 0) {
 281 r = d.charAt ((x & m)) + r;
 282 x = x >>> n;
 283 }
 284 return r;
 285 }, $fz.isPrivate = true, $fz), "~N,~N,~N,~S");
 286 Clazz.defineMethod (c$, "pad",
 287 ($fz = function (r) {
 288 var p = jalview.util.Format.repeat (' ', this.width - r.length);
 289 if (this.left_align) {
 290 return this.pre + r + p + this.post;
 291 } else {
 292 return this.pre + p + r + this.post;
 293 }}, $fz.isPrivate = true, $fz), "~S");
 294 Clazz.defineMethod (c$, "sign",
 295 ($fz = function (s, r) {
 296 var p = "";
 297 if (s < 0) {
 298 p = "-";
 299 } else if (s > 0) {
 300 if (this.show_plus) {
 301 p = "+";
 302 } else if (this.show_space) {
 303 p = " ";
 304 }} else {
 305 if ((this.fmt == 'o') && this.alternate && (r.length > 0) && (r.charAt (0) != '0')) {
 306 p = "0";
 307 } else if ((this.fmt == 'x') && this.alternate) {
 308 p = "0x";
 309 } else if ((this.fmt == 'X') && this.alternate) {
 310 p = "0X";
 311 }}var w = 0;
 312 if (this.leading_zeroes) {
 313 w = this.width;
 314 } else if (((this.fmt == 'd') || (this.fmt == 'i') || (this.fmt == 'x') || (this.fmt == 'X') || (this.fmt == 'o')) && (this.precision > 0)) {
 315 w = this.precision;
 316 }return p + jalview.util.Format.repeat ('0', w - p.length - r.length) + r;
 317 }, $fz.isPrivate = true, $fz), "~N,~S");
 318 Clazz.defineMethod (c$, "fixed_format",
 319 ($fz = function (d) {
 320 var removeTrailing = ((this.fmt == 'G') || (this.fmt == 'g')) && !this.alternate;
 321 if (d > 0x7FFFFFFFFFFFFFFF) {
 322 return this.exp_format (d);
 323 }if (this.precision == 0) {
 324 return Clazz.doubleToLong (d + 0.5) + (removeTrailing ? "" : ".");
 325 }var whole = Clazz.doubleToLong (d);
 326 var fr = d - whole;
 327 if ((fr >= 1) || (fr < 0)) {
 328 return this.exp_format (d);
 329 }var factor = 1;
 330 var leading_zeroes = "";
 331 for (var i = 1; (i <= this.precision) && (factor <= 0x7FFFFFFFFFFFFFFF); i++) {
 332 factor *= 10;
 333 leading_zeroes = leading_zeroes + "0";
 334 }
 335 var l = Clazz.doubleToLong ((factor * fr) + 0.5);
 336 if (l >= factor) {
 337 l = 0;
 338 whole++;
 339 }var z = leading_zeroes + l;
 340 z = "." + z.substring (z.length - this.precision, z.length);
 341 if (removeTrailing) {
 342 var t = z.length - 1;
 343 while ((t >= 0) && (z.charAt (t) == '0')) {
 344 t--;
 345 }
 346 if ((t >= 0) && (z.charAt (t) == '.')) {
 347 t--;
 348 }z = z.substring (0, t + 1);
 349 }return whole + z;
 350 }, $fz.isPrivate = true, $fz), "~N");
 351 Clazz.defineMethod (c$, "exp_format",
 352 ($fz = function (d) {
 353 var f = "";
 354 var e = 0;
 355 var dd = d;
 356 var factor = 1;
 357 if (d != 0) {
 358 while (dd > 10) {
 359 e++;
 360 factor /= 10;
 361 dd = dd / 10;
 362 }
 363 while (dd < 1) {
 364 e--;
 365 factor *= 10;
 366 dd = dd * 10;
 367 }
 368 }if (((this.fmt == 'g') || (this.fmt == 'G')) && (e >= -4) && (e < this.precision)) {
 369 return this.fixed_format (d);
 370 }d = d * factor;
 371 f = f + this.fixed_format (d);
 372 if ((this.fmt == 'e') || (this.fmt == 'g')) {
 373 f = f + "e";
 374 } else {
 375 f = f + "E";
 376 }var p = "000";
 377 if (e >= 0) {
 378 f = f + "+";
 379 p = p + e;
 380 } else {
 381 f = f + "-";
 382 p = p + (-e);
 383 }return f + p.substring (p.length - 3, p.length);
 384 }, $fz.isPrivate = true, $fz), "~N");
 385 Clazz.overrideMethod (c$, "toString",
 386 function () {
 387 return this.formatString;
 388 });
 389 });