bin/jalview/viewmodel/annotationfilter/AnnotationFilterParameter.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.viewmodel.annotationfilter");\r
   2 Clazz.load (["java.lang.Enum", "java.util.ArrayList"], "jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter", null, function () {\r
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
   4 this.thresholdType = null;\r
   5 this.thresholdValue = 0;\r
   6 this.filterAlphaHelix = false;\r
   7 this.filterBetaSheet = false;\r
   8 this.filterTurn = false;\r
   9 this.regexString = null;\r
  10 this.regexSearchFields = null;\r
  11 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
  12 }, jalview.viewmodel.annotationfilter, "AnnotationFilterParameter");\r
  13 Clazz.prepareFields (c$, function () {\r
  14 this.regexSearchFields =  new java.util.ArrayList ();\r
  15 });\r
  16 Clazz.defineMethod (c$, "getThresholdType", \r
  17 function () {\r
  18 return this.thresholdType;\r
  19 });\r
  20 Clazz.defineMethod (c$, "setThresholdType", \r
  21 function (thresholdType) {\r
  22 this.thresholdType = thresholdType;\r
  23 }, "jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter.ThresholdType");\r
  24 Clazz.defineMethod (c$, "getThresholdValue", \r
  25 function () {\r
  26 return this.thresholdValue;\r
  27 });\r
  28 Clazz.defineMethod (c$, "setThresholdValue", \r
  29 function (thresholdValue) {\r
  30 this.thresholdValue = thresholdValue;\r
  31 }, "~N");\r
  32 Clazz.defineMethod (c$, "getRegexString", \r
  33 function () {\r
  34 return this.regexString;\r
  35 });\r
  36 Clazz.defineMethod (c$, "setRegexString", \r
  37 function (regexString) {\r
  38 this.regexString = regexString;\r
  39 }, "~S");\r
  40 Clazz.defineMethod (c$, "getRegexSearchFields", \r
  41 function () {\r
  42 return this.regexSearchFields;\r
  43 });\r
  44 Clazz.defineMethod (c$, "addRegexSearchField", \r
  45 function (regexSearchField) {\r
  46 this.regexSearchFields.add (regexSearchField);\r
  47 }, "jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter.SearchableAnnotationField");\r
  48 Clazz.defineMethod (c$, "isFilterAlphaHelix", \r
  49 function () {\r
  50 return this.filterAlphaHelix;\r
  51 });\r
  52 Clazz.defineMethod (c$, "setFilterAlphaHelix", \r
  53 function (alphaHelix) {\r
  54 this.filterAlphaHelix = alphaHelix;\r
  55 }, "~B");\r
  56 Clazz.defineMethod (c$, "isFilterBetaSheet", \r
  57 function () {\r
  58 return this.filterBetaSheet;\r
  59 });\r
  60 Clazz.defineMethod (c$, "setFilterBetaSheet", \r
  61 function (betaSheet) {\r
  62 this.filterBetaSheet = betaSheet;\r
  63 }, "~B");\r
  64 Clazz.defineMethod (c$, "isFilterTurn", \r
  65 function () {\r
  66 return this.filterTurn;\r
  67 });\r
  68 Clazz.defineMethod (c$, "setFilterTurn", \r
  69 function (turn) {\r
  70 this.filterTurn = turn;\r
  71 }, "~B");\r
  72 Clazz.pu$h ();\r
  73 c$ = Clazz.declareType (jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter, "ThresholdType", Enum);\r
  74 Clazz.defineEnumConstant (c$, "NO_THRESHOLD", 0, []);\r
  75 Clazz.defineEnumConstant (c$, "BELOW_THRESHOLD", 1, []);\r
  76 Clazz.defineEnumConstant (c$, "ABOVE_THRESHOLD", 2, []);\r
  77 c$ = Clazz.p0p ();\r
  78 Clazz.pu$h ();\r
  79 c$ = Clazz.declareType (jalview.viewmodel.annotationfilter.AnnotationFilterParameter, "SearchableAnnotationField", Enum);\r
  80 Clazz.defineEnumConstant (c$, "DISPLAY_STRING", 0, []);\r
  81 Clazz.defineEnumConstant (c$, "DESCRIPTION", 1, []);\r
  82 c$ = Clazz.p0p ();\r
  83 });\r