site/j2s/jalview/commands/ChangeCaseCommand.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.commands");\r
   2 Clazz.load (["jalview.commands.CommandI"], "jalview.commands.ChangeCaseCommand", ["java.lang.StringBuffer"], function () {\r
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
   4 this.description = null;\r
   5 this.caseChange = -1;\r
   6 this.seqs = null;\r
   7 this.regions = null;\r
   8 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
   9 }, jalview.commands, "ChangeCaseCommand", null, jalview.commands.CommandI);\r
  10 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  11 function (description, seqs, regions, caseChange) {\r
  12 this.description = description;\r
  13 this.seqs = seqs;\r
  14 this.regions = regions;\r
  15 this.caseChange = caseChange;\r
  16 this.doCommand (null);\r
  17 }, "~S,~A,java.util.List,~N");\r
  18 Clazz.overrideMethod (c$, "getDescription", \r
  19 function () {\r
  20 return this.description;\r
  21 });\r
  22 Clazz.overrideMethod (c$, "getSize", \r
  23 function () {\r
  24 return 1;\r
  25 });\r
  26 Clazz.overrideMethod (c$, "doCommand", \r
  27 function (views) {\r
  28 this.changeCase (true);\r
  29 }, "~A");\r
  30 Clazz.overrideMethod (c$, "undoCommand", \r
  31 function (views) {\r
  32 this.changeCase (false);\r
  33 }, "~A");\r
  34 Clazz.defineMethod (c$, "changeCase", \r
  35 function (doCommand) {\r
  36 var sequence;\r
  37 var start;\r
  38 var end;\r
  39 var nextChar;\r
  40 for (var r, $r = this.regions.iterator (); $r.hasNext () && ((r = $r.next ()) || true);) {\r
  41 start = r[0];\r
  42 for (var s = 0; s < this.seqs.length; s++) {\r
  43 sequence = this.seqs[s].getSequenceAsString ();\r
  44 var newSeq =  new StringBuffer ();\r
  45 if (r[1] > sequence.length) {\r
  46 end = sequence.length;\r
  47 } else {\r
  48 end = r[1];\r
  49 }if (start > 0) {\r
  50 newSeq.append (sequence.substring (0, start));\r
  51 }if ((this.caseChange == jalview.commands.ChangeCaseCommand.TO_UPPER && doCommand) || (this.caseChange == jalview.commands.ChangeCaseCommand.TO_LOWER && !doCommand)) {\r
  52 newSeq.append (sequence.substring (start, end).toUpperCase ());\r
  53 } else if ((this.caseChange == jalview.commands.ChangeCaseCommand.TO_LOWER && doCommand) || (this.caseChange == jalview.commands.ChangeCaseCommand.TO_UPPER && !doCommand)) {\r
  54 newSeq.append (sequence.substring (start, end).toLowerCase ());\r
  55 } else {\r
  56 for (var c = start; c < end; c++) {\r
  57 nextChar = sequence.charAt (c);\r
  58 if ('a' <= nextChar && nextChar <= 'z') {\r
  59 nextChar = String.fromCharCode (nextChar.charCodeAt (0) - (32));\r
  60 } else if ('A' <= nextChar && nextChar <= 'Z') {\r
  61 nextChar = String.fromCharCode (nextChar.charCodeAt (0) + (32));\r
  62 }newSeq.append (nextChar);\r
  63 }\r
  64 }if (end < sequence.length) {\r
  65 newSeq.append (sequence.substring (end));\r
  66 }this.seqs[s].setSequence (newSeq.toString ());\r
  67 }\r
  68 }\r
  69 }, "~B");\r
  70 Clazz.defineStatics (c$,\r
  71 "TO_LOWER", 0,\r
  72 "TO_UPPER", 1,\r
  73 "TOGGLE_CASE", 2);\r
  74 });\r