site/j2s/jalview/commands/OrderCommand.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.commands");\r
   2 Clazz.load (["jalview.commands.CommandI"], "jalview.commands.OrderCommand", ["jalview.analysis.AlignmentSorter"], function () {\r
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
   4 this.description = null;\r
   5 this.seqs = null;\r
   6 this.seqs2 = null;\r
   7 this.al = null;\r
   8 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
   9 }, jalview.commands, "OrderCommand", null, jalview.commands.CommandI);\r
  10 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  11 function (description, seqs, al) {\r
  12 this.description = description;\r
  13 this.seqs = seqs;\r
  14 this.seqs2 = al.getSequencesArray ();\r
  15 this.al = al;\r
  16 this.doCommand (null);\r
  17 }, "~S,~A,jalview.datamodel.AlignmentI");\r
  18 Clazz.overrideMethod (c$, "getDescription", \r
  19 function () {\r
  20 return this.description;\r
  21 });\r
  22 Clazz.overrideMethod (c$, "getSize", \r
  23 function () {\r
  24 return 1;\r
  25 });\r
  26 Clazz.overrideMethod (c$, "doCommand", \r
  27 function (views) {\r
  28 jalview.analysis.AlignmentSorter.setOrder (this.al, this.seqs2);\r
  29 }, "~A");\r
  30 Clazz.overrideMethod (c$, "undoCommand", \r
  31 function (views) {\r
  32 jalview.analysis.AlignmentSorter.setOrder (this.al, this.seqs);\r
  33 }, "~A");\r
  34 Clazz.defineMethod (c$, "getSequenceOrder", \r
  35 function (undo) {\r
  36 return undo ? this.seqs : this.seqs2;\r
  37 }, "~B");\r
  38 });\r