site/j2s/jalview/datamodel/StructureViewerModel.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.datamodel");\r
   2 Clazz.load (["java.util.HashMap"], "jalview.datamodel.StructureViewerModel", ["java.util.ArrayList"], function () {\r
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
   4 this.x = 0;\r
   5 this.y = 0;\r
   6 this.width = 0;\r
   7 this.height = 0;\r
   8 this.alignWithPanel = false;\r
   9 this.colourWithAlignPanel = false;\r
  10 this.colourByViewer = false;\r
  11 this.stateData = "";\r
  12 this.viewId = null;\r
  13 this.type = null;\r
  14 this.fileData = null;\r
  15 if (!Clazz.isClassDefined ("jalview.datamodel.StructureViewerModel.StructureData")) {\r
  16 jalview.datamodel.StructureViewerModel.$StructureViewerModel$StructureData$ ();\r
  17 }\r
  18 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
  19 }, jalview.datamodel, "StructureViewerModel");\r
  20 Clazz.prepareFields (c$, function () {\r
  21 this.fileData =  new java.util.HashMap ();\r
  22 });\r
  23 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  24 function (x, y, width, height, alignWithPanel, colourWithAlignPanel, colourByViewer, viewId, type) {\r
  25 this.x = x;\r
  26 this.y = y;\r
  27 this.width = width;\r
  28 this.height = height;\r
  29 this.alignWithPanel = alignWithPanel;\r
  30 this.colourWithAlignPanel = colourWithAlignPanel;\r
  31 this.colourByViewer = colourByViewer;\r
  32 this.viewId = viewId;\r
  33 this.type = type;\r
  34 }, "~N,~N,~N,~N,~B,~B,~B,~S,~S");\r
  35 Clazz.defineMethod (c$, "getX", \r
  36 function () {\r
  37 return this.x;\r
  38 });\r
  39 Clazz.defineMethod (c$, "setX", \r
  40 function (x) {\r
  41 this.x = x;\r
  42 }, "~N");\r
  43 Clazz.defineMethod (c$, "getY", \r
  44 function () {\r
  45 return this.y;\r
  46 });\r
  47 Clazz.defineMethod (c$, "setY", \r
  48 function (y) {\r
  49 this.y = y;\r
  50 }, "~N");\r
  51 Clazz.defineMethod (c$, "getWidth", \r
  52 function () {\r
  53 return this.width;\r
  54 });\r
  55 Clazz.defineMethod (c$, "setWidth", \r
  56 function (width) {\r
  57 this.width = width;\r
  58 }, "~N");\r
  59 Clazz.defineMethod (c$, "getHeight", \r
  60 function () {\r
  61 return this.height;\r
  62 });\r
  63 Clazz.defineMethod (c$, "setHeight", \r
  64 function (height) {\r
  65 this.height = height;\r
  66 }, "~N");\r
  67 Clazz.defineMethod (c$, "isAlignWithPanel", \r
  68 function () {\r
  69 return this.alignWithPanel;\r
  70 });\r
  71 Clazz.defineMethod (c$, "setAlignWithPanel", \r
  72 function (alignWithPanel) {\r
  73 this.alignWithPanel = alignWithPanel;\r
  74 }, "~B");\r
  75 Clazz.defineMethod (c$, "isColourWithAlignPanel", \r
  76 function () {\r
  77 return this.colourWithAlignPanel;\r
  78 });\r
  79 Clazz.defineMethod (c$, "setColourWithAlignPanel", \r
  80 function (colourWithAlignPanel) {\r
  81 this.colourWithAlignPanel = colourWithAlignPanel;\r
  82 }, "~B");\r
  83 Clazz.defineMethod (c$, "isColourByViewer", \r
  84 function () {\r
  85 return this.colourByViewer;\r
  86 });\r
  87 Clazz.defineMethod (c$, "setColourByViewer", \r
  88 function (colourByViewer) {\r
  89 this.colourByViewer = colourByViewer;\r
  90 }, "~B");\r
  91 Clazz.defineMethod (c$, "getStateData", \r
  92 function () {\r
  93 return this.stateData;\r
  94 });\r
  95 Clazz.defineMethod (c$, "setStateData", \r
  96 function (stateData) {\r
  97 this.stateData = stateData;\r
  98 }, "~S");\r
  99 Clazz.defineMethod (c$, "getFileData", \r
 100 function () {\r
 101 return this.fileData;\r
 102 });\r
 103 Clazz.defineMethod (c$, "setFileData", \r
 104 function (fileData) {\r
 105 this.fileData = fileData;\r
 106 }, "java.util.Map");\r
 107 Clazz.defineMethod (c$, "getViewId", \r
 108 function () {\r
 109 return this.viewId;\r
 110 });\r
 111 Clazz.defineMethod (c$, "getType", \r
 112 function () {\r
 113 return this.type;\r
 114 });\r
 115 c$.$StructureViewerModel$StructureData$ = function () {\r
 116 Clazz.pu$h(self.c$);\r
 117 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
 118 Clazz.prepareCallback (this, arguments);\r
 119 this.filePath = null;\r
 120 this.pdbId = null;\r
 121 this.seqList = null;\r
 122 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
 123 }, jalview.datamodel.StructureViewerModel, "StructureData");\r
 124 Clazz.makeConstructor (c$, \r
 125 function (a, b) {\r
 126 this.filePath = a;\r
 127 this.pdbId = b;\r
 128 this.seqList =  new java.util.ArrayList ();\r
 129 }, "~S,~S");\r
 130 Clazz.defineMethod (c$, "getFilePath", \r
 131 function () {\r
 132 return this.filePath;\r
 133 });\r
 134 Clazz.defineMethod (c$, "setFilePath", \r
 135 function (a) {\r
 136 this.filePath = a;\r
 137 }, "~S");\r
 138 Clazz.defineMethod (c$, "getPdbId", \r
 139 function () {\r
 140 return this.pdbId;\r
 141 });\r
 142 Clazz.defineMethod (c$, "setPdbId", \r
 143 function (a) {\r
 144 this.pdbId = a;\r
 145 }, "~S");\r
 146 Clazz.defineMethod (c$, "getSeqList", \r
 147 function () {\r
 148 return this.seqList;\r
 149 });\r
 150 Clazz.defineMethod (c$, "setSeqList", \r
 151 function (a) {\r
 152 this.seqList = a;\r
 153 }, "java.util.List");\r
 154 c$ = Clazz.p0p ();\r
 155 };\r
 156 });\r