site/j2s/jalview/viewmodel/seqfeatures/FeaturesDisplayed.js

   1 Clazz.declarePackage ("jalview.viewmodel.seqfeatures");\r
   2 Clazz.load (["jalview.api.FeaturesDisplayedI", "java.util.HashSet"], "jalview.viewmodel.seqfeatures.FeaturesDisplayed", null, function () {\r
   3 c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
   4 this.featuresDisplayed = null;\r
   5 this.featuresRegistered = null;\r
   6 Clazz.instantialize (this, arguments);\r
   7 }, jalview.viewmodel.seqfeatures, "FeaturesDisplayed", null, jalview.api.FeaturesDisplayedI);\r
   8 Clazz.prepareFields (c$, function () {\r
   9 this.featuresDisplayed =  new java.util.HashSet ();\r
  10 this.featuresRegistered =  new java.util.HashSet ();\r
  11 });\r
  12 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  13 function (featuresDisplayed2) {\r
  14 var fdisp = featuresDisplayed2.getVisibleFeatures ();\r
  15 var ftype;\r
  16 while (fdisp.hasNext ()) {\r
  17 ftype = fdisp.next ();\r
  18 this.featuresDisplayed.add (ftype);\r
  19 this.featuresRegistered.add (ftype);\r
  20 }\r
  21 }, "jalview.api.FeaturesDisplayedI");\r
  22 Clazz.makeConstructor (c$, \r
  23 function () {\r
  24 });\r
  25 Clazz.defineMethod (c$, "getVisibleFeatures", \r
  26 function () {\r
  27 return this.featuresDisplayed.iterator ();\r
  28 });\r
  29 Clazz.overrideMethod (c$, "isVisible", \r
  30 function (featureType) {\r
  31 return this.featuresDisplayed.contains (featureType);\r
  32 }, "~S");\r
  33 Clazz.overrideMethod (c$, "areVisible", \r
  34 function (featureTypes) {\r
  35 return this.featuresDisplayed.containsAll (featureTypes);\r
  36 }, "java.util.Collection");\r
  37 Clazz.overrideMethod (c$, "clear", \r
  38 function () {\r
  39 this.featuresDisplayed.clear ();\r
  40 this.featuresRegistered.clear ();\r
  41 });\r
  42 Clazz.overrideMethod (c$, "setAllVisible", \r
  43 function (makeVisible) {\r
  44 this.featuresDisplayed.addAll (makeVisible);\r
  45 this.featuresRegistered.addAll (makeVisible);\r
  46 }, "java.util.Collection");\r
  47 Clazz.overrideMethod (c$, "setAllRegisteredVisible", \r
  48 function () {\r
  49 this.featuresDisplayed.addAll (this.featuresRegistered);\r
  50 });\r
  51 Clazz.overrideMethod (c$, "setVisible", \r
  52 function (featureType) {\r
  53 this.featuresDisplayed.add (featureType);\r
  54 this.featuresRegistered.add (featureType);\r
  55 }, "~S");\r
  56 Clazz.overrideMethod (c$, "isRegistered", \r
  57 function (type) {\r
  58 return this.featuresRegistered.contains (type);\r
  59 }, "~S");\r
  60 Clazz.overrideMethod (c$, "getVisibleFeatureCount", \r
  61 function () {\r
  62 return this.featuresDisplayed.size ();\r
  63 });\r
  64 Clazz.overrideMethod (c$, "getRegisterdFeaturesCount", \r
  65 function () {\r
  66 return this.featuresRegistered.size ();\r
  67 });\r
  68 });\r