Merge branch 'master' of https://source.jalview.org/git/jalviewjs.git
[jalviewjs.git] / site / j2s / jalview / commands / OrderCommand.js
index c85c70b..8939653 100644 (file)
@@ -1,38 +1,38 @@
-Clazz.declarePackage ("jalview.commands");\r
-Clazz.load (["jalview.commands.CommandI"], "jalview.commands.OrderCommand", ["jalview.analysis.AlignmentSorter"], function () {\r
-c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {\r
-this.description = null;\r
-this.seqs = null;\r
-this.seqs2 = null;\r
-this.al = null;\r
-Clazz.instantialize (this, arguments);\r
-}, jalview.commands, "OrderCommand", null, jalview.commands.CommandI);\r
-Clazz.makeConstructor (c$, \r
-function (description, seqs, al) {\r
-this.description = description;\r
-this.seqs = seqs;\r
-this.seqs2 = al.getSequencesArray ();\r
-this.al = al;\r
-this.doCommand (null);\r
-}, "~S,~A,jalview.datamodel.AlignmentI");\r
-Clazz.overrideMethod (c$, "getDescription", \r
-function () {\r
-return this.description;\r
-});\r
-Clazz.overrideMethod (c$, "getSize", \r
-function () {\r
-return 1;\r
-});\r
-Clazz.overrideMethod (c$, "doCommand", \r
-function (views) {\r
-jalview.analysis.AlignmentSorter.setOrder (this.al, this.seqs2);\r
-}, "~A");\r
-Clazz.overrideMethod (c$, "undoCommand", \r
-function (views) {\r
-jalview.analysis.AlignmentSorter.setOrder (this.al, this.seqs);\r
-}, "~A");\r
-Clazz.defineMethod (c$, "getSequenceOrder", \r
-function (undo) {\r
-return undo ? this.seqs : this.seqs2;\r
-}, "~B");\r
-});\r
+Clazz.declarePackage ("jalview.commands");
+Clazz.load (["jalview.commands.CommandI"], "jalview.commands.OrderCommand", ["jalview.analysis.AlignmentSorter"], function () {
+c$ = Clazz.decorateAsClass (function () {
+this.description = null;
+this.seqs = null;
+this.seqs2 = null;
+this.al = null;
+Clazz.instantialize (this, arguments);
+}, jalview.commands, "OrderCommand", null, jalview.commands.CommandI);
+Clazz.makeConstructor (c$, 
+function (description, seqs, al) {
+this.description = description;
+this.seqs = seqs;
+this.seqs2 = al.getSequencesArray ();
+this.al = al;
+this.doCommand (null);
+}, "~S,~A,jalview.datamodel.AlignmentI");
+Clazz.overrideMethod (c$, "getDescription", 
+function () {
+return this.description;
+});
+Clazz.overrideMethod (c$, "getSize", 
+function () {
+return 1;
+});
+Clazz.overrideMethod (c$, "doCommand", 
+function (views) {
+jalview.analysis.AlignmentSorter.setOrder (this.al, this.seqs2);
+}, "~A");
+Clazz.overrideMethod (c$, "undoCommand", 
+function (views) {
+jalview.analysis.AlignmentSorter.setOrder (this.al, this.seqs);
+}, "~A");
+Clazz.defineMethod (c$, "getSequenceOrder", 
+function (undo) {
+return undo ? this.seqs : this.seqs2;
+}, "~B");
+});