Merge branch 'master' of https://source.jalview.org/git/jalviewjs.git
[jalviewjs.git] / site / j2s / jalview / datamodel / SecondaryStructureAnnotation.js
index 6a35ad3..2d1eb58 100644 (file)
@@ -1,23 +1,23 @@
-Clazz.declarePackage ("jalview.datamodel");\r
-Clazz.load (["jalview.datamodel.AlignmentAnnotation"], "jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation", ["jalview.datamodel.Annotation"], function () {\r
-c$ = Clazz.declareType (jalview.datamodel, "SecondaryStructureAnnotation", jalview.datamodel.AlignmentAnnotation);\r
-Clazz.makeConstructor (c$, \r
-function (rna) {\r
-Clazz.superConstructor (this, jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation, ["Secondary Structure", "Un truc trop cool", jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation.getAnnotation (rna)]);\r
-jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation._rna = rna;\r
-}, "fr.orsay.lri.varna.models.rna.RNA");\r
-Clazz.defineMethod (c$, "getRNA", \r
-function () {\r
-return jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation._rna;\r
-});\r
-c$.getAnnotation = Clazz.defineMethod (c$, "getAnnotation", \r
-function (rna) {\r
-var ann =  new Array (rna.getSize ());\r
-for (var i = 0; i < ann.length; i++) {\r
-ann[i] =  new jalview.datamodel.Annotation (jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation._rna.getStructDBN (true), "", ' ', 0);\r
-;}\r
-return ann;\r
-}, "fr.orsay.lri.varna.models.rna.RNA");\r
-Clazz.defineStatics (c$,\r
-"_rna", null);\r
-});\r
+Clazz.declarePackage ("jalview.datamodel");
+Clazz.load (["jalview.datamodel.AlignmentAnnotation"], "jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation", ["jalview.datamodel.Annotation"], function () {
+c$ = Clazz.declareType (jalview.datamodel, "SecondaryStructureAnnotation", jalview.datamodel.AlignmentAnnotation);
+Clazz.makeConstructor (c$, 
+function (rna) {
+Clazz.superConstructor (this, jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation, ["Secondary Structure", "Un truc trop cool", jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation.getAnnotation (rna)]);
+jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation._rna = rna;
+}, "fr.orsay.lri.varna.models.rna.RNA");
+Clazz.defineMethod (c$, "getRNA", 
+function () {
+return jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation._rna;
+});
+c$.getAnnotation = Clazz.defineMethod (c$, "getAnnotation", 
+function (rna) {
+var ann =  new Array (rna.getSize ());
+for (var i = 0; i < ann.length; i++) {
+ann[i] =  new jalview.datamodel.Annotation (jalview.datamodel.SecondaryStructureAnnotation._rna.getStructDBN (true), "", ' ', 0);
+;}
+return ann;
+}, "fr.orsay.lri.varna.models.rna.RNA");
+Clazz.defineStatics (c$,
+"_rna", null);
+});