doc/developing.html

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   2  *Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  *Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  *This file is part of Jalview.
   6  *
   7  *Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  *modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  *as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  *of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  *Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  *WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  *of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  *PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  *You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  *along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  *The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
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  21 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
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  23  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
  24  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  25  *
  26  * This file is part of Jalview.
  27  *
  28  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  29  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  30  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  31  *
  32  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  33  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  34  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  35  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  36  *
  37  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  38  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  39 -->
  40 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
  41   <head>Developing Jalview</head>
  42   <body>
  43 <p><h1>Developing Jalview</h1>
  44 </p>
  45 <ul>
  46 <li>Basic Source Structure Guidelines</li>
  47 <li>The Applet and The Application - whats the difference ?</li>
  48 <li>Package Architecture<br>
  49 </li>
  50 <li>Specific  Development Guidelines
  51 <ul>
  52 <li><a href="newdmobj.html">Adding new datamodel objects to Jalview</a></li>
  53 <li>Adding new IO capabilities to Jalview</li>
  54 <li>Adding new database types to Jalview</li>
  55 <li>Working with the Jalview DAS annotation fetcher</li>
  56 <li>Adding new analysis methods to jalview</li>
  57 <li>Adding new web service functionality to jalview</li>
  58 </ul>
  59 </li>
  60 </ul>
  61 </body>
  62 </html>