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[jalview.git] / doc / developing.html
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2  *Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  *Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  *
5  *This file is part of Jalview.
6  *
7  *Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  *modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  *as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  *of the License, or (at your option) any later version.
11  * 
12  *Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  *WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  *of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  *PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  *
17  *You should have received a copy of the GNU General Public License
18  *along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  *The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20 -->
21 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
22 <!--
23  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
24  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
25  * 
26  * This file is part of Jalview.
27  * 
28  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
29  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
30  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
31  *  
32  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
33  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
34  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
35  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
36  * 
37  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
38  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
39 -->
40 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
41   <head>Developing Jalview</head>
42   <body>
43 <p><h1>Developing Jalview</h1>
44 </p>
45 <ul>
46 <li>Basic Source Structure Guidelines</li>
47 <li>The Applet and The Application - whats the difference ?</li>
48 <li>Package Architecture<br>
49 </li>
50 <li>Specific  Development Guidelines
51 <ul>
52 <li><a href="newdmobj.html">Adding new datamodel objects to Jalview</a></li>
53 <li>Adding new IO capabilities to Jalview</li>
54 <li>Adding new database types to Jalview</li>
55 <li>Working with the Jalview DAS annotation fetcher</li>
56 <li>Adding new analysis methods to jalview</li>
57 <li>Adding new web service functionality to jalview</li>
58 </ul>
59 </li>
60 </ul>
61 </body>
62 </html>