2.2 documentation
[jalview.git] / help / html / features / creatinFeatures.html
1 <html>\r
2 <head>\r
3 <title>Creating Sequence Features</title>\r
4 </head>\r
5 <body>\r
6 <strong>Creating Sequence Features</strong>\r
7 <p>Jalview can create sequence features from the matches of a <a\r
8         href="search.html">regular expression search</a>, or from the currently\r
9 selected area via the <strong>&quot;selection&#8594;Create\r
10 sequence feature&quot;</strong> entry in the selection area popup menu. In both\r
11 cases, the <strong>Create Features</strong> dialog box will then be\r
12 opened:</p>\r
13 <img src="crnewfeature.gif">\r
14 <p>Select or enter the attributes for the features being created,\r
15 and then press OK to create the new features.</p>\r
16 <p>Each attribute is described below:\r
17 <ul>\r
18         <li><strong>Sequence Feature Name</strong>\r
19         <p>Either give the new features a new name or use the menu to\r
20         re-use an existing feature name.</p>\r
21         </li>\r
22         <li><strong>Feature group</strong>\r
23         <p>Enter a new group name, or re-use an existing group from the\r
24         pull-down menu.</p>\r
25         </li>\r
26         <li><strong>Feature Colour</strong>\r
27         <p>Keep the existing colour for this feature's name and group, or\r
28         select the colour box to open a colour chooser to pick a different one.</p>\r
29         </li>\r
30         <li><strong>Description</strong>\r
31         <p>Enter a description for all the features being created. Each\r
32         feature defined on a sequence may have its own description that will be\r
33         displayed in the tooltip for the feature in that region.</p>\r
34         </li>\r
35 </ul>\r
36 </p><p><em>Sequence Feature Creation was introduced in Jalview Version 2.2</em></p>\r
37 </body>\r
38 </html>