help/html/features/creatinFeatures.html

   1 <html>
   2 <head>
   3 <title>Creating Sequence Features</title>
   4 </head>
   5 <body>
   6 <strong>Creating Sequence Features</strong>
   7 <p>Jalview can create sequence features from the matches of a <a
   8         href="search.html">regular expression search</a>, or from the currently
   9 selected area via the <strong>&quot;selection&#8594;Create
  10 sequence feature&quot;</strong> entry in the <a href="../menus/popupMenu.html">selection area popup menu</a>. In both
  11 cases, the <strong>Create Features</strong> dialog box will then be
  12 opened:</p>
  13 <p><img src="crnewfeature.gif"></p>
  14 <p>Select or enter the attributes for the features being created,
  15 and then press OK to create the new features.</p>
  16 <p>Each attribute is described below:
  17 <ul>
  18         <li><strong>Sequence Feature Name</strong>
  19         <p>Either give the new features a new name or use the menu to
  20         re-use an existing feature name.</p>
  21         </li>
  22         <li><strong>Feature group</strong>
  23         <p>Enter a new group name, or re-use an existing group from the
  24         pull-down menu.</p>
  25         </li>
  26         <li><strong>Feature Colour</strong>
  27         <p>Keep the existing colour for this feature's name and group, or
  28         select the colour box to open a colour chooser to pick a different one.</p>
  29         </li>
  30         <li><strong>Description</strong>
  31         <p>Enter a description for all the features being created. Each
  32         feature defined on a sequence may have its own description that will be
  33         displayed in the tooltip for the feature in that region.</p>
  34         </li>
  35 </ul>
  36 </p><p><em>Sequence Feature Creation was introduced in Jalview Version 2.2</em></p>
  37 </body>
  38 </html>