src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 package jalview.appletgui;\r
   2 \r
   3 import jalview.jbappletgui.GUserDefinedColours;\r
   4 import jalview.datamodel.*;\r
   5 import jalview.schemes.*;\r
   6 import jalview.io.*;\r
   7 import java.io.*;\r
   8 import java.awt.*;\r
   9 import java.awt.event.*;\r
  10 import java.util.*;\r
  11 \r
  12 \r
  13 public class UserDefinedColours extends GUserDefinedColours\r
  14 {\r
  15 \r
  16   AlignmentPanel ap;\r
  17   SequenceGroup seqGroup;\r
  18   Button selectedButton;\r
  19   Vector oldColours = new Vector();\r
  20   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  21   Frame frame;\r
  22 \r
  23   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  24 \r
  25   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  26   {\r
  27     super();\r
  28     frame = new Frame();\r
  29     frame.add(this);\r
  30     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420,345 );\r
  31 \r
  32     if(sg!=null)\r
  33         frame.setTitle( frame.getTitle()+ " ("+sg.getName()+")");\r
  34 \r
  35 \r
  36     this.ap = ap;\r
  37     seqGroup = sg;\r
  38 \r
  39 \r
  40       if (seqGroup != null)\r
  41         oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  42       else\r
  43         oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  44 \r
  45       for (int i = 0; i < 20; i++)\r
  46         makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
  47                    "", ResidueProperties.aa[i]);\r
  48 \r
  49       makeButton("B", "B");\r
  50       makeButton("Z", "Z");\r
  51       makeButton("X", "X");\r
  52       makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
  53 \r
  54   }\r
  55 \r
  56   protected void rText_actionPerformed(ActionEvent e) {\r
  57     try{\r
  58       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
  59       rScroller.setValue(i);\r
  60     }catch(NumberFormatException ex){}\r
  61   }\r
  62 \r
  63   protected void gText_actionPerformed(ActionEvent e) {\r
  64     try{\r
  65       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
  66       gScroller.setValue(i);\r
  67     }catch(NumberFormatException ex){}\r
  68 \r
  69   }\r
  70 \r
  71   protected void bText_actionPerformed(ActionEvent e) {\r
  72     try{\r
  73       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
  74       bScroller.setValue(i);\r
  75     }catch(NumberFormatException ex){}\r
  76 \r
  77   }\r
  78 \r
  79 \r
  80   protected void rScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
  81     R = rScroller.getValue();\r
  82     rText.setText(R+"");\r
  83     colourChanged();\r
  84   }\r
  85 \r
  86   protected void gScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
  87     G = gScroller.getValue();\r
  88     gText.setText(G+"");\r
  89     colourChanged();\r
  90   }\r
  91 \r
  92   protected void bScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
  93     B = bScroller.getValue();\r
  94     bText.setText(B+"");\r
  95     colourChanged();\r
  96   }\r
  97 \r
  98  public void colourChanged()\r
  99  {\r
 100    Color col = new Color(R,G,B);\r
 101    target.setBackground( col );\r
 102 \r
 103    if(selectedButton!=null)\r
 104      selectedButton.setBackground( col );\r
 105  }\r
 106 \r
 107   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 108   {\r
 109      selectedButton = (Button)e.getSource();\r
 110      Color col = selectedButton.getBackground();\r
 111      R = col.getRed();\r
 112      G = col.getGreen();\r
 113      B = col.getBlue();\r
 114      rScroller.setValue(R);\r
 115      gScroller.setValue(G);\r
 116      bScroller.setValue(B);\r
 117      rText.setText(R+"");\r
 118      gText.setText(G+"");\r
 119      bText.setText(B+"");\r
 120 \r
 121      colourChanged();\r
 122   }\r
 123 \r
 124   void makeButton(String label, String aa)\r
 125   {\r
 126     final Button button = new Button();\r
 127     Color col = Color.white;\r
 128 \r
 129 \r
 130     try{\r
 131       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
 132     }catch(Exception ex){}\r
 133 \r
 134     button.setBackground(  col );\r
 135     oldColours.addElement( col );\r
 136     button.setLabel( label );\r
 137     button.setForeground( col.darker().darker().darker() );\r
 138     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 139     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 140     {\r
 141       public void mouseClicked(MouseEvent e)\r
 142       {\r
 143         colourButtonPressed(e);\r
 144       }\r
 145     });\r
 146 \r
 147     buttonPanel.add(button, null);\r
 148   }\r
 149 \r
 150 \r
 151   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 152   {\r
 153     applyButton_actionPerformed(null);\r
 154    frame.setVisible(false);\r
 155   }\r
 156 \r
 157   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 158   {\r
 159 \r
 160     Color [] newColours = new Color[24];\r
 161     for(int i=0; i<24; i++)\r
 162     {\r
 163           Button button = (Button)buttonPanel.getComponent(i);\r
 164           newColours[i] = button.getBackground();\r
 165     }\r
 166 \r
 167     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme();\r
 168     ucs.setThreshold(0);\r
 169     ucs.setColourScheme( newColours );\r
 170 \r
 171     if(seqGroup!=null)\r
 172       seqGroup.cs = ucs;\r
 173     else\r
 174       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 175 \r
 176     ap.repaint();\r
 177   }\r
 178 \r
 179 \r
 180   public static UserColourScheme loadDefaultColours(String file)\r
 181   {\r
 182     UserColourScheme ucs = null;\r
 183     try\r
 184     {\r
 185       BufferedReader in = new BufferedReader(new FileReader(file));\r
 186       Color [] newColours = new Color[24];\r
 187       for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 188       {\r
 189         newColours[i] = new Color(Integer.parseInt(in.readLine()));\r
 190       }\r
 191 \r
 192       ucs = new UserColourScheme();\r
 193       ucs.setThreshold(0);\r
 194       ucs.setColourScheme(newColours);\r
 195 \r
 196     }\r
 197     catch (Exception ex)\r
 198     {}\r
 199 \r
 200     return ucs;\r
 201   }\r
 202 \r
 203 \r
 204   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 205   {\r
 206     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme();\r
 207     Color [] newColours = new Color[24];\r
 208     for(int i=0; i<24; i++)\r
 209     {\r
 210           newColours[i] = (Color)oldColours.elementAt(i);\r
 211           buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 212     }\r
 213 \r
 214     ucs.setColourScheme( newColours );\r
 215     if (seqGroup != null)\r
 216       seqGroup.cs = ucs;\r
 217     else\r
 218       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 219 \r
 220     ap.repaint();\r
 221 \r
 222     frame.setVisible(false);\r
 223   }\r
 224 \r
 225 \r
 226 }\r