src/jalview/datamodel/VisibleColsCollection.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel;
  22
  23 import jalview.api.AlignmentColsCollectionI;
  24
  25 import java.util.Iterator;
  26
  27 public class VisibleColsCollection implements AlignmentColsCollectionI
  28 {
  29   int start;
  30   int end;
  31
  32   HiddenColumns hidden;
  33
  34   public VisibleColsCollection(int s, int e, AlignmentI al)
  35   {
  36     start = s;
  37     end = e;
  38     hidden = al.getHiddenColumns();
  39   }
  40
  41   @Override
  42   public Iterator<Integer> iterator()
  43   {
  44     return new VisibleColsIterator(start, end, hidden);
  45   }
  46
  47   @Override
  48   public boolean isHidden(int c)
  49   {
  50     return false;
  51   }
  52
  53 }