src/jalview/datamodel/xdb/uniprot/UniprotFeature.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel.xdb.uniprot;
  22
  23 /**
  24  * A data model class for binding from Uniprot XML via uniprot_mapping.xml
  25  */
  26 public class UniprotFeature
  27 {
  28   private String type;
  29
  30   private String description;
  31
  32   private String status;
  33
  34   private int begin;
  35
  36   private int end;
  37
  38   public String getType()
  39   {
  40     return type;
  41   }
  42
  43   public void setType(String t)
  44   {
  45     this.type = t;
  46   }
  47
  48   public String getDescription()
  49   {
  50     return description;
  51   }
  52
  53   public void setDescription(String d)
  54   {
  55     this.description = d;
  56   }
  57
  58   public String getStatus()
  59   {
  60     return status;
  61   }
  62
  63   public void setStatus(String s)
  64   {
  65     this.status = s;
  66   }
  67
  68   public int getBegin()
  69   {
  70     return begin;
  71   }
  72
  73   public void setBegin(int b)
  74   {
  75     this.begin = b;
  76   }
  77
  78   public int getEnd()
  79   {
  80     return end;
  81   }
  82
  83   public void setEnd(int e)
  84   {
  85     this.end = e;
  86   }
  87
  88   public int getPosition()
  89   {
  90     return begin;
  91   }
  92
  93   public void setPosition(int p)
  94   {
  95     this.begin = p;
  96     this.end = p;
  97   }
  98 }