src/jalview/ext/ensembl/EnsemblProtein.java

   1 package jalview.ext.ensembl;
   2
   3 import jalview.ext.ensembl.SeqFetcher.EnsemblSeqType;
   4
   5 public class EnsemblProtein extends EnsemblSeqProxy
   6 {
   7
   8   public EnsemblProtein()
   9   {
  10     super();
  11   }
  12
  13   @Override
  14   public String getDbName()
  15   {
  16     return "ENSEMBL (Protein)";
  17   }
  18
  19   @Override
  20   protected EnsemblSeqType getSourceEnsemblType()
  21   {
  22     return EnsemblSeqType.PROTEIN;
  23   }
  24
  25   @Override
  26   public boolean isDnaCoding()
  27   {
  28     return false;
  29   }
  30
  31   /**
  32    * Test query is to the protein translation of transcript ENST00000288602
  33    */
  34   @Override
  35   public String getTestQuery()
  36   {
  37     return "ENSP00000288602";
  38   }
  39
  40 }