src/jalview/gui/AlignmentPanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import jalview.datamodel.*;\r
  22 \r
  23 import jalview.jbgui.*;\r
  24 \r
  25 import jalview.schemes.*;\r
  26 \r
  27 import java.awt.*;\r
  28 import java.awt.event.*;\r
  29 import java.awt.print.*;\r
  30 \r
  31 import java.io.*;\r
  32 \r
  33 import javax.swing.*;\r
  34 \r
  35 \r
  36 /**\r
  37  * DOCUMENT ME!\r
  38  *\r
  39  * @author $author$\r
  40  * @version $Revision$\r
  41  */\r
  42 public class AlignmentPanel extends GAlignmentPanel\r
  43     implements AdjustmentListener, Printable\r
  44 {\r
  45   public AlignViewport av;\r
  46   OverviewPanel overviewPanel;\r
  47   SeqPanel seqPanel;\r
  48   IdPanel idPanel;\r
  49   IdwidthAdjuster idwidthAdjuster;\r
  50 \r
  51   /** DOCUMENT ME!! */\r
  52   public AlignFrame alignFrame;\r
  53   ScalePanel scalePanel;\r
  54   AnnotationPanel annotationPanel;\r
  55   AnnotationLabels alabels;\r
  56 \r
  57   // this value is set false when selection area being dragged\r
  58   boolean fastPaint = true;\r
  59   int hextent = 0;\r
  60   int vextent = 0;\r
  61 \r
  62   /**\r
  63    * Creates a new AlignmentPanel object.\r
  64    *\r
  65    * @param af DOCUMENT ME!\r
  66    * @param av DOCUMENT ME!\r
  67    */\r
  68   public AlignmentPanel(AlignFrame af, final AlignViewport av)\r
  69   {\r
  70     alignFrame = af;\r
  71     this.av = av;\r
  72     seqPanel = new SeqPanel(av, this);\r
  73     idPanel = new IdPanel(av, this);\r
  74 \r
  75     scalePanel = new ScalePanel(av, this);\r
  76 \r
  77     idPanelHolder.add(idPanel, BorderLayout.CENTER);\r
  78     idwidthAdjuster = new IdwidthAdjuster(this);\r
  79     idSpaceFillerPanel1.add(idwidthAdjuster, BorderLayout.CENTER);\r
  80 \r
  81     annotationPanel = new AnnotationPanel(this);\r
  82     alabels = new AnnotationLabels(this);\r
  83 \r
  84 \r
  85     annotationScroller.setViewportView(annotationPanel);\r
  86     annotationSpaceFillerHolder.add(alabels, BorderLayout.CENTER);\r
  87 \r
  88     fontChanged();\r
  89 \r
  90     scalePanelHolder.add(scalePanel, BorderLayout.CENTER);\r
  91     seqPanelHolder.add(seqPanel, BorderLayout.CENTER);\r
  92 \r
  93     setScrollValues(0, 0);\r
  94 \r
  95     adjustAnnotationHeight();\r
  96 \r
  97     setAnnotationVisible(av.getShowAnnotation());\r
  98 \r
  99     hscroll.addAdjustmentListener(this);\r
 100     vscroll.addAdjustmentListener(this);\r
 101 \r
 102     af.addKeyListener(new KeyAdapter()\r
 103     {\r
 104       public void keyPressed(KeyEvent evt)\r
 105       {\r
 106         if(av.cursorMode\r
 107            && evt.getKeyCode()>=KeyEvent.VK_0\r
 108            && evt.getKeyCode()<=KeyEvent.VK_9)\r
 109         {\r
 110           seqPanel.numberPressed(evt.getKeyChar());\r
 111         }\r
 112 \r
 113         switch (evt.getKeyCode())\r
 114         {\r
 115           case 27: // escape key\r
 116             alignFrame.deselectAllSequenceMenuItem_actionPerformed(null);\r
 117 \r
 118             break;\r
 119 \r
 120           case KeyEvent.VK_DOWN:\r
 121             if(av.cursorMode)\r
 122             {\r
 123               seqPanel.moveCursor(0,1);\r
 124             }\r
 125             else\r
 126               alignFrame.moveSelectedSequences(false);\r
 127             break;\r
 128 \r
 129           case KeyEvent.VK_UP:\r
 130             if (av.cursorMode)\r
 131             {\r
 132               seqPanel.moveCursor(0,-1);\r
 133             }\r
 134             else\r
 135               alignFrame.moveSelectedSequences(true);\r
 136             break;\r
 137 \r
 138           case KeyEvent.VK_LEFT:\r
 139             if(av.cursorMode)\r
 140             {\r
 141               seqPanel.moveCursor(-1,0);\r
 142             }\r
 143             break;\r
 144 \r
 145           case KeyEvent.VK_RIGHT:\r
 146             if (av.cursorMode)\r
 147             {\r
 148               seqPanel.moveCursor(1,0);\r
 149             }\r
 150             break;\r
 151 \r
 152           case KeyEvent.VK_SPACE:\r
 153             if(av.cursorMode)\r
 154             {\r
 155               seqPanel.insertGapAtCursor(evt.isControlDown()\r
 156                                          || evt.isShiftDown()\r
 157                                          || evt.isAltDown());\r
 158             }\r
 159             break;\r
 160 \r
 161           case KeyEvent.VK_DELETE:\r
 162           case KeyEvent.VK_BACK_SPACE:\r
 163             if(!av.cursorMode)\r
 164             {\r
 165               alignFrame.cut_actionPerformed(null);\r
 166             }\r
 167             else\r
 168               seqPanel.deleteGapAtCursor(evt.isControlDown()\r
 169                                          || evt.isShiftDown()\r
 170                                          || evt.isAltDown());\r
 171 \r
 172             break;\r
 173 \r
 174           case KeyEvent.VK_S:\r
 175             if(av.cursorMode)\r
 176             {\r
 177               seqPanel.setCursorRow();\r
 178             }\r
 179             break;\r
 180           case KeyEvent.VK_C:\r
 181             if(av.cursorMode && !evt.isControlDown())\r
 182             {\r
 183               seqPanel.setCursorColumn();\r
 184             }\r
 185             break;\r
 186           case KeyEvent.VK_P:\r
 187             if(av.cursorMode)\r
 188             {\r
 189               seqPanel.setCursorPosition();\r
 190             }\r
 191             break;\r
 192 \r
 193           case KeyEvent.VK_ENTER:\r
 194           case KeyEvent.VK_COMMA:\r
 195             if(av.cursorMode)\r
 196             {\r
 197               seqPanel.setCursorRowAndColumn();\r
 198             }\r
 199             break;\r
 200 \r
 201           case KeyEvent.VK_Q:\r
 202             if(av.cursorMode)\r
 203             {\r
 204               seqPanel.setSelectionAreaAtCursor(true);\r
 205             }\r
 206             break;\r
 207           case KeyEvent.VK_M:\r
 208             if(av.cursorMode)\r
 209             {\r
 210               seqPanel.setSelectionAreaAtCursor(false);\r
 211             }\r
 212             break;\r
 213 \r
 214          case KeyEvent.VK_F2:\r
 215            av.cursorMode = ! av.cursorMode;\r
 216            alignFrame.statusBar.setText("Keyboard editing mode is "+\r
 217                (av.cursorMode ? "on" : "off"));\r
 218            if(av.cursorMode)\r
 219            {\r
 220              seqPanel.seqCanvas.cursorX = av.startRes;\r
 221              seqPanel.seqCanvas.cursorY = av.startSeq;\r
 222            }\r
 223            seqPanel.seqCanvas.repaint();\r
 224            break;\r
 225 \r
 226           case KeyEvent.VK_F1:\r
 227             try\r
 228             {\r
 229               ClassLoader cl = jalview.gui.Desktop.class.getClassLoader();\r
 230               java.net.URL url = javax.help.HelpSet.findHelpSet(cl, "help/help");\r
 231               javax.help.HelpSet hs = new javax.help.HelpSet(cl, url);\r
 232 \r
 233               javax.help.HelpBroker hb = hs.createHelpBroker();\r
 234               hb.setCurrentID("home");\r
 235               hb.setDisplayed(true);\r
 236             }\r
 237             catch (Exception ex)\r
 238             {\r
 239               ex.printStackTrace();\r
 240             }\r
 241             break;\r
 242           case KeyEvent.VK_H:\r
 243           {\r
 244             boolean toggleSeqs = !evt.isControlDown();\r
 245             boolean toggleCols = !evt.isShiftDown();\r
 246 \r
 247             boolean hide = false;\r
 248 \r
 249             SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
 250             if(toggleSeqs)\r
 251              {\r
 252                if(sg != null && sg.getSize(false) != av.alignment.getHeight())\r
 253                {\r
 254                  alignFrame.hideSelSequences_actionPerformed(null);\r
 255                  hide = true;\r
 256                }\r
 257                else if (!(toggleCols && av.colSel.getSelected().size() > 0))\r
 258                  alignFrame.showAllSeqs_actionPerformed(null);\r
 259              }\r
 260 \r
 261              if (toggleCols)\r
 262              {\r
 263                if(av.colSel.getSelected().size() > 0)\r
 264                {\r
 265                  alignFrame.hideSelColumns_actionPerformed(null);\r
 266                  if(!toggleSeqs)\r
 267                    av.selectionGroup = sg;\r
 268                }\r
 269                else if(!hide)\r
 270                  alignFrame.showAllColumns_actionPerformed(null);\r
 271              }\r
 272             break;\r
 273           }\r
 274 \r
 275         }\r
 276       }\r
 277     });\r
 278   }\r
 279 \r
 280   /**\r
 281    * DOCUMENT ME!\r
 282    */\r
 283   public void fontChanged()\r
 284   {\r
 285     // set idCanvas bufferedImage to null\r
 286     // to prevent drawing old image\r
 287     FontMetrics fm = getFontMetrics(av.getFont());\r
 288 \r
 289     scalePanelHolder.setPreferredSize(new Dimension(10,\r
 290         av.charHeight + fm.getDescent()));\r
 291     idSpaceFillerPanel1.setPreferredSize(new Dimension(10,\r
 292         av.charHeight + fm.getDescent()));\r
 293 \r
 294     idPanel.idCanvas.gg = null;\r
 295     seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 296     annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 297 \r
 298     Dimension d = calculateIdWidth();\r
 299     d.setSize(d.width + 4, d.height);\r
 300     idPanel.idCanvas.setPreferredSize(d);\r
 301     hscrollFillerPanel.setPreferredSize(d);\r
 302 \r
 303     if (av.getWrapAlignment())\r
 304     {\r
 305       int max = av.alignment.getWidth() /\r
 306           seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.seqCanvas.getWidth());\r
 307       vscroll.setMaximum(max);\r
 308       vscroll.setUnitIncrement(1);\r
 309       vscroll.setVisibleAmount(1);\r
 310     }\r
 311     else\r
 312     {\r
 313       setScrollValues(av.getStartRes(), av.getStartSeq());\r
 314     }\r
 315 \r
 316     if (overviewPanel != null)\r
 317       overviewPanel.setBoxPosition();\r
 318 \r
 319     repaint();\r
 320   }\r
 321 \r
 322   /**\r
 323    * DOCUMENT ME!\r
 324    *\r
 325    * @return DOCUMENT ME!\r
 326    */\r
 327   public Dimension calculateIdWidth()\r
 328   {\r
 329     Container c = new Container();\r
 330 \r
 331     FontMetrics fm = c.getFontMetrics(\r
 332       new Font(av.font.getName(), Font.ITALIC, av.font.getSize()));\r
 333 \r
 334     AlignmentI al = av.getAlignment();\r
 335 \r
 336     int i = 0;\r
 337     int idWidth = 0;\r
 338     String id;\r
 339 \r
 340     while ( (i < al.getHeight()) && (al.getSequenceAt(i) != null))\r
 341     {\r
 342       SequenceI s = al.getSequenceAt(i);\r
 343 \r
 344       id = s.getDisplayId(av.getShowJVSuffix());\r
 345 \r
 346       if (fm.stringWidth(id) > idWidth)\r
 347       {\r
 348         idWidth = fm.stringWidth(id);\r
 349       }\r
 350 \r
 351       i++;\r
 352     }\r
 353 \r
 354     // Also check annotation label widths\r
 355     i = 0;\r
 356 \r
 357     if (al.getAlignmentAnnotation() != null)\r
 358     {\r
 359       fm = c.getFontMetrics(alabels.getFont());\r
 360 \r
 361       while (i < al.getAlignmentAnnotation().length)\r
 362       {\r
 363         String label = al.getAlignmentAnnotation()[i].label;\r
 364 \r
 365         if (fm.stringWidth(label) > idWidth)\r
 366         {\r
 367           idWidth = fm.stringWidth(label);\r
 368         }\r
 369 \r
 370         i++;\r
 371       }\r
 372     }\r
 373 \r
 374     return new Dimension(idWidth, 12);\r
 375   }\r
 376 \r
 377   /**\r
 378    * DOCUMENT ME!\r
 379    *\r
 380    * @param results DOCUMENT ME!\r
 381    */\r
 382   public void highlightSearchResults(SearchResults results)\r
 383   {\r
 384     seqPanel.seqCanvas.highlightSearchResults(results);\r
 385 \r
 386     // do we need to scroll the panel?\r
 387     if (results != null)\r
 388     {\r
 389       SequenceI seq = results.getResultSequence(0);\r
 390       int seqIndex = av.alignment.findIndex(seq);\r
 391       int start = seq.findIndex(results.getResultStart(0)) - 1;\r
 392       int end = seq.findIndex(results.getResultEnd(0)) - 1;\r
 393 \r
 394       if(!av.wrapAlignment)\r
 395       {\r
 396         if ( (av.getStartRes() > end)  || (av.getEndRes() < start) ||\r
 397            ( (av.getStartSeq() > seqIndex) || (av.getEndSeq() < seqIndex)))\r
 398         {\r
 399           setScrollValues(start, seqIndex);\r
 400         }\r
 401       }\r
 402       else\r
 403       {\r
 404         scrollToWrappedVisible(start);\r
 405       }\r
 406     }\r
 407   }\r
 408 \r
 409   void scrollToWrappedVisible(int res)\r
 410   {\r
 411     int cwidth = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.seqCanvas.getWidth());\r
 412     if( res<=av.getStartRes() || res>=(av.getStartRes()+cwidth) )\r
 413     {\r
 414       vscroll.setValue(res / cwidth);\r
 415       av.startRes = vscroll.getValue() * cwidth;\r
 416     }\r
 417   }\r
 418 \r
 419   /**\r
 420    * DOCUMENT ME!\r
 421    *\r
 422    * @return DOCUMENT ME!\r
 423    */\r
 424   public OverviewPanel getOverviewPanel()\r
 425   {\r
 426     return overviewPanel;\r
 427   }\r
 428 \r
 429   /**\r
 430    * DOCUMENT ME!\r
 431    *\r
 432    * @param op DOCUMENT ME!\r
 433    */\r
 434   public void setOverviewPanel(OverviewPanel op)\r
 435   {\r
 436     overviewPanel = op;\r
 437   }\r
 438 \r
 439   /**\r
 440    * DOCUMENT ME!\r
 441    *\r
 442    * @param b DOCUMENT ME!\r
 443    */\r
 444   public void setAnnotationVisible(boolean b)\r
 445   {\r
 446     if (!av.wrapAlignment)\r
 447     {\r
 448       annotationSpaceFillerHolder.setVisible(b);\r
 449       annotationScroller.setVisible(b);\r
 450     }\r
 451     repaint();\r
 452   }\r
 453 \r
 454   public void adjustAnnotationHeight()\r
 455   {\r
 456     javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 457     {\r
 458       public void run()\r
 459       {\r
 460           while(alignFrame.getHeight()==0)\r
 461           {\r
 462             Thread.yield();\r
 463           }\r
 464 \r
 465         int height = annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 466 \r
 467         if (height > alignFrame.getHeight() / 2)\r
 468         {\r
 469           height = alignFrame.getHeight() / 2;\r
 470         }\r
 471 \r
 472         annotationScroller.setPreferredSize(\r
 473             new Dimension(annotationScroller.getWidth(),\r
 474                           height));\r
 475 \r
 476         annotationSpaceFillerHolder.setPreferredSize(new Dimension(\r
 477             annotationSpaceFillerHolder.getWidth(),\r
 478             height));\r
 479 \r
 480         annotationPanel.repaint();\r
 481         repaint();\r
 482       }\r
 483     });\r
 484   }\r
 485 \r
 486   /**\r
 487    * DOCUMENT ME!\r
 488    *\r
 489    * @param wrap DOCUMENT ME!\r
 490    */\r
 491   public void setWrapAlignment(boolean wrap)\r
 492   {\r
 493     av.startSeq = 0;\r
 494     scalePanelHolder.setVisible(!wrap);\r
 495     hscroll.setVisible(!wrap);\r
 496     idwidthAdjuster.setVisible(!wrap);\r
 497 \r
 498     if (wrap)\r
 499     {\r
 500       annotationScroller.setVisible(false);\r
 501       annotationSpaceFillerHolder.setVisible(false);\r
 502     }\r
 503     else if (av.showAnnotation)\r
 504     {\r
 505       annotationScroller.setVisible(true);\r
 506       annotationSpaceFillerHolder.setVisible(true);\r
 507     }\r
 508 \r
 509     idSpaceFillerPanel1.setVisible(!wrap);\r
 510 \r
 511     repaint();\r
 512   }\r
 513 \r
 514   // return value is true if the scroll is valid\r
 515   public boolean scrollUp(boolean up)\r
 516   {\r
 517     if (up)\r
 518     {\r
 519       if (vscroll.getValue() < 1)\r
 520       {\r
 521         return false;\r
 522       }\r
 523 \r
 524       fastPaint = false;\r
 525       vscroll.setValue(vscroll.getValue() - 1);\r
 526     }\r
 527     else\r
 528     {\r
 529       if ( (vextent + vscroll.getValue()) >= av.getAlignment().getHeight())\r
 530       {\r
 531         return false;\r
 532       }\r
 533 \r
 534       fastPaint = false;\r
 535       vscroll.setValue(vscroll.getValue() + 1);\r
 536     }\r
 537 \r
 538     fastPaint = true;\r
 539 \r
 540     return true;\r
 541   }\r
 542 \r
 543   /**\r
 544    * DOCUMENT ME!\r
 545    *\r
 546    * @param right DOCUMENT ME!\r
 547    *\r
 548    * @return DOCUMENT ME!\r
 549    */\r
 550   public boolean scrollRight(boolean right)\r
 551   {\r
 552     if (!right)\r
 553     {\r
 554       if (hscroll.getValue() < 1)\r
 555       {\r
 556         return false;\r
 557       }\r
 558 \r
 559       fastPaint = false;\r
 560       hscroll.setValue(hscroll.getValue() - 1);\r
 561     }\r
 562     else\r
 563     {\r
 564       if ( (hextent + hscroll.getValue()) >= av.getAlignment().getWidth())\r
 565       {\r
 566         return false;\r
 567       }\r
 568 \r
 569       fastPaint = false;\r
 570       hscroll.setValue(hscroll.getValue() + 1);\r
 571     }\r
 572 \r
 573     fastPaint = true;\r
 574 \r
 575     return true;\r
 576   }\r
 577 \r
 578   /**\r
 579    * DOCUMENT ME!\r
 580    *\r
 581    * @param x DOCUMENT ME!\r
 582    * @param y DOCUMENT ME!\r
 583    */\r
 584   public void setScrollValues(int x, int y)\r
 585   {\r
 586 \r
 587     int width = av.alignment.getWidth();\r
 588     int height = av.alignment.getHeight();\r
 589 \r
 590     if(av.hasHiddenColumns)\r
 591      width = av.getColumnSelection().findColumnPosition(width);\r
 592 \r
 593     av.setEndRes( (x + (seqPanel.seqCanvas.getWidth() / av.charWidth)) -1);\r
 594 \r
 595     hextent = seqPanel.seqCanvas.getWidth() / av.charWidth;\r
 596     vextent = seqPanel.seqCanvas.getHeight() / av.charHeight;\r
 597 \r
 598     if (hextent > width)\r
 599     {\r
 600       hextent = width;\r
 601     }\r
 602 \r
 603     if (vextent > height)\r
 604     {\r
 605       vextent = height;\r
 606     }\r
 607 \r
 608     if ( (hextent + x) > width)\r
 609     {\r
 610       x = width - hextent;\r
 611     }\r
 612 \r
 613     if ( (vextent + y) > height)\r
 614     {\r
 615       y = height - vextent;\r
 616     }\r
 617 \r
 618     if (y < 0)\r
 619     {\r
 620       y = 0;\r
 621     }\r
 622 \r
 623     if (x < 0)\r
 624     {\r
 625       x = 0;\r
 626     }\r
 627 \r
 628     hscroll.setValues(x, hextent, 0, width);\r
 629     vscroll.setValues(y, vextent, 0, height);\r
 630   }\r
 631 \r
 632   /**\r
 633    * DOCUMENT ME!\r
 634    *\r
 635    * @param evt DOCUMENT ME!\r
 636    */\r
 637   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)\r
 638   {\r
 639 \r
 640     int oldX = av.getStartRes();\r
 641     int oldY = av.getStartSeq();\r
 642 \r
 643     if (evt.getSource() == hscroll)\r
 644     {\r
 645       int x = hscroll.getValue();\r
 646       av.setStartRes(x);\r
 647       av.setEndRes( (x +\r
 648                      (seqPanel.seqCanvas.getWidth() / av.getCharWidth())) - 1);\r
 649     }\r
 650 \r
 651     if (evt.getSource() == vscroll)\r
 652     {\r
 653       int offy = vscroll.getValue();\r
 654 \r
 655       if (av.getWrapAlignment())\r
 656       {\r
 657         if(offy>-1)\r
 658         {\r
 659           int rowSize = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.\r
 660               seqCanvas.getWidth());\r
 661           av.setStartRes(offy * rowSize);\r
 662           av.setEndRes( (offy + 1) * rowSize);\r
 663         }\r
 664         else\r
 665         {\r
 666           //This is only called if file loaded is a jar file that\r
 667           //was wrapped when saved and user has wrap alignment true\r
 668           //as preference setting\r
 669           SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 670               {\r
 671                 public void run()\r
 672                 {\r
 673                   setScrollValues(av.getStartRes(), av.getStartSeq());\r
 674                 }\r
 675               });\r
 676         }\r
 677       }\r
 678       else\r
 679       {\r
 680         av.setStartSeq(offy);\r
 681         av.setEndSeq(offy +\r
 682                      (seqPanel.seqCanvas.getHeight() / av.getCharHeight()));\r
 683       }\r
 684     }\r
 685 \r
 686     if (overviewPanel != null)\r
 687     {\r
 688       overviewPanel.setBoxPosition();\r
 689     }\r
 690 \r
 691     int scrollX = av.startRes - oldX;\r
 692     int scrollY = av.startSeq - oldY;\r
 693 \r
 694     if (av.getWrapAlignment() || !fastPaint)\r
 695     {\r
 696       repaint();\r
 697     }\r
 698     else\r
 699     {\r
 700       // Make sure we're not trying to draw a panel\r
 701       // larger than the visible window\r
 702       if(scrollX>av.endRes-av.startRes)\r
 703         scrollX = av.endRes-av.startRes;\r
 704       else if(scrollX<av.startRes-av.endRes)\r
 705         scrollX = av.startRes - av.endRes;\r
 706 \r
 707       if(scrollX!=0 || scrollY!=0)\r
 708       {\r
 709         idPanel.idCanvas.fastPaint(scrollY);\r
 710         seqPanel.seqCanvas.fastPaint(scrollX,\r
 711                                      scrollY);\r
 712         scalePanel.repaint();\r
 713 \r
 714         if (av.getShowAnnotation())\r
 715         {\r
 716           annotationPanel.fastPaint(scrollX);\r
 717         }\r
 718       }\r
 719     }\r
 720   }\r
 721 \r
 722   /**\r
 723    * DOCUMENT ME!\r
 724    *\r
 725    * @param g DOCUMENT ME!\r
 726    */\r
 727   public void paintComponent(Graphics g)\r
 728   {\r
 729     invalidate();\r
 730 \r
 731     Dimension d = idPanel.idCanvas.getPreferredSize();\r
 732     idPanelHolder.setPreferredSize(d);\r
 733     hscrollFillerPanel.setPreferredSize(new Dimension(d.width, 12));\r
 734     validate();\r
 735 \r
 736     if (av.getWrapAlignment())\r
 737     {\r
 738       int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
 739 \r
 740       if (av.hasHiddenColumns)\r
 741         maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth) - 1;\r
 742 \r
 743       int max = maxwidth /\r
 744           seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.seqCanvas.getWidth()) +\r
 745           1;\r
 746 \r
 747 \r
 748       vscroll.setMaximum(max);\r
 749       vscroll.setUnitIncrement(1);\r
 750       vscroll.setVisibleAmount(1);\r
 751     }\r
 752     else\r
 753     {\r
 754       setScrollValues(av.getStartRes(), av.getStartSeq());\r
 755     }\r
 756 \r
 757     if( this.getVisibleRect().getBounds() == g.getClipBounds()\r
 758         && overviewPanel != null)\r
 759         overviewPanel.updateOverviewImage();\r
 760 \r
 761   }\r
 762 \r
 763   /**\r
 764    * DOCUMENT ME!\r
 765    *\r
 766    * @param pg DOCUMENT ME!\r
 767    * @param pf DOCUMENT ME!\r
 768    * @param pi DOCUMENT ME!\r
 769    *\r
 770    * @return DOCUMENT ME!\r
 771    *\r
 772    * @throws PrinterException DOCUMENT ME!\r
 773    */\r
 774   public int print(Graphics pg, PageFormat pf, int pi)\r
 775       throws PrinterException\r
 776   {\r
 777     pg.translate( (int) pf.getImageableX(), (int) pf.getImageableY());\r
 778 \r
 779     int pwidth = (int) pf.getImageableWidth();\r
 780     int pheight = (int) pf.getImageableHeight();\r
 781 \r
 782     if (av.getWrapAlignment())\r
 783     {\r
 784       return printWrappedAlignment(pg, pwidth, pheight, pi);\r
 785     }\r
 786     else\r
 787     {\r
 788       return printUnwrapped(pg, pwidth, pheight, pi);\r
 789     }\r
 790   }\r
 791 \r
 792   /**\r
 793    * DOCUMENT ME!\r
 794    *\r
 795    * @param pg DOCUMENT ME!\r
 796    * @param pwidth DOCUMENT ME!\r
 797    * @param pheight DOCUMENT ME!\r
 798    * @param pi DOCUMENT ME!\r
 799    *\r
 800    * @return DOCUMENT ME!\r
 801    *\r
 802    * @throws PrinterException DOCUMENT ME!\r
 803    */\r
 804   public int printUnwrapped(Graphics pg, int pwidth, int pheight, int pi)\r
 805       throws PrinterException\r
 806   {\r
 807     int idWidth = getVisibleIdWidth();\r
 808     FontMetrics fm = getFontMetrics(av.getFont());\r
 809     int scaleHeight = av.charHeight + fm.getDescent();\r
 810 \r
 811     pg.setColor(Color.white);\r
 812     pg.fillRect(0, 0, pwidth, pheight);\r
 813     pg.setFont(av.getFont());\r
 814 \r
 815     ////////////////////////////////////\r
 816     /// How many sequences and residues can we fit on a printable page?\r
 817     int totalRes = (pwidth - idWidth) / av.getCharWidth();\r
 818 \r
 819     int totalSeq = (int) ( (pheight - scaleHeight) / av.getCharHeight()) -\r
 820         1;\r
 821 \r
 822     int pagesWide = (av.getAlignment().getWidth() / totalRes) + 1;\r
 823 \r
 824     /////////////////////////////\r
 825     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 826     int startRes;\r
 827 \r
 828     /////////////////////////////\r
 829     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 830     int endRes;\r
 831 \r
 832     /////////////////////////////\r
 833     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 834     int startSeq;\r
 835 \r
 836     /////////////////////////////\r
 837     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 838     int endSeq;\r
 839     startRes = (pi % pagesWide) * totalRes;\r
 840     endRes = (startRes + totalRes) - 1;\r
 841 \r
 842     if (endRes > (av.getAlignment().getWidth() - 1))\r
 843     {\r
 844       endRes = av.getAlignment().getWidth() - 1;\r
 845     }\r
 846 \r
 847     startSeq = (pi / pagesWide) * totalSeq;\r
 848     endSeq = startSeq + totalSeq;\r
 849 \r
 850     if (endSeq > av.getAlignment().getHeight())\r
 851     {\r
 852       endSeq = av.getAlignment().getHeight();\r
 853     }\r
 854 \r
 855     int pagesHigh = ( (av.alignment.getHeight() / totalSeq) + 1) * pheight;\r
 856 \r
 857     if (av.showAnnotation)\r
 858     {\r
 859       pagesHigh += annotationPanel.adjustPanelHeight() + 3;\r
 860     }\r
 861 \r
 862     pagesHigh /= pheight;\r
 863 \r
 864     if (pi >= (pagesWide * pagesHigh))\r
 865     {\r
 866       return Printable.NO_SUCH_PAGE;\r
 867     }\r
 868 \r
 869     //draw Scale\r
 870     pg.translate(idWidth, 0);\r
 871     scalePanel.drawScale(pg, startRes, endRes, pwidth - idWidth, scaleHeight);\r
 872     pg.translate( -idWidth, scaleHeight);\r
 873 \r
 874     ////////////////\r
 875     // Draw the ids\r
 876     Color currentColor = null;\r
 877     Color currentTextColor = null;\r
 878 \r
 879     pg.setFont(new Font(av.getFont().getName(),\r
 880                         Font.ITALIC,\r
 881                         av.getFont().getSize()));\r
 882     for (int i = startSeq; i < endSeq; i++)\r
 883     {\r
 884       if ( (av.getSelectionGroup() != null) &&\r
 885           av.getSelectionGroup().getSequences(false).contains(\r
 886               av.getAlignment().getSequenceAt(i)))\r
 887       {\r
 888         currentColor = Color.gray;\r
 889         currentTextColor = Color.black;\r
 890       }\r
 891       else\r
 892       {\r
 893         currentColor = av.getAlignment().getSequenceAt(i).getColor();\r
 894         currentTextColor = Color.black;\r
 895       }\r
 896 \r
 897       pg.setColor(currentColor);\r
 898       pg.fillRect(0, (i - startSeq) * av.charHeight, idWidth,\r
 899                   av.getCharHeight());\r
 900 \r
 901       pg.setColor(currentTextColor);\r
 902 \r
 903       String string = av.getAlignment().getSequenceAt(i).getDisplayId\r
 904           ( av.getShowJVSuffix());\r
 905 \r
 906       pg.drawString(string, 0,\r
 907                     ( ( (i - startSeq) * av.charHeight) + av.getCharHeight()) -\r
 908                     (av.getCharHeight() / 5));\r
 909     }\r
 910 \r
 911     pg.setFont(av.getFont());\r
 912 \r
 913     // draw main sequence panel\r
 914     pg.translate(idWidth, 0);\r
 915     seqPanel.seqCanvas.drawPanel(pg, startRes, endRes, startSeq, endSeq, 0);\r
 916 \r
 917     if (av.showAnnotation && (endSeq == av.alignment.getHeight()))\r
 918     {\r
 919       pg.translate( -idWidth-3, (endSeq - startSeq) * av.charHeight + 3);\r
 920       alabels.drawComponent( (Graphics2D) pg, idWidth);\r
 921       pg.translate(idWidth+3, 0);\r
 922       annotationPanel.drawComponent( (Graphics2D) pg, startRes, endRes +\r
 923                                     1);\r
 924     }\r
 925 \r
 926     return Printable.PAGE_EXISTS;\r
 927   }\r
 928 \r
 929   /**\r
 930    * DOCUMENT ME!\r
 931    *\r
 932    * @param pg DOCUMENT ME!\r
 933    * @param pwidth DOCUMENT ME!\r
 934    * @param pheight DOCUMENT ME!\r
 935    * @param pi DOCUMENT ME!\r
 936    *\r
 937    * @return DOCUMENT ME!\r
 938    *\r
 939    * @throws PrinterException DOCUMENT ME!\r
 940    */\r
 941   public int printWrappedAlignment(Graphics pg, int pwidth, int pheight,\r
 942                                    int pi)\r
 943       throws PrinterException\r
 944   {\r
 945 \r
 946     int annotationHeight = 0;\r
 947     AnnotationLabels labels = null;\r
 948     if (av.showAnnotation)\r
 949     {\r
 950       annotationHeight = annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 951       labels = new AnnotationLabels(av);\r
 952     }\r
 953 \r
 954     int hgap = av.charHeight;\r
 955     if (av.scaleAboveWrapped)\r
 956       hgap += av.charHeight;\r
 957 \r
 958     int cHeight = av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight\r
 959         + hgap\r
 960         + annotationHeight;\r
 961 \r
 962     int idWidth = getVisibleIdWidth();\r
 963 \r
 964     int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
 965     if (av.hasHiddenColumns)\r
 966       maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth) - 1;\r
 967 \r
 968 \r
 969     int resWidth = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(pwidth -\r
 970         idWidth);\r
 971 \r
 972     int totalHeight = cHeight * (maxwidth / resWidth + 1);\r
 973 \r
 974     pg.setColor(Color.white);\r
 975     pg.fillRect(0, 0, pwidth, pheight);\r
 976     pg.setFont(av.getFont());\r
 977 \r
 978     ////////////////\r
 979     // Draw the ids\r
 980     pg.setColor(Color.black);\r
 981 \r
 982     pg.translate(0, -pi * pheight);\r
 983 \r
 984     pg.setClip(0, pi * pheight, pwidth, pheight);\r
 985 \r
 986     int ypos = hgap;\r
 987     Font italic = new Font(av.getFont().getName(), Font.ITALIC,\r
 988                            av.getFont().getSize());\r
 989     pg.setFont(italic);\r
 990 \r
 991     do\r
 992     {\r
 993       for (int i = 0; i < av.alignment.getHeight(); i++)\r
 994       {\r
 995         SequenceI s = av.alignment.getSequenceAt(i);\r
 996         String string = s.getDisplayId( av.getShowJVSuffix());\r
 997 \r
 998         pg.drawString(string, 0,\r
 999                       ( (i * av.charHeight) + ypos + av.charHeight) -\r
1000                       (av.charHeight / 5));\r
1001       }\r
1002       if (labels != null)\r
1003       {\r
1004         pg.translate(-3,\r
1005                      ypos +\r
1006                      (av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight));\r
1007 \r
1008         pg.setFont(av.getFont());\r
1009         labels.drawComponent(pg, idWidth);\r
1010         pg.setFont(italic);\r
1011         pg.translate(+3,\r
1012                      -ypos -\r
1013                      (av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight));\r
1014       }\r
1015 \r
1016       ypos += cHeight;\r
1017     }\r
1018     while (ypos < totalHeight);\r
1019 \r
1020     pg.translate(idWidth, 0);\r
1021 \r
1022     seqPanel.seqCanvas.drawWrappedPanel(pg, pwidth - idWidth, totalHeight, 0);\r
1023 \r
1024     if ( (pi * pheight) < totalHeight)\r
1025     {\r
1026       return Printable.PAGE_EXISTS;\r
1027 \r
1028     }\r
1029     else\r
1030     {\r
1031       return Printable.NO_SUCH_PAGE;\r
1032     }\r
1033   }\r
1034 \r
1035   int getVisibleIdWidth()\r
1036   {\r
1037     return\r
1038         idPanel.getWidth() > 0 ? idPanel.getWidth() :\r
1039         calculateIdWidth().width + 4;\r
1040   }\r
1041 \r
1042   void makeAlignmentImage(int type, File file)\r
1043   {\r
1044     int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
1045     if (av.hasHiddenColumns)\r
1046       maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth);\r
1047 \r
1048     int height = ( (av.alignment.getHeight() + 1) * av.charHeight) + 30;\r
1049     int width = getVisibleIdWidth() + (maxwidth * av.charWidth);\r
1050 \r
1051     if (av.getWrapAlignment())\r
1052     {\r
1053       height = getWrappedHeight();\r
1054       if (System.getProperty("java.awt.headless") != null\r
1055           && System.getProperty("java.awt.headless").equals("true"))\r
1056       {\r
1057         width = alignFrame.getWidth() - 22;\r
1058       }\r
1059       else\r
1060         width = seqPanel.getWidth() + getVisibleIdWidth();\r
1061 \r
1062     }\r
1063     else if (av.getShowAnnotation())\r
1064     {\r
1065       height += annotationPanel.adjustPanelHeight() + 3;\r
1066     }\r
1067 \r
1068     jalview.util.ImageMaker im;\r
1069     if(type==jalview.util.ImageMaker.PNG)\r
1070       im  = new jalview.util.ImageMaker(this,\r
1071                                         jalview.util.ImageMaker.PNG,\r
1072                                         "Create PNG image from alignment",\r
1073                                         width, height, file, null);\r
1074     else\r
1075       im = new jalview.util.ImageMaker(this,\r
1076                                         jalview.util.ImageMaker.EPS,\r
1077                                        "Create EPS file from alignment",\r
1078                                         width, height, file, alignFrame.getTitle() );\r
1079 \r
1080     try\r
1081     {\r
1082       if (av.getWrapAlignment())\r
1083       {\r
1084         if(im.getGraphics()!=null)\r
1085         {\r
1086           printWrappedAlignment(im.getGraphics(), width, height, 0);\r
1087           im.writeImage();\r
1088         }\r
1089       }\r
1090       else\r
1091       {\r
1092         if(im.getGraphics()!=null)\r
1093         {\r
1094           printUnwrapped(im.getGraphics(), width, height, 0);\r
1095           im.writeImage();\r
1096         }\r
1097       }\r
1098     }\r
1099     catch (OutOfMemoryError err)\r
1100     {\r
1101       System.out.println("########################\n"\r
1102                          + "OUT OF MEMORY " + file + "\n"\r
1103                          + "########################");\r
1104 \r
1105       JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,\r
1106                                             "Out of Memory Creating Image!!"\r
1107                                             +\r
1108                                             "\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory."\r
1109                                             , "Out of memory",\r
1110                                             JOptionPane.WARNING_MESSAGE);\r
1111       System.out.println("Create IMAGE: " + err);\r
1112       System.gc();\r
1113 \r
1114     }\r
1115     catch (Exception ex)\r
1116     {\r
1117       ex.printStackTrace();\r
1118     }\r
1119   }\r
1120   /**\r
1121    * DOCUMENT ME!\r
1122    */\r
1123   public void makeEPS(File epsFile)\r
1124   {\r
1125     makeAlignmentImage(jalview.util.ImageMaker.EPS, epsFile);\r
1126   }\r
1127 \r
1128   /**\r
1129    * DOCUMENT ME!\r
1130    */\r
1131   public void makePNG(File pngFile)\r
1132   {\r
1133     makeAlignmentImage(jalview.util.ImageMaker.PNG, pngFile);\r
1134   }\r
1135 \r
1136   public void makePNGImageMap(File imgMapFile, String imageName)\r
1137   {\r
1138     ///////ONLY WORKS WITH NONE WRAPPED ALIGNMENTS\r
1139     //////////////////////////////////////////////\r
1140     int idWidth = getVisibleIdWidth();\r
1141     FontMetrics fm = getFontMetrics(av.getFont());\r
1142     int scaleHeight = av.charHeight + fm.getDescent();\r
1143 \r
1144     // Gen image map\r
1145     //////////////////////////////////\r
1146     if (imgMapFile != null)\r
1147     {\r
1148       try\r
1149       {\r
1150         int s, sSize = av.alignment.getHeight(),\r
1151             res, alwidth = av.alignment.getWidth(), g, gSize, f, fSize, sy;\r
1152         StringBuffer text = new StringBuffer();\r
1153         PrintWriter out = new PrintWriter(new FileWriter(imgMapFile));\r
1154         out.println(jalview.io.HTMLOutput.getImageMapHTML());\r
1155         out.println("<img src=\"" + imageName +\r
1156                     "\" border=\"0\" usemap=\"#Map\" >"\r
1157                     + "<map name=\"Map\">");\r
1158 \r
1159         for (s = 0; s < sSize; s++)\r
1160         {\r
1161           sy = s * av.charHeight + scaleHeight;\r
1162 \r
1163           SequenceI seq = av.alignment.getSequenceAt(s);\r
1164           SequenceFeature [] features = seq.getDatasetSequence().getSequenceFeatures();\r
1165           SequenceGroup[] groups = av.alignment.findAllGroups(seq);\r
1166           for(res =0; res<alwidth; res++)\r
1167           {\r
1168             text = new StringBuffer();\r
1169             Object obj = null;\r
1170             if(av.alignment.isNucleotide())\r
1171               obj = ResidueProperties.nucleotideName.get(seq.getCharAt(res)+"" );\r
1172             else\r
1173               obj = ResidueProperties.aa2Triplet.get(\r
1174                     seq.getCharAt(res) + "");\r
1175 \r
1176               if (obj == null)\r
1177                   continue;\r
1178 \r
1179             String triplet = obj.toString();\r
1180             int alIndex = seq.findPosition(res);\r
1181             gSize = groups.length;\r
1182             for (g = 0; g < gSize; g++)\r
1183             {\r
1184               if(text.length()<1)\r
1185               {\r
1186                 text.append("<area shape=\"rect\" coords=\""\r
1187                   + (idWidth + res * av.charWidth) + ","\r
1188                   + sy + ","\r
1189                   + (idWidth + (res + 1) * av.charWidth) + ","\r
1190                   + (av.charHeight + sy) + "\""\r
1191                   + " onMouseOver=\"toolTip('"\r
1192                   + alIndex + " " + triplet );\r
1193               }\r
1194 \r
1195               if(groups[g].getStartRes()<res && groups[g].getEndRes()>res)\r
1196                 text.append("<br><em>" + groups[g].getName() + "</em>");\r
1197             }\r
1198 \r
1199             if (features != null)\r
1200             {\r
1201               if(text.length()<1)\r
1202               {\r
1203                 text.append("<area shape=\"rect\" coords=\""\r
1204                   + (idWidth + res * av.charWidth) + ","\r
1205                   + sy + ","\r
1206                   + (idWidth + (res + 1) * av.charWidth) + ","\r
1207                   + (av.charHeight + sy) + "\""\r
1208                   + " onMouseOver=\"toolTip('"\r
1209                   + alIndex + " " + triplet );\r
1210               }\r
1211                 fSize = features.length;\r
1212                 for (f = 0; f < fSize; f++)\r
1213                 {\r
1214 \r
1215                   if ( (features[f].getBegin() <= seq.findPosition(res)) &&\r
1216                       (features[f].getEnd() >= seq.findPosition(res)))\r
1217                   {\r
1218                     if (features[f].getType().equals("disulfide bond"))\r
1219                     {\r
1220                       if (features[f].getBegin() == seq.findPosition(res)\r
1221                           || features[f].getEnd() == seq.findPosition(res))\r
1222                       {\r
1223                         text.append("<br>disulfide bond " + features[f].getBegin() + ":" +\r
1224                                        features[f].getEnd());\r
1225                       }\r
1226                     }\r
1227                     else\r
1228                     {\r
1229                       text.append("<br>");\r
1230                       text.append(features[f].getType());\r
1231                       if (features[f].getDescription() != null && !features[f].getType().equals(features[f].getDescription()))\r
1232                         text.append(" " + features[f].getDescription());\r
1233 \r
1234                       if (features[f].getValue("status") != null )\r
1235                       {\r
1236                         text.append(" (" + features[f].getValue("status") + ")");\r
1237                       }\r
1238                     }\r
1239                   }\r
1240 \r
1241                 }\r
1242               }\r
1243               if(text.length()>1)\r
1244               {\r
1245                 text.append("')\"; onMouseOut=\"toolTip()\";  href=\"#\">");\r
1246                 out.println(text.toString());\r
1247               }\r
1248             }\r
1249           }\r
1250         out.println("</map></body></html>");\r
1251         out.close();\r
1252 \r
1253       }\r
1254       catch (Exception ex)\r
1255       {\r
1256         ex.printStackTrace();\r
1257       }\r
1258     } ///////////END OF IMAGE MAP\r
1259 \r
1260   }\r
1261 \r
1262   int getWrappedHeight()\r
1263   {\r
1264     int seqPanelWidth = seqPanel.seqCanvas.getWidth();\r
1265 \r
1266     //If headless, seqPanel will have 0 width\r
1267     if (System.getProperty("java.awt.headless") != null\r
1268               && System.getProperty("java.awt.headless").equals("true"))\r
1269     {\r
1270       seqPanelWidth = alignFrame.getWidth() - getVisibleIdWidth();\r
1271     }\r
1272 \r
1273     int chunkWidth = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(\r
1274         seqPanelWidth\r
1275           );\r
1276 \r
1277     int hgap = av.charHeight;\r
1278     if (av.scaleAboveWrapped)\r
1279       hgap += av.charHeight;\r
1280 \r
1281     int annotationHeight = 0;\r
1282     if (av.showAnnotation)\r
1283     {\r
1284       annotationHeight = annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
1285     }\r
1286 \r
1287     int cHeight = av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight\r
1288         + hgap\r
1289         + annotationHeight;\r
1290 \r
1291     int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
1292     if (av.hasHiddenColumns)\r
1293       maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth) - 1;\r
1294 \r
1295 \r
1296     int height = ( (maxwidth / chunkWidth) + 1) * cHeight;\r
1297 \r
1298     return height;\r
1299   }\r
1300 \r
1301   /**\r
1302    * DOCUMENT ME!\r
1303    *\r
1304    * @author $author$\r
1305    * @version $Revision$\r
1306    */\r
1307   class Preview\r
1308       extends JFrame\r
1309   {\r
1310     /**\r
1311      * Creates a new Preview object.\r
1312      *\r
1313      * @param image DOCUMENT ME!\r
1314      */\r
1315     public Preview(Image image)\r
1316     {\r
1317       setResizable(true);\r
1318       setSize(image.getWidth(this), image.getHeight(this));\r
1319       setVisible(true);\r
1320       getContentPane().setLayout(new BorderLayout());\r
1321       getContentPane().add(new PreviewPanel(image), BorderLayout.CENTER);\r
1322       validate();\r
1323       repaint();\r
1324     }\r
1325   }\r
1326 \r
1327   /**\r
1328    * DOCUMENT ME!\r
1329    *\r
1330    * @author $author$\r
1331    * @version $Revision$\r
1332    */\r
1333   class PreviewPanel\r
1334       extends JPanel\r
1335   {\r
1336     Image image;\r
1337 \r
1338     /**\r
1339      * Creates a new PreviewPanel object.\r
1340      *\r
1341      * @param image DOCUMENT ME!\r
1342      */\r
1343     public PreviewPanel(Image image)\r
1344     {\r
1345       this.image = image;\r
1346     }\r
1347 \r
1348     /**\r
1349      * DOCUMENT ME!\r
1350      *\r
1351      * @param g DOCUMENT ME!\r
1352      */\r
1353     public void paintComponent(Graphics g)\r
1354     {\r
1355       if (image != null)\r
1356       {\r
1357         g.drawImage(image, 0, 0, this);\r
1358       }\r
1359       else\r
1360       {\r
1361         System.out.println("DEBUG:image is null");\r
1362       }\r
1363     }\r
1364   }\r
1365 }\r