src/jalview/gui/AlignmentPanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import jalview.datamodel.*;\r
  22 \r
  23 import jalview.jbgui.*;\r
  24 \r
  25 import jalview.schemes.*;\r
  26 \r
  27 import java.awt.*;\r
  28 import java.awt.event.*;\r
  29 import java.awt.print.*;\r
  30 \r
  31 import java.io.*;\r
  32 \r
  33 import javax.swing.*;\r
  34 \r
  35 \r
  36 /**\r
  37  * DOCUMENT ME!\r
  38  *\r
  39  * @author $author$\r
  40  * @version $Revision$\r
  41  */\r
  42 public class AlignmentPanel extends GAlignmentPanel\r
  43     implements AdjustmentListener, Printable\r
  44 {\r
  45   public AlignViewport av;\r
  46   OverviewPanel overviewPanel;\r
  47   SeqPanel seqPanel;\r
  48   IdPanel idPanel;\r
  49   IdwidthAdjuster idwidthAdjuster;\r
  50 \r
  51   /** DOCUMENT ME!! */\r
  52   public AlignFrame alignFrame;\r
  53   ScalePanel scalePanel;\r
  54   AnnotationPanel annotationPanel;\r
  55   AnnotationLabels alabels;\r
  56 \r
  57   // this value is set false when selection area being dragged\r
  58   boolean fastPaint = true;\r
  59   int hextent = 0;\r
  60   int vextent = 0;\r
  61 \r
  62   /**\r
  63    * Creates a new AlignmentPanel object.\r
  64    *\r
  65    * @param af DOCUMENT ME!\r
  66    * @param av DOCUMENT ME!\r
  67    */\r
  68   public AlignmentPanel(AlignFrame af, final AlignViewport av)\r
  69   {\r
  70     alignFrame = af;\r
  71     this.av = av;\r
  72     seqPanel = new SeqPanel(av, this);\r
  73     idPanel = new IdPanel(av, this);\r
  74 \r
  75     scalePanel = new ScalePanel(av, this);\r
  76 \r
  77     idPanelHolder.add(idPanel, BorderLayout.CENTER);\r
  78     idwidthAdjuster = new IdwidthAdjuster(this);\r
  79     idSpaceFillerPanel1.add(idwidthAdjuster, BorderLayout.CENTER);\r
  80 \r
  81     annotationPanel = new AnnotationPanel(this);\r
  82     alabels = new AnnotationLabels(this);\r
  83 \r
  84 \r
  85     annotationScroller.setViewportView(annotationPanel);\r
  86     annotationSpaceFillerHolder.add(alabels, BorderLayout.CENTER);\r
  87 \r
  88     fontChanged();\r
  89 \r
  90     scalePanelHolder.add(scalePanel, BorderLayout.CENTER);\r
  91     seqPanelHolder.add(seqPanel, BorderLayout.CENTER);\r
  92 \r
  93     setScrollValues(0, 0);\r
  94 \r
  95     adjustAnnotationHeight();\r
  96 \r
  97     setAnnotationVisible(av.getShowAnnotation());\r
  98 \r
  99     hscroll.addAdjustmentListener(this);\r
 100     vscroll.addAdjustmentListener(this);\r
 101 \r
 102     af.addKeyListener(new KeyAdapter()\r
 103     {\r
 104       public void keyPressed(KeyEvent evt)\r
 105       {\r
 106         if(av.cursorMode\r
 107            && evt.getKeyCode()>=KeyEvent.VK_0\r
 108            && evt.getKeyCode()<=KeyEvent.VK_9)\r
 109         {\r
 110           seqPanel.numberPressed(evt.getKeyChar());\r
 111         }\r
 112 \r
 113         switch (evt.getKeyCode())\r
 114         {\r
 115           case 27: // escape key\r
 116             alignFrame.deselectAllSequenceMenuItem_actionPerformed(null);\r
 117 \r
 118             break;\r
 119 \r
 120           case KeyEvent.VK_DOWN:\r
 121             if(av.cursorMode)\r
 122             {\r
 123               seqPanel.moveCursor(0,1);\r
 124             }\r
 125             else\r
 126               alignFrame.moveSelectedSequences(false);\r
 127             break;\r
 128 \r
 129           case KeyEvent.VK_UP:\r
 130             if (av.cursorMode)\r
 131             {\r
 132               seqPanel.moveCursor(0,-1);\r
 133             }\r
 134             else\r
 135               alignFrame.moveSelectedSequences(true);\r
 136             break;\r
 137 \r
 138           case KeyEvent.VK_LEFT:\r
 139             if(av.cursorMode)\r
 140             {\r
 141               seqPanel.moveCursor(-1,0);\r
 142             }\r
 143             break;\r
 144 \r
 145           case KeyEvent.VK_RIGHT:\r
 146             if (av.cursorMode)\r
 147             {\r
 148               seqPanel.moveCursor(1,0);\r
 149             }\r
 150             break;\r
 151 \r
 152           case KeyEvent.VK_SPACE:\r
 153             if(av.cursorMode)\r
 154             {\r
 155               seqPanel.insertGapAtCursor(evt.isControlDown() || evt.isShiftDown());\r
 156             }\r
 157             break;\r
 158 \r
 159           case KeyEvent.VK_DELETE:\r
 160           case KeyEvent.VK_BACK_SPACE:\r
 161             if(!av.cursorMode)\r
 162             {\r
 163               alignFrame.cut_actionPerformed(null);\r
 164             }\r
 165             else\r
 166               seqPanel.deleteGapAtCursor(evt.isControlDown() || evt.isShiftDown());\r
 167 \r
 168             break;\r
 169 \r
 170           case KeyEvent.VK_S:\r
 171             if(av.cursorMode)\r
 172             {\r
 173               seqPanel.setCursorRow();\r
 174             }\r
 175             break;\r
 176           case KeyEvent.VK_C:\r
 177             if(av.cursorMode && !evt.isControlDown())\r
 178             {\r
 179               seqPanel.setCursorColumn();\r
 180             }\r
 181             break;\r
 182           case KeyEvent.VK_P:\r
 183             if(av.cursorMode)\r
 184             {\r
 185               seqPanel.setCursorPosition();\r
 186             }\r
 187             break;\r
 188 \r
 189           case KeyEvent.VK_ENTER:\r
 190           case KeyEvent.VK_COMMA:\r
 191             if(av.cursorMode)\r
 192             {\r
 193               seqPanel.setCursorRowAndColumn();\r
 194             }\r
 195             break;\r
 196 \r
 197           case KeyEvent.VK_Q:\r
 198             if(av.cursorMode)\r
 199             {\r
 200               seqPanel.setSelectionAreaAtCursor(true);\r
 201             }\r
 202             break;\r
 203           case KeyEvent.VK_M:\r
 204             if(av.cursorMode)\r
 205             {\r
 206               seqPanel.setSelectionAreaAtCursor(false);\r
 207             }\r
 208             break;\r
 209 \r
 210          case KeyEvent.VK_F2:\r
 211            av.cursorMode = ! av.cursorMode;\r
 212            alignFrame.statusBar.setText("Keyboard editing mode is "+\r
 213                (av.cursorMode ? "on" : "off"));\r
 214            if(av.cursorMode)\r
 215            {\r
 216              seqPanel.seqCanvas.cursorX = av.startRes;\r
 217              seqPanel.seqCanvas.cursorY = av.startSeq;\r
 218            }\r
 219            seqPanel.seqCanvas.repaint();\r
 220            break;\r
 221 \r
 222           case KeyEvent.VK_F1:\r
 223             try\r
 224             {\r
 225               ClassLoader cl = jalview.gui.Desktop.class.getClassLoader();\r
 226               java.net.URL url = javax.help.HelpSet.findHelpSet(cl, "help/help");\r
 227               javax.help.HelpSet hs = new javax.help.HelpSet(cl, url);\r
 228 \r
 229               javax.help.HelpBroker hb = hs.createHelpBroker();\r
 230               hb.setCurrentID("home");\r
 231               hb.setDisplayed(true);\r
 232             }\r
 233             catch (Exception ex)\r
 234             {\r
 235               ex.printStackTrace();\r
 236             }\r
 237             break;\r
 238           case KeyEvent.VK_H:\r
 239           {\r
 240             boolean toggleSeqs = !evt.isControlDown();\r
 241             boolean toggleCols = !evt.isShiftDown();\r
 242 \r
 243             boolean hide = false;\r
 244 \r
 245             SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
 246             if(toggleSeqs)\r
 247              {\r
 248                if(sg != null && sg.getSize(false) != av.alignment.getHeight())\r
 249                {\r
 250                  alignFrame.hideSelSequences_actionPerformed(null);\r
 251                  hide = true;\r
 252                }\r
 253                else if (!(toggleCols && av.colSel.getSelected().size() > 0))\r
 254                  alignFrame.showAllSeqs_actionPerformed(null);\r
 255              }\r
 256 \r
 257              if (toggleCols)\r
 258              {\r
 259                if(av.colSel.getSelected().size() > 0)\r
 260                {\r
 261                  alignFrame.hideSelColumns_actionPerformed(null);\r
 262                  if(!toggleSeqs)\r
 263                    av.selectionGroup = sg;\r
 264                }\r
 265                else if(!hide)\r
 266                  alignFrame.showAllColumns_actionPerformed(null);\r
 267              }\r
 268             break;\r
 269           }\r
 270 \r
 271         }\r
 272       }\r
 273     });\r
 274   }\r
 275 \r
 276   /**\r
 277    * DOCUMENT ME!\r
 278    */\r
 279   public void fontChanged()\r
 280   {\r
 281     // set idCanvas bufferedImage to null\r
 282     // to prevent drawing old image\r
 283     FontMetrics fm = getFontMetrics(av.getFont());\r
 284 \r
 285     scalePanelHolder.setPreferredSize(new Dimension(10,\r
 286         av.charHeight + fm.getDescent()));\r
 287     idSpaceFillerPanel1.setPreferredSize(new Dimension(10,\r
 288         av.charHeight + fm.getDescent()));\r
 289 \r
 290     idPanel.idCanvas.gg = null;\r
 291     seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 292     annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 293 \r
 294     Dimension d = calculateIdWidth();\r
 295     d.setSize(d.width + 4, d.height);\r
 296     idPanel.idCanvas.setPreferredSize(d);\r
 297     hscrollFillerPanel.setPreferredSize(d);\r
 298 \r
 299     if (av.getWrapAlignment())\r
 300     {\r
 301       int max = av.alignment.getWidth() /\r
 302           seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.seqCanvas.getWidth());\r
 303       vscroll.setMaximum(max);\r
 304       vscroll.setUnitIncrement(1);\r
 305       vscroll.setVisibleAmount(1);\r
 306     }\r
 307     else\r
 308     {\r
 309       setScrollValues(av.getStartRes(), av.getStartSeq());\r
 310     }\r
 311 \r
 312     if (overviewPanel != null)\r
 313       overviewPanel.setBoxPosition();\r
 314 \r
 315     repaint();\r
 316   }\r
 317 \r
 318   /**\r
 319    * DOCUMENT ME!\r
 320    *\r
 321    * @return DOCUMENT ME!\r
 322    */\r
 323   public Dimension calculateIdWidth()\r
 324   {\r
 325     Container c = new Container();\r
 326 \r
 327     FontMetrics fm = c.getFontMetrics(\r
 328       new Font(av.font.getName(), Font.ITALIC, av.font.getSize()));\r
 329 \r
 330     AlignmentI al = av.getAlignment();\r
 331 \r
 332     int i = 0;\r
 333     int idWidth = 0;\r
 334     String id;\r
 335 \r
 336     while ( (i < al.getHeight()) && (al.getSequenceAt(i) != null))\r
 337     {\r
 338       SequenceI s = al.getSequenceAt(i);\r
 339 \r
 340       id = s.getDisplayId(av.getShowJVSuffix());\r
 341 \r
 342       if (fm.stringWidth(id) > idWidth)\r
 343       {\r
 344 \r
 345         idWidth = fm.stringWidth(id);\r
 346         System.out.println(id+" "+idWidth);\r
 347       }\r
 348 \r
 349       i++;\r
 350     }\r
 351 \r
 352     // Also check annotation label widths\r
 353     i = 0;\r
 354 \r
 355     if (al.getAlignmentAnnotation() != null)\r
 356     {\r
 357       fm = c.getFontMetrics(alabels.getFont());\r
 358 \r
 359       while (i < al.getAlignmentAnnotation().length)\r
 360       {\r
 361         String label = al.getAlignmentAnnotation()[i].label;\r
 362 \r
 363         if (fm.stringWidth(label) > idWidth)\r
 364         {\r
 365           idWidth = fm.stringWidth(label);\r
 366         }\r
 367 \r
 368         i++;\r
 369       }\r
 370     }\r
 371     System.out.println(idWidth);\r
 372     return new Dimension(idWidth, 12);\r
 373   }\r
 374 \r
 375   /**\r
 376    * DOCUMENT ME!\r
 377    *\r
 378    * @param results DOCUMENT ME!\r
 379    */\r
 380   public void highlightSearchResults(SearchResults results)\r
 381   {\r
 382     seqPanel.seqCanvas.highlightSearchResults(results);\r
 383 \r
 384     // do we need to scroll the panel?\r
 385     if (results != null)\r
 386     {\r
 387       SequenceI seq = results.getResultSequence(0);\r
 388       int seqIndex = av.alignment.findIndex(seq);\r
 389       int start = seq.findIndex(results.getResultStart(0)) - 1;\r
 390       int end = seq.findIndex(results.getResultEnd(0)) - 1;\r
 391 \r
 392       if(!av.wrapAlignment)\r
 393       {\r
 394         if ( (av.getStartRes() > end)  || (av.getEndRes() < start) ||\r
 395            ( (av.getStartSeq() > seqIndex) || (av.getEndSeq() < seqIndex)))\r
 396         {\r
 397           setScrollValues(start, seqIndex);\r
 398         }\r
 399       }\r
 400       else\r
 401       {\r
 402         scrollToWrappedVisible(start);\r
 403       }\r
 404     }\r
 405   }\r
 406 \r
 407   void scrollToWrappedVisible(int res)\r
 408   {\r
 409     int cwidth = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.seqCanvas.getWidth());\r
 410     if( res<=av.getStartRes() || res>=(av.getStartRes()+cwidth) )\r
 411     {\r
 412       vscroll.setValue(res / cwidth);\r
 413       av.startRes = vscroll.getValue() * cwidth;\r
 414     }\r
 415   }\r
 416 \r
 417   /**\r
 418    * DOCUMENT ME!\r
 419    *\r
 420    * @return DOCUMENT ME!\r
 421    */\r
 422   public OverviewPanel getOverviewPanel()\r
 423   {\r
 424     return overviewPanel;\r
 425   }\r
 426 \r
 427   /**\r
 428    * DOCUMENT ME!\r
 429    *\r
 430    * @param op DOCUMENT ME!\r
 431    */\r
 432   public void setOverviewPanel(OverviewPanel op)\r
 433   {\r
 434     overviewPanel = op;\r
 435   }\r
 436 \r
 437   /**\r
 438    * DOCUMENT ME!\r
 439    *\r
 440    * @param b DOCUMENT ME!\r
 441    */\r
 442   public void setAnnotationVisible(boolean b)\r
 443   {\r
 444     if (!av.wrapAlignment)\r
 445     {\r
 446       annotationSpaceFillerHolder.setVisible(b);\r
 447       annotationScroller.setVisible(b);\r
 448     }\r
 449     repaint();\r
 450   }\r
 451 \r
 452   public void adjustAnnotationHeight()\r
 453   {\r
 454     javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 455     {\r
 456       public void run()\r
 457       {\r
 458           while(alignFrame.getHeight()==0)\r
 459           {\r
 460             Thread.yield();\r
 461           }\r
 462 \r
 463         int height = annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 464 \r
 465         if (height > alignFrame.getHeight() / 2)\r
 466         {\r
 467           height = alignFrame.getHeight() / 2;\r
 468         }\r
 469 \r
 470         annotationScroller.setPreferredSize(\r
 471             new Dimension(annotationScroller.getWidth(),\r
 472                           height));\r
 473 \r
 474         annotationSpaceFillerHolder.setPreferredSize(new Dimension(\r
 475             annotationSpaceFillerHolder.getWidth(),\r
 476             height));\r
 477 \r
 478         annotationPanel.repaint();\r
 479         repaint();\r
 480       }\r
 481     });\r
 482   }\r
 483 \r
 484   /**\r
 485    * DOCUMENT ME!\r
 486    *\r
 487    * @param wrap DOCUMENT ME!\r
 488    */\r
 489   public void setWrapAlignment(boolean wrap)\r
 490   {\r
 491     av.startSeq = 0;\r
 492     scalePanelHolder.setVisible(!wrap);\r
 493     hscroll.setVisible(!wrap);\r
 494     idwidthAdjuster.setVisible(!wrap);\r
 495 \r
 496     if (wrap)\r
 497     {\r
 498       annotationScroller.setVisible(false);\r
 499       annotationSpaceFillerHolder.setVisible(false);\r
 500     }\r
 501     else if (av.showAnnotation)\r
 502     {\r
 503       annotationScroller.setVisible(true);\r
 504       annotationSpaceFillerHolder.setVisible(true);\r
 505     }\r
 506 \r
 507     idSpaceFillerPanel1.setVisible(!wrap);\r
 508 \r
 509     repaint();\r
 510   }\r
 511 \r
 512   // return value is true if the scroll is valid\r
 513   public boolean scrollUp(boolean up)\r
 514   {\r
 515     if (up)\r
 516     {\r
 517       if (vscroll.getValue() < 1)\r
 518       {\r
 519         return false;\r
 520       }\r
 521 \r
 522       fastPaint = false;\r
 523       vscroll.setValue(vscroll.getValue() - 1);\r
 524     }\r
 525     else\r
 526     {\r
 527       if ( (vextent + vscroll.getValue()) >= av.getAlignment().getHeight())\r
 528       {\r
 529         return false;\r
 530       }\r
 531 \r
 532       fastPaint = false;\r
 533       vscroll.setValue(vscroll.getValue() + 1);\r
 534     }\r
 535 \r
 536     fastPaint = true;\r
 537 \r
 538     return true;\r
 539   }\r
 540 \r
 541   /**\r
 542    * DOCUMENT ME!\r
 543    *\r
 544    * @param right DOCUMENT ME!\r
 545    *\r
 546    * @return DOCUMENT ME!\r
 547    */\r
 548   public boolean scrollRight(boolean right)\r
 549   {\r
 550     if (!right)\r
 551     {\r
 552       if (hscroll.getValue() < 1)\r
 553       {\r
 554         return false;\r
 555       }\r
 556 \r
 557       fastPaint = false;\r
 558       hscroll.setValue(hscroll.getValue() - 1);\r
 559     }\r
 560     else\r
 561     {\r
 562       if ( (hextent + hscroll.getValue()) >= av.getAlignment().getWidth())\r
 563       {\r
 564         return false;\r
 565       }\r
 566 \r
 567       fastPaint = false;\r
 568       hscroll.setValue(hscroll.getValue() + 1);\r
 569     }\r
 570 \r
 571     fastPaint = true;\r
 572 \r
 573     return true;\r
 574   }\r
 575 \r
 576   /**\r
 577    * DOCUMENT ME!\r
 578    *\r
 579    * @param x DOCUMENT ME!\r
 580    * @param y DOCUMENT ME!\r
 581    */\r
 582   public void setScrollValues(int x, int y)\r
 583   {\r
 584 \r
 585     int width = av.alignment.getWidth();\r
 586     int height = av.alignment.getHeight();\r
 587 \r
 588     if(av.hasHiddenColumns)\r
 589      width = av.getColumnSelection().findColumnPosition(width);\r
 590 \r
 591     av.setEndRes( (x + (seqPanel.seqCanvas.getWidth() / av.charWidth)) -1);\r
 592 \r
 593     hextent = seqPanel.seqCanvas.getWidth() / av.charWidth;\r
 594     vextent = seqPanel.seqCanvas.getHeight() / av.charHeight;\r
 595 \r
 596     if (hextent > width)\r
 597     {\r
 598       hextent = width;\r
 599     }\r
 600 \r
 601     if (vextent > height)\r
 602     {\r
 603       vextent = height;\r
 604     }\r
 605 \r
 606     if ( (hextent + x) > width)\r
 607     {\r
 608       x = width - hextent;\r
 609     }\r
 610 \r
 611     if ( (vextent + y) > height)\r
 612     {\r
 613       y = height - vextent;\r
 614     }\r
 615 \r
 616     if (y < 0)\r
 617     {\r
 618       y = 0;\r
 619     }\r
 620 \r
 621     if (x < 0)\r
 622     {\r
 623       x = 0;\r
 624     }\r
 625 \r
 626     hscroll.setValues(x, hextent, 0, width);\r
 627     vscroll.setValues(y, vextent, 0, height);\r
 628   }\r
 629 \r
 630   /**\r
 631    * DOCUMENT ME!\r
 632    *\r
 633    * @param evt DOCUMENT ME!\r
 634    */\r
 635   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)\r
 636   {\r
 637 \r
 638     int oldX = av.getStartRes();\r
 639     int oldY = av.getStartSeq();\r
 640 \r
 641     if (evt.getSource() == hscroll)\r
 642     {\r
 643       int x = hscroll.getValue();\r
 644       av.setStartRes(x);\r
 645       av.setEndRes( (x +\r
 646                      (seqPanel.seqCanvas.getWidth() / av.getCharWidth())) - 1);\r
 647     }\r
 648 \r
 649     if (evt.getSource() == vscroll)\r
 650     {\r
 651       int offy = vscroll.getValue();\r
 652 \r
 653       if (av.getWrapAlignment())\r
 654       {\r
 655         if(offy>-1)\r
 656         {\r
 657           int rowSize = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.\r
 658               seqCanvas.getWidth());\r
 659           av.setStartRes(offy * rowSize);\r
 660           av.setEndRes( (offy + 1) * rowSize);\r
 661         }\r
 662         else\r
 663         {\r
 664           //This is only called if file loaded is a jar file that\r
 665           //was wrapped when saved and user has wrap alignment true\r
 666           //as preference setting\r
 667           SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 668               {\r
 669                 public void run()\r
 670                 {\r
 671                   setScrollValues(av.getStartRes(), av.getStartSeq());\r
 672                 }\r
 673               });\r
 674         }\r
 675       }\r
 676       else\r
 677       {\r
 678         av.setStartSeq(offy);\r
 679         av.setEndSeq(offy +\r
 680                      (seqPanel.seqCanvas.getHeight() / av.getCharHeight()));\r
 681       }\r
 682     }\r
 683 \r
 684     if (overviewPanel != null)\r
 685     {\r
 686       overviewPanel.setBoxPosition();\r
 687     }\r
 688 \r
 689     int scrollX = av.startRes - oldX;\r
 690     int scrollY = av.startSeq - oldY;\r
 691 \r
 692     if (av.getWrapAlignment() || !fastPaint)\r
 693     {\r
 694       repaint();\r
 695     }\r
 696     else\r
 697     {\r
 698       // Make sure we're not trying to draw a panel\r
 699       // larger than the visible window\r
 700       if(scrollX>av.endRes-av.startRes)\r
 701         scrollX = av.endRes-av.startRes;\r
 702       else if(scrollX<av.startRes-av.endRes)\r
 703         scrollX = av.startRes - av.endRes;\r
 704 \r
 705       if(scrollX!=0 || scrollY!=0)\r
 706       {\r
 707         idPanel.idCanvas.fastPaint(scrollY);\r
 708         seqPanel.seqCanvas.fastPaint(scrollX,\r
 709                                      scrollY);\r
 710         scalePanel.repaint();\r
 711 \r
 712         if (av.getShowAnnotation())\r
 713         {\r
 714           annotationPanel.fastPaint(scrollX);\r
 715         }\r
 716       }\r
 717     }\r
 718   }\r
 719 \r
 720   /**\r
 721    * DOCUMENT ME!\r
 722    *\r
 723    * @param g DOCUMENT ME!\r
 724    */\r
 725   public void paintComponent(Graphics g)\r
 726   {\r
 727     invalidate();\r
 728 \r
 729     Dimension d = idPanel.idCanvas.getPreferredSize();\r
 730     idPanelHolder.setPreferredSize(d);\r
 731     hscrollFillerPanel.setPreferredSize(new Dimension(d.width, 12));\r
 732     validate();\r
 733 \r
 734     if (av.getWrapAlignment())\r
 735     {\r
 736       int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
 737 \r
 738       if (av.hasHiddenColumns)\r
 739         maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth) - 1;\r
 740 \r
 741       int max = maxwidth /\r
 742           seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.seqCanvas.getWidth()) +\r
 743           1;\r
 744 \r
 745 \r
 746       vscroll.setMaximum(max);\r
 747       vscroll.setUnitIncrement(1);\r
 748       vscroll.setVisibleAmount(1);\r
 749     }\r
 750     else\r
 751     {\r
 752       setScrollValues(av.getStartRes(), av.getStartSeq());\r
 753     }\r
 754 \r
 755     if( this.getVisibleRect().getBounds() == g.getClipBounds()\r
 756         && overviewPanel != null)\r
 757         overviewPanel.updateOverviewImage();\r
 758 \r
 759   }\r
 760 \r
 761   /**\r
 762    * DOCUMENT ME!\r
 763    *\r
 764    * @param pg DOCUMENT ME!\r
 765    * @param pf DOCUMENT ME!\r
 766    * @param pi DOCUMENT ME!\r
 767    *\r
 768    * @return DOCUMENT ME!\r
 769    *\r
 770    * @throws PrinterException DOCUMENT ME!\r
 771    */\r
 772   public int print(Graphics pg, PageFormat pf, int pi)\r
 773       throws PrinterException\r
 774   {\r
 775     pg.translate( (int) pf.getImageableX(), (int) pf.getImageableY());\r
 776 \r
 777     int pwidth = (int) pf.getImageableWidth();\r
 778     int pheight = (int) pf.getImageableHeight();\r
 779 \r
 780     if (av.getWrapAlignment())\r
 781     {\r
 782       return printWrappedAlignment(pg, pwidth, pheight, pi);\r
 783     }\r
 784     else\r
 785     {\r
 786       return printUnwrapped(pg, pwidth, pheight, pi);\r
 787     }\r
 788   }\r
 789 \r
 790   /**\r
 791    * DOCUMENT ME!\r
 792    *\r
 793    * @param pg DOCUMENT ME!\r
 794    * @param pwidth DOCUMENT ME!\r
 795    * @param pheight DOCUMENT ME!\r
 796    * @param pi DOCUMENT ME!\r
 797    *\r
 798    * @return DOCUMENT ME!\r
 799    *\r
 800    * @throws PrinterException DOCUMENT ME!\r
 801    */\r
 802   public int printUnwrapped(Graphics pg, int pwidth, int pheight, int pi)\r
 803       throws PrinterException\r
 804   {\r
 805     int idWidth = getVisibleIdWidth();\r
 806     FontMetrics fm = getFontMetrics(av.getFont());\r
 807     int scaleHeight = av.charHeight + fm.getDescent();\r
 808 \r
 809     pg.setColor(Color.white);\r
 810     pg.fillRect(0, 0, pwidth, pheight);\r
 811     pg.setFont(av.getFont());\r
 812 \r
 813     ////////////////////////////////////\r
 814     /// How many sequences and residues can we fit on a printable page?\r
 815     int totalRes = (pwidth - idWidth) / av.getCharWidth();\r
 816 \r
 817     int totalSeq = (int) ( (pheight - scaleHeight) / av.getCharHeight()) -\r
 818         1;\r
 819 \r
 820     int pagesWide = (av.getAlignment().getWidth() / totalRes) + 1;\r
 821 \r
 822     /////////////////////////////\r
 823     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 824     int startRes;\r
 825 \r
 826     /////////////////////////////\r
 827     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 828     int endRes;\r
 829 \r
 830     /////////////////////////////\r
 831     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 832     int startSeq;\r
 833 \r
 834     /////////////////////////////\r
 835     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 836     int endSeq;\r
 837     startRes = (pi % pagesWide) * totalRes;\r
 838     endRes = (startRes + totalRes) - 1;\r
 839 \r
 840     if (endRes > (av.getAlignment().getWidth() - 1))\r
 841     {\r
 842       endRes = av.getAlignment().getWidth() - 1;\r
 843     }\r
 844 \r
 845     startSeq = (pi / pagesWide) * totalSeq;\r
 846     endSeq = startSeq + totalSeq;\r
 847 \r
 848     if (endSeq > av.getAlignment().getHeight())\r
 849     {\r
 850       endSeq = av.getAlignment().getHeight();\r
 851     }\r
 852 \r
 853     int pagesHigh = ( (av.alignment.getHeight() / totalSeq) + 1) * pheight;\r
 854 \r
 855     if (av.showAnnotation)\r
 856     {\r
 857       pagesHigh += annotationPanel.adjustPanelHeight() + 3;\r
 858     }\r
 859 \r
 860     pagesHigh /= pheight;\r
 861 \r
 862     if (pi >= (pagesWide * pagesHigh))\r
 863     {\r
 864       return Printable.NO_SUCH_PAGE;\r
 865     }\r
 866 \r
 867     //draw Scale\r
 868     pg.translate(idWidth, 0);\r
 869     scalePanel.drawScale(pg, startRes, endRes, pwidth - idWidth, scaleHeight);\r
 870     pg.translate( -idWidth, scaleHeight);\r
 871 \r
 872     ////////////////\r
 873     // Draw the ids\r
 874     Color currentColor = null;\r
 875     Color currentTextColor = null;\r
 876 \r
 877     pg.setFont(new Font(av.getFont().getName(),\r
 878                         Font.ITALIC,\r
 879                         av.getFont().getSize()));\r
 880     for (int i = startSeq; i < endSeq; i++)\r
 881     {\r
 882       if ( (av.getSelectionGroup() != null) &&\r
 883           av.getSelectionGroup().getSequences(false).contains(\r
 884               av.getAlignment().getSequenceAt(i)))\r
 885       {\r
 886         currentColor = Color.gray;\r
 887         currentTextColor = Color.black;\r
 888       }\r
 889       else\r
 890       {\r
 891         currentColor = av.getAlignment().getSequenceAt(i).getColor();\r
 892         currentTextColor = Color.black;\r
 893       }\r
 894 \r
 895       pg.setColor(currentColor);\r
 896       pg.fillRect(0, (i - startSeq) * av.charHeight, idWidth,\r
 897                   av.getCharHeight());\r
 898 \r
 899       pg.setColor(currentTextColor);\r
 900 \r
 901       String string = av.getAlignment().getSequenceAt(i).getDisplayId\r
 902           ( av.getShowJVSuffix());\r
 903 \r
 904       pg.drawString(string, 0,\r
 905                     ( ( (i - startSeq) * av.charHeight) + av.getCharHeight()) -\r
 906                     (av.getCharHeight() / 5));\r
 907     }\r
 908 \r
 909     pg.setFont(av.getFont());\r
 910 \r
 911     // draw main sequence panel\r
 912     pg.translate(idWidth, 0);\r
 913     seqPanel.seqCanvas.drawPanel(pg, startRes, endRes, startSeq, endSeq, 0);\r
 914 \r
 915     if (av.showAnnotation && (endSeq == av.alignment.getHeight()))\r
 916     {\r
 917       pg.translate( -idWidth-3, (endSeq - startSeq) * av.charHeight + 3);\r
 918       alabels.drawComponent( (Graphics2D) pg, idWidth);\r
 919       pg.translate(idWidth+3, 0);\r
 920       annotationPanel.drawComponent( (Graphics2D) pg, startRes, endRes +\r
 921                                     1);\r
 922     }\r
 923 \r
 924     return Printable.PAGE_EXISTS;\r
 925   }\r
 926 \r
 927   /**\r
 928    * DOCUMENT ME!\r
 929    *\r
 930    * @param pg DOCUMENT ME!\r
 931    * @param pwidth DOCUMENT ME!\r
 932    * @param pheight DOCUMENT ME!\r
 933    * @param pi DOCUMENT ME!\r
 934    *\r
 935    * @return DOCUMENT ME!\r
 936    *\r
 937    * @throws PrinterException DOCUMENT ME!\r
 938    */\r
 939   public int printWrappedAlignment(Graphics pg, int pwidth, int pheight,\r
 940                                    int pi)\r
 941       throws PrinterException\r
 942   {\r
 943 \r
 944     int annotationHeight = 0;\r
 945     AnnotationLabels labels = null;\r
 946     if (av.showAnnotation)\r
 947     {\r
 948       annotationHeight = annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 949       labels = new AnnotationLabels(av);\r
 950     }\r
 951 \r
 952     int hgap = av.charHeight;\r
 953     if (av.scaleAboveWrapped)\r
 954       hgap += av.charHeight;\r
 955 \r
 956     int cHeight = av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight\r
 957         + hgap\r
 958         + annotationHeight;\r
 959 \r
 960     int idWidth = getVisibleIdWidth();\r
 961 \r
 962     int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
 963     if (av.hasHiddenColumns)\r
 964       maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth) - 1;\r
 965 \r
 966 \r
 967     int resWidth = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(pwidth -\r
 968         idWidth);\r
 969 \r
 970     int totalHeight = cHeight * (maxwidth / resWidth + 1);\r
 971 \r
 972     pg.setColor(Color.white);\r
 973     pg.fillRect(0, 0, pwidth, pheight);\r
 974     pg.setFont(av.getFont());\r
 975 \r
 976     ////////////////\r
 977     // Draw the ids\r
 978     pg.setColor(Color.black);\r
 979 \r
 980     pg.translate(0, -pi * pheight);\r
 981 \r
 982     pg.setClip(0, pi * pheight, pwidth, pheight);\r
 983 \r
 984     int ypos = hgap;\r
 985     Font italic = new Font(av.getFont().getName(), Font.ITALIC,\r
 986                            av.getFont().getSize());\r
 987     pg.setFont(italic);\r
 988 \r
 989     do\r
 990     {\r
 991       for (int i = 0; i < av.alignment.getHeight(); i++)\r
 992       {\r
 993         SequenceI s = av.alignment.getSequenceAt(i);\r
 994         String string = s.getDisplayId( av.getShowJVSuffix());\r
 995 \r
 996         pg.drawString(string, 0,\r
 997                       ( (i * av.charHeight) + ypos + av.charHeight) -\r
 998                       (av.charHeight / 5));\r
 999       }\r
1000       if (labels != null)\r
1001       {\r
1002         pg.translate(-3,\r
1003                      ypos +\r
1004                      (av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight));\r
1005 \r
1006         pg.setFont(av.getFont());\r
1007         labels.drawComponent(pg, idWidth);\r
1008         pg.setFont(italic);\r
1009         pg.translate(+3,\r
1010                      -ypos -\r
1011                      (av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight));\r
1012       }\r
1013 \r
1014       ypos += cHeight;\r
1015     }\r
1016     while (ypos < totalHeight);\r
1017 \r
1018     pg.translate(idWidth, 0);\r
1019 \r
1020     seqPanel.seqCanvas.drawWrappedPanel(pg, pwidth - idWidth, totalHeight, 0);\r
1021 \r
1022     if ( (pi * pheight) < totalHeight)\r
1023     {\r
1024       return Printable.PAGE_EXISTS;\r
1025 \r
1026     }\r
1027     else\r
1028     {\r
1029       return Printable.NO_SUCH_PAGE;\r
1030     }\r
1031   }\r
1032 \r
1033   int getVisibleIdWidth()\r
1034   {\r
1035     return\r
1036         idPanel.getWidth() > 0 ? idPanel.getWidth() :\r
1037         calculateIdWidth().width + 4;\r
1038   }\r
1039 \r
1040   void makeAlignmentImage(int type, File file)\r
1041   {\r
1042     int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
1043     if (av.hasHiddenColumns)\r
1044       maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth);\r
1045 \r
1046     int height = ( (av.alignment.getHeight() + 1) * av.charHeight) + 30;\r
1047     int width = getVisibleIdWidth() + (maxwidth * av.charWidth);\r
1048 \r
1049     if (av.getWrapAlignment())\r
1050     {\r
1051       height = getWrappedHeight();\r
1052       if (System.getProperty("java.awt.headless") != null\r
1053           && System.getProperty("java.awt.headless").equals("true"))\r
1054       {\r
1055         width = alignFrame.getWidth() - 22;\r
1056       }\r
1057       else\r
1058         width = seqPanel.getWidth() + getVisibleIdWidth();\r
1059 \r
1060     }\r
1061     else if (av.getShowAnnotation())\r
1062     {\r
1063       height += annotationPanel.adjustPanelHeight() + 3;\r
1064     }\r
1065 \r
1066     jalview.util.ImageMaker im;\r
1067     if(type==jalview.util.ImageMaker.PNG)\r
1068       im  = new jalview.util.ImageMaker(this,\r
1069                                         jalview.util.ImageMaker.PNG,\r
1070                                         "Create PNG image from alignment",\r
1071                                         width, height, file, null);\r
1072     else\r
1073       im = new jalview.util.ImageMaker(this,\r
1074                                         jalview.util.ImageMaker.EPS,\r
1075                                        "Create EPS file from alignment",\r
1076                                         width, height, file, alignFrame.getTitle() );\r
1077 \r
1078     try\r
1079     {\r
1080       if (av.getWrapAlignment())\r
1081       {\r
1082         if(im.getGraphics()!=null)\r
1083         {\r
1084           printWrappedAlignment(im.getGraphics(), width, height, 0);\r
1085           im.writeImage();\r
1086         }\r
1087       }\r
1088       else\r
1089       {\r
1090         if(im.getGraphics()!=null)\r
1091         {\r
1092           printUnwrapped(im.getGraphics(), width, height, 0);\r
1093           im.writeImage();\r
1094         }\r
1095       }\r
1096     }\r
1097     catch (OutOfMemoryError err)\r
1098     {\r
1099       System.out.println("########################\n"\r
1100                          + "OUT OF MEMORY " + file + "\n"\r
1101                          + "########################");\r
1102 \r
1103       JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,\r
1104                                             "Out of Memory Creating Image!!"\r
1105                                             +\r
1106                                             "\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory."\r
1107                                             , "Out of memory",\r
1108                                             JOptionPane.WARNING_MESSAGE);\r
1109       System.out.println("Create IMAGE: " + err);\r
1110       System.gc();\r
1111 \r
1112     }\r
1113     catch (Exception ex)\r
1114     {\r
1115       ex.printStackTrace();\r
1116     }\r
1117   }\r
1118   /**\r
1119    * DOCUMENT ME!\r
1120    */\r
1121   public void makeEPS(File epsFile)\r
1122   {\r
1123     makeAlignmentImage(jalview.util.ImageMaker.EPS, epsFile);\r
1124   }\r
1125 \r
1126   /**\r
1127    * DOCUMENT ME!\r
1128    */\r
1129   public void makePNG(File pngFile)\r
1130   {\r
1131     makeAlignmentImage(jalview.util.ImageMaker.PNG, pngFile);\r
1132   }\r
1133 \r
1134   public void makePNGImageMap(File imgMapFile, String imageName)\r
1135   {\r
1136     ///////ONLY WORKS WITH NONE WRAPPED ALIGNMENTS\r
1137     //////////////////////////////////////////////\r
1138     int idWidth = getVisibleIdWidth();\r
1139     FontMetrics fm = getFontMetrics(av.getFont());\r
1140     int scaleHeight = av.charHeight + fm.getDescent();\r
1141 \r
1142     // Gen image map\r
1143     //////////////////////////////////\r
1144     if (imgMapFile != null)\r
1145     {\r
1146       try\r
1147       {\r
1148         int s, sSize = av.alignment.getHeight(),\r
1149             res, alwidth = av.alignment.getWidth(), g, gSize, f, fSize, sy;\r
1150         StringBuffer text = new StringBuffer();\r
1151         PrintWriter out = new PrintWriter(new FileWriter(imgMapFile));\r
1152         out.println(jalview.io.HTMLOutput.getImageMapHTML());\r
1153         out.println("<img src=\"" + imageName +\r
1154                     "\" border=\"0\" usemap=\"#Map\" >"\r
1155                     + "<map name=\"Map\">");\r
1156 \r
1157         for (s = 0; s < sSize; s++)\r
1158         {\r
1159           sy = s * av.charHeight + scaleHeight;\r
1160 \r
1161           SequenceI seq = av.alignment.getSequenceAt(s);\r
1162           SequenceFeature [] features = seq.getDatasetSequence().getSequenceFeatures();\r
1163           SequenceGroup[] groups = av.alignment.findAllGroups(seq);\r
1164           for(res =0; res<alwidth; res++)\r
1165           {\r
1166             text = new StringBuffer();\r
1167             Object obj = null;\r
1168             if(av.alignment.isNucleotide())\r
1169               obj = ResidueProperties.nucleotideName.get(seq.getCharAt(res)+"" );\r
1170             else\r
1171               obj = ResidueProperties.aa2Triplet.get(\r
1172                     seq.getCharAt(res) + "");\r
1173 \r
1174               if (obj == null)\r
1175                   continue;\r
1176 \r
1177             String triplet = obj.toString();\r
1178             int alIndex = seq.findPosition(res);\r
1179             gSize = groups.length;\r
1180             for (g = 0; g < gSize; g++)\r
1181             {\r
1182               if(text.length()<1)\r
1183               {\r
1184                 text.append("<area shape=\"rect\" coords=\""\r
1185                   + (idWidth + res * av.charWidth) + ","\r
1186                   + sy + ","\r
1187                   + (idWidth + (res + 1) * av.charWidth) + ","\r
1188                   + (av.charHeight + sy) + "\""\r
1189                   + " onMouseOver=\"toolTip('"\r
1190                   + alIndex + " " + triplet );\r
1191               }\r
1192 \r
1193               if(groups[g].getStartRes()<res && groups[g].getEndRes()>res)\r
1194                 text.append("<br><em>" + groups[g].getName() + "</em>");\r
1195             }\r
1196 \r
1197             if (features != null)\r
1198             {\r
1199               if(text.length()<1)\r
1200               {\r
1201                 text.append("<area shape=\"rect\" coords=\""\r
1202                   + (idWidth + res * av.charWidth) + ","\r
1203                   + sy + ","\r
1204                   + (idWidth + (res + 1) * av.charWidth) + ","\r
1205                   + (av.charHeight + sy) + "\""\r
1206                   + " onMouseOver=\"toolTip('"\r
1207                   + alIndex + " " + triplet );\r
1208               }\r
1209                 fSize = features.length;\r
1210                 for (f = 0; f < fSize; f++)\r
1211                 {\r
1212 \r
1213                   if ( (features[f].getBegin() <= seq.findPosition(res)) &&\r
1214                       (features[f].getEnd() >= seq.findPosition(res)))\r
1215                   {\r
1216                     if (features[f].getType().equals("disulfide bond"))\r
1217                     {\r
1218                       if (features[f].getBegin() == seq.findPosition(res)\r
1219                           || features[f].getEnd() == seq.findPosition(res))\r
1220                       {\r
1221                         text.append("<br>disulfide bond " + features[f].getBegin() + ":" +\r
1222                                        features[f].getEnd());\r
1223                       }\r
1224                     }\r
1225                     else\r
1226                     {\r
1227                       text.append("<br>");\r
1228                       text.append(features[f].getType());\r
1229                       if (features[f].getDescription() != null && !features[f].getType().equals(features[f].getDescription()))\r
1230                         text.append(" " + features[f].getDescription());\r
1231 \r
1232                       if (features[f].getValue("status") != null )\r
1233                       {\r
1234                         text.append(" (" + features[f].getValue("status") + ")");\r
1235                       }\r
1236                     }\r
1237                   }\r
1238 \r
1239                 }\r
1240               }\r
1241               if(text.length()>1)\r
1242               {\r
1243                 text.append("')\"; onMouseOut=\"toolTip()\";  href=\"#\">");\r
1244                 out.println(text.toString());\r
1245               }\r
1246             }\r
1247           }\r
1248         out.println("</map></body></html>");\r
1249         out.close();\r
1250 \r
1251       }\r
1252       catch (Exception ex)\r
1253       {\r
1254         ex.printStackTrace();\r
1255       }\r
1256     } ///////////END OF IMAGE MAP\r
1257 \r
1258   }\r
1259 \r
1260   int getWrappedHeight()\r
1261   {\r
1262     int seqPanelWidth = seqPanel.seqCanvas.getWidth();\r
1263 \r
1264     //If headless, seqPanel will have 0 width\r
1265     if (System.getProperty("java.awt.headless") != null\r
1266               && System.getProperty("java.awt.headless").equals("true"))\r
1267     {\r
1268       seqPanelWidth = alignFrame.getWidth() - getVisibleIdWidth();\r
1269     }\r
1270 \r
1271     int chunkWidth = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(\r
1272         seqPanelWidth\r
1273           );\r
1274 \r
1275     int hgap = av.charHeight;\r
1276     if (av.scaleAboveWrapped)\r
1277       hgap += av.charHeight;\r
1278 \r
1279     int annotationHeight = 0;\r
1280     if (av.showAnnotation)\r
1281     {\r
1282       annotationHeight = annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
1283     }\r
1284 \r
1285     int cHeight = av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight\r
1286         + hgap\r
1287         + annotationHeight;\r
1288 \r
1289     int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
1290     if (av.hasHiddenColumns)\r
1291       maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth) - 1;\r
1292 \r
1293 \r
1294     int height = ( (maxwidth / chunkWidth) + 1) * cHeight;\r
1295 \r
1296     return height;\r
1297   }\r
1298 \r
1299   /**\r
1300    * DOCUMENT ME!\r
1301    *\r
1302    * @author $author$\r
1303    * @version $Revision$\r
1304    */\r
1305   class Preview\r
1306       extends JFrame\r
1307   {\r
1308     /**\r
1309      * Creates a new Preview object.\r
1310      *\r
1311      * @param image DOCUMENT ME!\r
1312      */\r
1313     public Preview(Image image)\r
1314     {\r
1315       setResizable(true);\r
1316       setSize(image.getWidth(this), image.getHeight(this));\r
1317       setVisible(true);\r
1318       getContentPane().setLayout(new BorderLayout());\r
1319       getContentPane().add(new PreviewPanel(image), BorderLayout.CENTER);\r
1320       validate();\r
1321       repaint();\r
1322     }\r
1323   }\r
1324 \r
1325   /**\r
1326    * DOCUMENT ME!\r
1327    *\r
1328    * @author $author$\r
1329    * @version $Revision$\r
1330    */\r
1331   class PreviewPanel\r
1332       extends JPanel\r
1333   {\r
1334     Image image;\r
1335 \r
1336     /**\r
1337      * Creates a new PreviewPanel object.\r
1338      *\r
1339      * @param image DOCUMENT ME!\r
1340      */\r
1341     public PreviewPanel(Image image)\r
1342     {\r
1343       this.image = image;\r
1344     }\r
1345 \r
1346     /**\r
1347      * DOCUMENT ME!\r
1348      *\r
1349      * @param g DOCUMENT ME!\r
1350      */\r
1351     public void paintComponent(Graphics g)\r
1352     {\r
1353       if (image != null)\r
1354       {\r
1355         g.drawImage(image, 0, 0, this);\r
1356       }\r
1357       else\r
1358       {\r
1359         System.out.println("DEBUG:image is null");\r
1360       }\r
1361     }\r
1362   }\r
1363 }\r