src/jalview/gui/ColumnSelection.java

   1 /*\r
   2 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3 * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4 *\r
   5 * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6 * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7 * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8 * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9 *\r
  10 * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13 * GNU General Public License for more details.\r
  14 *\r
  15 * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16 * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18 */\r
  19 \r
  20 package jalview.gui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 /**\r
  25  * NOTE: Columns are zero based.\r
  26  */\r
  27 public class ColumnSelection{\r
  28   Vector selected = new Vector();\r
  29 \r
  30   public void addElement(int col) {\r
  31     selected.addElement(new Integer(col));\r
  32   }\r
  33 \r
  34   public void clear() {\r
  35     selected.removeAllElements();\r
  36   }\r
  37 \r
  38   public void removeElement(int col) {\r
  39     Integer colInt = new Integer(col);\r
  40     if (selected.contains(colInt)) {\r
  41       selected.removeElement(colInt);\r
  42     } else {\r
  43       System.err.println("WARNING: Tried to remove Integer NOT in ColumnSelection");\r
  44     }\r
  45   }\r
  46 \r
  47   public boolean contains(int col) {\r
  48     return selected.contains(new Integer(col));\r
  49   }\r
  50 \r
  51   public int columnAt(int i) {\r
  52     return ((Integer)selected.elementAt(i)).intValue();\r
  53   }\r
  54 \r
  55   public int size() {\r
  56     return selected.size();\r
  57   }\r
  58 \r
  59   public int getMax() {\r
  60     int max = -1;\r
  61 \r
  62     for (int i=0;i<selected.size();i++) {\r
  63       if (columnAt(i) > max) {\r
  64         max = columnAt(i);\r
  65       }\r
  66     }\r
  67     return max;\r
  68   }\r
  69 \r
  70   public int getMin() {\r
  71     int min = 1000000000;\r
  72 \r
  73     for (int i=0;i<selected.size();i++) {\r
  74       if (columnAt(i) < min) {\r
  75         min = columnAt(i);\r
  76       }\r
  77     }\r
  78     return min;\r
  79   }\r
  80 \r
  81   public Vector asVector() {\r
  82     return selected;\r
  83   }\r
  84 \r
  85   public void compensateForEdit(int start, int change) {\r
  86     for (int i=0; i < size();i++) {\r
  87       int temp = columnAt(i);\r
  88 \r
  89       if (temp >= start)\r
  90         selected.setElementAt(new Integer(temp-change),i);\r
  91     }\r
  92   }\r
  93 }\r