Formatted source
[jalview.git] / src / jalview / gui / ColumnSelection.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  *\r
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
9  *\r
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
13  * GNU General Public License for more details.\r
14  *\r
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
18  */\r
19 package jalview.gui;\r
20 \r
21 import java.util.*;\r
22 \r
23 /**\r
24  * NOTE: Columns are zero based.\r
25  */\r
26 public class ColumnSelection\r
27 {\r
28   Vector selected = new Vector();\r
29 \r
30   public void addElement(int col)\r
31   {\r
32     selected.addElement(new Integer(col));\r
33   }\r
34 \r
35   public void clear()\r
36   {\r
37     selected.removeAllElements();\r
38   }\r
39 \r
40   public void removeElement(int col)\r
41   {\r
42     Integer colInt = new Integer(col);\r
43 \r
44     if (selected.contains(colInt))\r
45     {\r
46       selected.removeElement(colInt);\r
47     }\r
48     else\r
49     {\r
50       System.err.println(\r
51           "WARNING: Tried to remove Integer NOT in ColumnSelection");\r
52     }\r
53   }\r
54 \r
55   public boolean contains(int col)\r
56   {\r
57     return selected.contains(new Integer(col));\r
58   }\r
59 \r
60   public int columnAt(int i)\r
61   {\r
62     return ( (Integer) selected.elementAt(i)).intValue();\r
63   }\r
64 \r
65   public int size()\r
66   {\r
67     return selected.size();\r
68   }\r
69 \r
70   public int getMax()\r
71   {\r
72     int max = -1;\r
73 \r
74     for (int i = 0; i < selected.size(); i++)\r
75     {\r
76       if (columnAt(i) > max)\r
77       {\r
78         max = columnAt(i);\r
79       }\r
80     }\r
81 \r
82     return max;\r
83   }\r
84 \r
85   public int getMin()\r
86   {\r
87     int min = 1000000000;\r
88 \r
89     for (int i = 0; i < selected.size(); i++)\r
90     {\r
91       if (columnAt(i) < min)\r
92       {\r
93         min = columnAt(i);\r
94       }\r
95     }\r
96 \r
97     return min;\r
98   }\r
99 \r
100   public Vector asVector()\r
101   {\r
102     return selected;\r
103   }\r
104 \r
105   public void compensateForEdit(int start, int change)\r
106   {\r
107     for (int i = 0; i < size(); i++)\r
108     {\r
109       int temp = columnAt(i);\r
110 \r
111       if (temp >= start)\r
112       {\r
113         selected.setElementAt(new Integer(temp - change), i);\r
114       }\r
115     }\r
116   }\r
117 }\r