src/jalview/gui/IdPanel.java

   1 package jalview.gui;\r
   2 \r
   3 import java.awt.*;\r
   4 import java.awt.event.*;\r
   5 \r
   6 import jalview.datamodel.*;\r
   7 \r
   8 import javax.swing.*;\r
   9 \r
  10 public class IdPanel extends JPanel implements MouseListener, MouseMotionListener {\r
  11 \r
  12   protected IdCanvas       idCanvas;\r
  13   protected AlignViewport  av;\r
  14   protected AlignmentPanel alignPanel;\r
  15 \r
  16   protected int            offy;\r
  17   public    int            width;\r
  18   public    int            lastid;\r
  19 \r
  20   SequenceGroup selectedSequenceGroup;\r
  21 \r
  22   public IdPanel(AlignViewport av, AlignmentPanel parent)\r
  23   {\r
  24     this.av         = av;\r
  25     alignPanel = parent;\r
  26     idCanvas = new IdCanvas(av);\r
  27     setLayout(new BorderLayout());\r
  28     add(idCanvas, BorderLayout.CENTER);\r
  29     addMouseListener(this);\r
  30     addMouseMotionListener(this);\r
  31   }\r
  32 \r
  33   public void mouseMoved(MouseEvent e) {}\r
  34 \r
  35   public void selectSeqs(int start, int end) {\r
  36      if (end < start)\r
  37      {\r
  38        int tmp = start;\r
  39        start = end;\r
  40        end   = tmp;\r
  41      }\r
  42 \r
  43      for (int i = start; i <= end; i++)\r
  44      {\r
  45        SequenceI pickedSeq = av.getAlignment().getSequenceAt(i);\r
  46        if (av.getSelection().contains(pickedSeq))\r
  47        {\r
  48          av.getSelection().removeElement(pickedSeq);\r
  49          selectedSequenceGroup.deleteSequence(pickedSeq);\r
  50        }\r
  51        else\r
  52        {\r
  53          av.getSelection().addElement(pickedSeq);\r
  54          if(selectedSequenceGroup==null)\r
  55          {\r
  56            selectedSequenceGroup = new SequenceGroup();\r
  57            av.setRubberbandGroup( selectedSequenceGroup );\r
  58           // av.alignment.addGroup( selectedSequenceGroup );\r
  59            selectedSequenceGroup.setStartRes(0);\r
  60            selectedSequenceGroup.setEndRes( pickedSeq.getSequence().length());\r
  61          }\r
  62 \r
  63          selectedSequenceGroup.addSequence( pickedSeq );\r
  64        }\r
  65 \r
  66      }\r
  67 \r
  68      alignPanel.seqPanel.seqCanvas.paintFlag=true;\r
  69      alignPanel.repaint();\r
  70      repaint();\r
  71 \r
  72    }\r
  73 \r
  74   public void mouseDragged(MouseEvent e) {\r
  75     int y = e.getY();\r
  76     int seq = av.getIndex(y);\r
  77 \r
  78     if (seq < lastid)\r
  79       selectSeqs(lastid - 1, seq);\r
  80     else if (seq > lastid)\r
  81       selectSeqs(lastid + 1, seq);\r
  82 \r
  83     lastid = seq;\r
  84 \r
  85     return;\r
  86   }\r
  87 \r
  88   public void mouseClicked(MouseEvent e)\r
  89   {\r
  90     if (e.getClickCount() == 2)\r
  91     {\r
  92        int seq = av.getIndex(e.getY());\r
  93        String id = av.getAlignment().getSequenceAt(seq).getName();\r
  94 \r
  95        try{\r
  96          jalview.util.BrowserLauncher.openURL(\r
  97              "http://srs.ebi.ac.uk/srs7bin/cgi-bin/wgetz?-e+[swall-id:" + id +\r
  98              "]+-vn+2");\r
  99        }catch(Exception ex){ex.printStackTrace();}\r
 100     }\r
 101 \r
 102   }\r
 103   public void mouseEntered(MouseEvent e) { }\r
 104   public void mouseExited (MouseEvent e) { }\r
 105 \r
 106   public void mousePressed(MouseEvent e) {\r
 107     if (e.getClickCount() == 2)\r
 108       return;\r
 109 \r
 110     int y = e.getY();\r
 111     int seq = av.getIndex(y);\r
 112 \r
 113     selectedSequenceGroup = av.getRubberbandGroup();\r
 114     if (selectedSequenceGroup == null)\r
 115     {\r
 116       selectedSequenceGroup = new SequenceGroup();\r
 117       av.setRubberbandGroup(selectedSequenceGroup);\r
 118     }\r
 119 \r
 120     selectedSequenceGroup.setStartRes(0);\r
 121     selectedSequenceGroup.setEndRes(av.getAlignment().getWidth() - 1);\r
 122 \r
 123     if (seq != -1)\r
 124       selectSeqs(seq, seq);\r
 125 \r
 126     lastid = seq;\r
 127 \r
 128     if( javax.swing.SwingUtilities.isRightMouseButton(e))\r
 129      {\r
 130        jalview.gui.PopupMenu pop = new jalview.gui.PopupMenu(alignPanel, av.getAlignment().getSequenceAt(seq) );\r
 131        pop.show(this, e.getX(), y);\r
 132      }\r
 133 \r
 134 \r
 135     return;\r
 136   }\r
 137 \r
 138   public void mouseReleased(MouseEvent e)\r
 139   {\r
 140     lastid = -1;\r
 141     PaintRefresher.Refresh(this);\r
 142     selectedSequenceGroup = null;\r
 143   }\r
 144 }\r