src/jalview/gui/IdPanel.java

   1 package jalview.gui;\r
   2 \r
   3 import java.awt.*;\r
   4 import java.awt.event.*;\r
   5 \r
   6 import jalview.datamodel.*;\r
   7 \r
   8 import javax.swing.*;\r
   9 \r
  10 public class IdPanel extends JPanel implements MouseListener, MouseMotionListener {\r
  11 \r
  12   protected IdCanvas       idCanvas;\r
  13   protected AlignViewport  av;\r
  14   protected AlignmentPanel alignPanel;\r
  15 \r
  16   protected int            offy;\r
  17   public    int            width;\r
  18   public    int            lastid;\r
  19 \r
  20 \r
  21   public IdPanel(AlignViewport av, AlignmentPanel parent)\r
  22   {\r
  23     this.av         = av;\r
  24     alignPanel = parent;\r
  25     idCanvas = new IdCanvas(av);\r
  26     setLayout(new BorderLayout());\r
  27     add(idCanvas, BorderLayout.CENTER);\r
  28     addMouseListener(this);\r
  29     addMouseMotionListener(this);\r
  30   }\r
  31 \r
  32   public void mouseMoved(MouseEvent e) {}\r
  33 \r
  34   public void selectSeqs(int start, int end) {\r
  35      if (end < start) {\r
  36        int tmp = start;\r
  37        start = end;\r
  38        end   = tmp;\r
  39      }\r
  40 \r
  41      for (int i = start; i <= end; i++)\r
  42      {\r
  43        SequenceI pickedSeq = av.getAlignment().getSequenceAt(i);\r
  44 \r
  45        if (av.getSelection().contains(pickedSeq))\r
  46          av.getSelection().removeElement(pickedSeq);\r
  47         else\r
  48          av.getSelection().addElement(pickedSeq);\r
  49 \r
  50      }\r
  51 \r
  52      repaint();\r
  53 \r
  54    }\r
  55 \r
  56   public void mouseDragged(MouseEvent e) {\r
  57     int y = e.getY();\r
  58     int seq = av.getIndex(y);\r
  59 \r
  60 \r
  61 \r
  62 \r
  63     if (seq < lastid)\r
  64       selectSeqs(lastid - 1, seq);\r
  65     else if (seq > lastid)\r
  66       selectSeqs(lastid + 1, seq);\r
  67 \r
  68     lastid = seq;\r
  69 \r
  70     return;\r
  71   }\r
  72 \r
  73   public void mouseClicked(MouseEvent e)\r
  74   {\r
  75     if (e.getClickCount() == 2)\r
  76     {\r
  77        int seq = av.getIndex(e.getY());\r
  78        String id = av.getAlignment().getSequenceAt(seq).getName();\r
  79 \r
  80        try{\r
  81          jalview.util.BrowserLauncher.openURL(\r
  82              "http://srs.ebi.ac.uk/srs7bin/cgi-bin/wgetz?-e+[swall-id:" + id +\r
  83              "]+-vn+2");\r
  84        }catch(Exception ex){ex.printStackTrace();}\r
  85     }\r
  86 \r
  87   }\r
  88   public void mouseEntered(MouseEvent e) { }\r
  89   public void mouseExited (MouseEvent e) { }\r
  90 \r
  91   public void mousePressed(MouseEvent e) {\r
  92     if (e.getClickCount() == 2)\r
  93       return;\r
  94 \r
  95     int y = e.getY();\r
  96     int seq = av.getIndex(y);\r
  97 \r
  98 \r
  99       if( javax.swing.SwingUtilities.isRightMouseButton(e))\r
 100       {\r
 101         String id = av.getAlignment().getSequenceAt(seq).getName();\r
 102         String s = (String)JOptionPane.showInternalInputDialog(\r
 103                     this,\r
 104                     "Edit sequence name",\r
 105                     "Edit sequence name",\r
 106                     JOptionPane.PLAIN_MESSAGE,\r
 107                     null,\r
 108                     null,\r
 109                     id);\r
 110 \r
 111         if(s!=null)\r
 112         {\r
 113           av.getAlignment().getSequenceAt(seq).setName(s);\r
 114           alignPanel.RefreshPanels();\r
 115         }\r
 116 \r
 117       }\r
 118       else\r
 119       {\r
 120         if (seq != -1)\r
 121           selectSeqs(seq,seq);\r
 122 \r
 123         lastid = seq;\r
 124       }\r
 125     return;\r
 126   }\r
 127 \r
 128   public void mouseReleased(MouseEvent e)\r
 129   {\r
 130     lastid = -1;\r
 131     PaintRefresher.Refresh(this);\r
 132   }\r
 133 }\r