src/jalview/gui/UserDefinedColours.java

   1 package jalview.gui;\r
   2 \r
   3 import jalview.jbgui.GUserDefinedColours;\r
   4 import jalview.datamodel.*;\r
   5 import jalview.io.*;\r
   6 import javax.swing.*;\r
   7 import java.awt.*;\r
   8 import java.awt.event.*;\r
   9 import javax.swing.event.*;\r
  10 import jalview.schemes.*;\r
  11 import java.io.*;\r
  12 import java.util.*;\r
  13 \r
  14 \r
  15 public class UserDefinedColours extends GUserDefinedColours implements ChangeListener\r
  16 {\r
  17 \r
  18   AlignmentPanel ap;\r
  19   SequenceGroup seqGroup;\r
  20   JButton selectedButton;\r
  21   Vector oldColours = new Vector();\r
  22   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  23   JInternalFrame frame;\r
  24 \r
  25   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  26   {\r
  27     super();\r
  28     frame = new JInternalFrame();\r
  29     frame.setContentPane(this);\r
  30     Desktop.addInternalFrame(frame, "User defined colours", 450,530, false );\r
  31     if(System.getProperty("os.name").startsWith("Mac"))\r
  32       frame.setSize(450,560);\r
  33 \r
  34     if(sg!=null)\r
  35         frame.setTitle( frame.getTitle()+ " ("+sg.getName()+")");\r
  36 \r
  37     colorChooser.getSelectionModel().addChangeListener(this);\r
  38 \r
  39     this.ap = ap;\r
  40     seqGroup = sg;\r
  41 \r
  42 \r
  43       if (seqGroup != null)\r
  44         oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  45       else\r
  46         oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  47 \r
  48       for (int i = 0; i < 20; i++)\r
  49         makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
  50                    "", ResidueProperties.aa[i]);\r
  51 \r
  52       makeButton("B", "B");\r
  53       makeButton("Z", "Z");\r
  54       makeButton("X", "X");\r
  55       makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
  56 \r
  57       if(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR")!=null)\r
  58       {\r
  59         loadColour(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR"));\r
  60       }\r
  61   }\r
  62 \r
  63  public void stateChanged(ChangeEvent evt)\r
  64  {\r
  65    if(selectedButton!=null)\r
  66      selectedButton.setBackground( colorChooser.getColor() );\r
  67  }\r
  68 \r
  69   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
  70   {\r
  71      selectedButton = (JButton)e.getSource();\r
  72      colorChooser.setColor(selectedButton.getBackground());\r
  73   }\r
  74 \r
  75   void makeButton(String label, String aa)\r
  76   {\r
  77     final JButton button = new JButton();\r
  78     Color col = Color.white;\r
  79 \r
  80 \r
  81     try{\r
  82       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
  83     }catch(Exception ex){}\r
  84 \r
  85     button.setBackground(  col );\r
  86     oldColours.addElement( col );\r
  87     button.setText( label );\r
  88     button.setForeground( col.darker().darker().darker() );\r
  89     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
  90     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
  91     {\r
  92       public void mouseClicked(MouseEvent e)\r
  93       {\r
  94         colourButtonPressed(e);\r
  95       }\r
  96     });\r
  97 \r
  98     buttonPanel.add(button, null);\r
  99   }\r
 100 \r
 101 \r
 102   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 103   {\r
 104     applyButton_actionPerformed(null);\r
 105     try{\r
 106       frame.setClosed(true);\r
 107     }catch(Exception ex){}\r
 108   }\r
 109 \r
 110   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 111   {\r
 112 \r
 113     Color [] newColours = new Color[24];\r
 114     for(int i=0; i<24; i++)\r
 115     {\r
 116           JButton button = (JButton)buttonPanel.getComponent(i);\r
 117           newColours[i] = button.getBackground();\r
 118     }\r
 119 \r
 120     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme();\r
 121     ucs.setThreshold(0);\r
 122     ucs.setColourScheme( newColours );\r
 123 \r
 124     if(seqGroup!=null)\r
 125       seqGroup.cs = ucs;\r
 126     else\r
 127       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 128 \r
 129     ap.repaint();\r
 130   }\r
 131 \r
 132   protected void loadbutton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 133   {\r
 134     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"),\r
 135         new String[]{".jvuc"}, "Jalview User Colours");\r
 136     chooser.setFileView(new jalview.io.JalviewFileView());\r
 137     chooser.setDialogTitle("Load colour scheme");\r
 138     chooser.setToolTipText("Load");\r
 139     int value = chooser.showOpenDialog(this);\r
 140     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 141     {\r
 142       String choice = chooser.getSelectedFile().getPath();\r
 143       jalview.bin.Cache.setProperty("LAST_DIRECTORY",  choice);\r
 144       loadColour(choice);\r
 145     }\r
 146 \r
 147   }\r
 148 \r
 149   public static UserColourScheme loadDefaultColours(String file)\r
 150   {\r
 151     UserColourScheme ucs = null;\r
 152     try\r
 153     {\r
 154       BufferedReader in = new BufferedReader(new FileReader(file));\r
 155       Color [] newColours = new Color[24];\r
 156       for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 157       {\r
 158         newColours[i] = new Color(Integer.parseInt(in.readLine()));\r
 159       }\r
 160 \r
 161       ucs = new UserColourScheme();\r
 162       ucs.setThreshold(0);\r
 163       ucs.setColourScheme(newColours);\r
 164 \r
 165     }\r
 166     catch (Exception ex)\r
 167     {}\r
 168 \r
 169     return ucs;\r
 170   }\r
 171 \r
 172   void loadColour(String file)\r
 173   {\r
 174     try\r
 175     {\r
 176       BufferedReader in = new BufferedReader(new FileReader(file));\r
 177       for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 178       {\r
 179         JButton button = (JButton) buttonPanel.getComponent(i);\r
 180         Color c = new Color(Integer.parseInt(in.readLine()));\r
 181         button.setBackground(c);\r
 182       }\r
 183 \r
 184       jalview.bin.Cache.setProperty("USER_DEFINED_COLOUR", file);\r
 185     }\r
 186     catch (Exception ex)\r
 187     {}\r
 188 \r
 189   }\r
 190 \r
 191   protected void savebutton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 192   {\r
 193     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"));\r
 194     chooser.setFileView(new jalview.io.JalviewFileView());\r
 195     chooser.setDialogTitle("Save colour scheme");\r
 196     chooser.setToolTipText("Save");\r
 197     int value = chooser.showSaveDialog(this);\r
 198     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 199     {\r
 200       String choice = chooser.getSelectedFile().getPath();\r
 201       jalview.bin.Cache.setProperty("USER_DEFINED_COLOUR", choice);\r
 202 \r
 203       try{\r
 204         PrintWriter out = new PrintWriter(new FileWriter(choice));\r
 205         for(int i=0; i<24; i++)\r
 206         {\r
 207           JButton button = (JButton)buttonPanel.getComponent(i);\r
 208           out.println(button.getBackground().getRGB() + "");\r
 209         }\r
 210 \r
 211         out.close();\r
 212       }\r
 213       catch(Exception ex)\r
 214       {ex.printStackTrace();}\r
 215     }\r
 216 \r
 217   }\r
 218 \r
 219   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 220   {\r
 221     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme();\r
 222     Color [] newColours = new Color[24];\r
 223     for(int i=0; i<24; i++)\r
 224     {\r
 225           newColours[i] = (Color)oldColours.elementAt(i);\r
 226           buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 227     }\r
 228 \r
 229     ucs.setColourScheme( newColours );\r
 230     if (seqGroup != null)\r
 231       seqGroup.cs = ucs;\r
 232     else\r
 233       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 234 \r
 235     ap.repaint();\r
 236 \r
 237     try{\r
 238       frame.setClosed(true);\r
 239     }catch(Exception ex){}\r
 240   }\r
 241 \r
 242 \r
 243 }\r