src/jalview/gui/UserDefinedColours.java

   1 package jalview.gui;\r
   2 \r
   3 import jalview.jbgui.GUserDefinedColours;\r
   4 import jalview.datamodel.*;\r
   5 import javax.swing.*;\r
   6 import java.awt.*;\r
   7 import java.awt.event.*;\r
   8 import javax.swing.event.*;\r
   9 import jalview.schemes.*;\r
  10 import java.io.*;\r
  11 import java.util.*;\r
  12 \r
  13 \r
  14 public class UserDefinedColours extends GUserDefinedColours implements ChangeListener\r
  15 {\r
  16 \r
  17   AlignmentPanel ap;\r
  18   SequenceGroup seqGroup;\r
  19   JButton selectedButton;\r
  20   Vector oldColours = new Vector();\r
  21   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  22   JInternalFrame frame;\r
  23 \r
  24 \r
  25   public UserDefinedColours(JInternalFrame f, AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  26   {\r
  27     super();\r
  28     colorChooser.getSelectionModel().addChangeListener(this);\r
  29     this.ap = ap;\r
  30     frame = f;\r
  31     seqGroup = sg;\r
  32 \r
  33 \r
  34       if (seqGroup != null)\r
  35         oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  36       else\r
  37         oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  38 \r
  39       for (int i = 0; i < 20; i++)\r
  40         makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
  41                    "", ResidueProperties.aa[i]);\r
  42 \r
  43       makeButton("B", "B");\r
  44       makeButton("Z", "Z");\r
  45       makeButton("X", "X");\r
  46       makeButton("'.','-',' '", "-");\r
  47 \r
  48       if(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR")!=null)\r
  49       {\r
  50         loadColour(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR"));\r
  51       }\r
  52 \r
  53 \r
  54   }\r
  55 \r
  56  public void stateChanged(ChangeEvent evt)\r
  57  {\r
  58    if(selectedButton!=null)\r
  59      selectedButton.setBackground( colorChooser.getColor() );\r
  60  }\r
  61 \r
  62   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
  63   {\r
  64      selectedButton = (JButton)e.getSource();\r
  65      colorChooser.setColor(selectedButton.getBackground());\r
  66   }\r
  67 \r
  68   void makeButton(String label, String aa)\r
  69   {\r
  70     final JButton button = new JButton();\r
  71     Color col = Color.white;\r
  72 \r
  73 \r
  74     try{\r
  75       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1, null);\r
  76     }catch(Exception ex){}\r
  77 \r
  78     button.setBackground(  col );\r
  79     oldColours.addElement( col );\r
  80     button.setText( label );\r
  81     button.setForeground( col.darker().darker().darker() );\r
  82     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
  83     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
  84     {\r
  85       public void mouseClicked(MouseEvent e)\r
  86       {\r
  87         colourButtonPressed(e);\r
  88       }\r
  89     });\r
  90 \r
  91     buttonPanel.add(button);\r
  92   }\r
  93 \r
  94 \r
  95   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
  96   {\r
  97     applyButton_actionPerformed(null);\r
  98     try{\r
  99       frame.setClosed(true);\r
 100     }catch(Exception ex){}\r
 101   }\r
 102 \r
 103   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 104   {\r
 105     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme();\r
 106     Color [] newColours = new Color[24];\r
 107     for(int i=0; i<24; i++)\r
 108     {\r
 109           JButton button = (JButton)buttonPanel.getComponent(i);\r
 110           newColours[i] = button.getBackground();\r
 111     }\r
 112 \r
 113     ucs.setThreshold(0);\r
 114     ucs.setColourScheme( newColours );\r
 115 \r
 116     if(seqGroup!=null)\r
 117       seqGroup.cs = ucs;\r
 118     else\r
 119       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 120 \r
 121     ap.RefreshPanels();\r
 122   }\r
 123 \r
 124   protected void loadbutton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 125   {\r
 126     JFileChooser chooser = new JFileChooser(jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"));\r
 127     chooser.setFileView(new jalview.io.JalviewFileView());\r
 128     chooser.setDialogTitle("Load colour scheme");\r
 129     chooser.setToolTipText("Load");\r
 130     int value = chooser.showOpenDialog(this);\r
 131     if (value == JFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 132     {\r
 133       String choice = chooser.getSelectedFile().getPath();\r
 134       jalview.bin.Cache.setProperty("LAST_DIRECTORY",  choice);\r
 135       loadColour(choice);\r
 136     }\r
 137 \r
 138   }\r
 139 \r
 140   void loadColour(String file)\r
 141   {\r
 142     try\r
 143     {\r
 144       BufferedReader in = new BufferedReader(new FileReader(file));\r
 145       for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 146       {\r
 147         JButton button = (JButton) buttonPanel.getComponent(i);\r
 148         Color c = new Color(Integer.parseInt(in.readLine()));\r
 149         button.setBackground(c);\r
 150       }\r
 151     }\r
 152     catch (Exception ex)\r
 153     {}\r
 154 \r
 155   }\r
 156 \r
 157   protected void savebutton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 158   {\r
 159     JFileChooser chooser = new JFileChooser(jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"));\r
 160     chooser.setFileView(new jalview.io.JalviewFileView());\r
 161     chooser.setDialogTitle("Save colour scheme");\r
 162     chooser.setToolTipText("Save");\r
 163     int value = chooser.showSaveDialog(this);\r
 164     if (value == JFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 165     {\r
 166       String choice = chooser.getSelectedFile().getPath();\r
 167       jalview.bin.Cache.setProperty("USER_DEFINED_COLOUR", choice);\r
 168 \r
 169       try{\r
 170         PrintWriter out = new PrintWriter(new FileWriter(choice));\r
 171         for(int i=0; i<24; i++)\r
 172         {\r
 173           JButton button = (JButton)buttonPanel.getComponent(i);\r
 174           out.println(button.getBackground().getRGB() + "");\r
 175         }\r
 176 \r
 177         out.close();\r
 178       }\r
 179       catch(Exception ex)\r
 180       {ex.printStackTrace();}\r
 181     }\r
 182 \r
 183   }\r
 184 \r
 185   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 186   {\r
 187     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme();\r
 188     Color [] newColours = new Color[24];\r
 189     for(int i=0; i<24; i++)\r
 190     {\r
 191           newColours[i] = (Color)oldColours.elementAt(i);\r
 192           buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 193     }\r
 194 \r
 195     ucs.setColourScheme( newColours );\r
 196     if (seqGroup != null)\r
 197       seqGroup.cs = ucs;\r
 198     else\r
 199       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 200 \r
 201     ap.RefreshPanels();\r
 202 \r
 203   }\r
 204 \r
 205 \r
 206 }\r