src/jalview/json/binding/biojson/v1/AnnotationPojo.java

   1 package jalview.json.binding.biojson.v1;
   2
   3 import com.github.reinert.jjschema.Attributes;
   4
   5 public class AnnotationPojo
   6 {
   7   @Attributes(
   8     required = false,
   9     description = "Display character for the given annotation")
  10   private String displayCharacter;
  11
  12   @Attributes(
  13     required = false,
  14     description = "Description for the annotation")
  15   private String description;
  16
  17   @Attributes(
  18     required = true,
  19     enums = { "E", "H", "\u0000", ")", "(" },
  20     description = "Determines what is rendered for the secondary </br>structure <ul><li>’E’ - indicates Beta Sheet/Strand <li>’H’ - indicates alpha helix </li><li> ‘\\u0000’ - indicates blank</li></ul></br>For RNA Helix (only shown when working with</br> nucleotide sequences): <ul><li> ‘(’ - indicates bases pair with columns upstream</br> (to right) </li><li> ’(’ - indicate region pairs with bases to the left</li></ul>")
  21   private char secondaryStructure;
  22
  23   @Attributes(required = false, description = "Value of the annotation")
  24   private float value;
  25
  26   public String getDisplayCharacter()
  27   {
  28     return displayCharacter;
  29   }
  30
  31   public void setDisplayCharacter(String displayCharacter)
  32   {
  33     this.displayCharacter = displayCharacter;
  34   }
  35
  36   public String getDescription()
  37   {
  38     return description;
  39   }
  40
  41   public void setDescription(String description)
  42   {
  43     this.description = description;
  44   }
  45
  46   public char getSecondaryStructure()
  47   {
  48     return secondaryStructure;
  49   }
  50
  51   public void setSecondaryStructure(char secondaryStructure)
  52   {
  53     this.secondaryStructure = secondaryStructure;
  54   }
  55
  56   public float getValue()
  57   {
  58     return value;
  59   }
  60
  61   public void setValue(float value)
  62   {
  63     this.value = value;
  64   }
  65
  66 }