src/jalview/json/binding/biojson/v1/AnnotationPojo.java

   1 package jalview.json.binding.biojson.v1;
   2
   3 import com.github.reinert.jjschema.Attributes;
   4
   5 public class AnnotationPojo
   6 {
   7   @Attributes(required = false, description = "Display character for the given annotation")
   8   private String displayCharacter;
   9
  10   @Attributes(required = false, description = "Description for the annotation")
  11   private String description;
  12
  13   @Attributes(required = true, enums = {"E", "H", "\u0000", ")", "("}, description = "Determines what is rendered for the secondary </br>structure <ul><li>’E’ - indicates Beta Sheet/Strand <li>’H’ - indicates alpha helix </li><li> ‘\\u0000’ - indicates blank</li></ul></br>For RNA Helix (only shown when working with</br> nucleotide sequences): <ul><li> ‘(’ - indicates bases pair with columns upstream</br> (to right) </li><li> ’(’ - indicate region pairs with bases to the left</li></ul>")
  14   private char secondaryStructure;
  15
  16   @Attributes(required = false, description = "Value of the annotation")
  17   private float value;
  18
  19
  20   public String getDisplayCharacter()
  21   {
  22     return displayCharacter;
  23   }
  24
  25   public void setDisplayCharacter(String displayCharacter)
  26   {
  27     this.displayCharacter = displayCharacter;
  28   }
  29
  30   public String getDescription()
  31   {
  32     return description;
  33   }
  34
  35   public void setDescription(String description)
  36   {
  37     this.description = description;
  38   }
  39
  40   public char getSecondaryStructure()
  41   {
  42     return secondaryStructure;
  43   }
  44
  45   public void setSecondaryStructure(char secondaryStructure)
  46   {
  47     this.secondaryStructure = secondaryStructure;
  48   }
  49
  50   public float getValue()
  51   {
  52     return value;
  53   }
  54
  55   public void setValue(float value)
  56   {
  57     this.value = value;
  58   }
  59
  60 }