src/jalview/schemabinding/version2/FeatureDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.schemabinding.version2;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import org.exolab.castor.mapping.AccessMode;\r
  15 import org.exolab.castor.xml.TypeValidator;\r
  16 import org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor;\r
  17 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
  18 \r
  19 /**\r
  20  * Class FeatureDescriptor.\r
  21  * \r
  22  * @version $Revision$ $Date$\r
  23  */\r
  24 public class FeatureDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  25 \r
  26 \r
  27       //--------------------------/\r
  28      //- Class/Member Variables -/\r
  29     //--------------------------/\r
  30 \r
  31     /**\r
  32      * Field nsPrefix\r
  33      */\r
  34     private java.lang.String nsPrefix;\r
  35 \r
  36     /**\r
  37      * Field nsURI\r
  38      */\r
  39     private java.lang.String nsURI;\r
  40 \r
  41     /**\r
  42      * Field xmlName\r
  43      */\r
  44     private java.lang.String xmlName;\r
  45 \r
  46     /**\r
  47      * Field identity\r
  48      */\r
  49     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
  50 \r
  51 \r
  52       //----------------/\r
  53      //- Constructors -/\r
  54     //----------------/\r
  55 \r
  56     public FeatureDescriptor() {\r
  57         super();\r
  58         nsURI = "www.jalview.org";\r
  59         xmlName = "feature";\r
  60         \r
  61         //-- set grouping compositor\r
  62         setCompositorAsSequence();\r
  63         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  64         org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler              handler        = null;\r
  65         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  66         //-- initialize attribute descriptors\r
  67         \r
  68         //-- _begin\r
  69         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_begin", "begin", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  70         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  71             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  72                 throws IllegalStateException\r
  73             {\r
  74                 Feature target = (Feature) object;\r
  75                 if(!target.hasBegin())\r
  76                     return null;\r
  77                 return new java.lang.Integer(target.getBegin());\r
  78             }\r
  79             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  80                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  81             {\r
  82                 try {\r
  83                     Feature target = (Feature) object;\r
  84                     // ignore null values for non optional primitives\r
  85                     if (value == null) return;\r
  86                     \r
  87                     target.setBegin( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
  88                 }\r
  89                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
  90                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  91                 }\r
  92             }\r
  93             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
  94                 return null;\r
  95             }\r
  96         } );\r
  97         desc.setHandler(handler);\r
  98         desc.setRequired(true);\r
  99         addFieldDescriptor(desc);\r
 100         \r
 101         //-- validation code for: _begin\r
 102         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 103         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 104         { //-- local scope\r
 105             IntegerValidator typeValidator= new IntegerValidator();\r
 106             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 107         }\r
 108         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 109         //-- _end\r
 110         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_end", "end", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 111         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 112             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 113                 throws IllegalStateException\r
 114             {\r
 115                 Feature target = (Feature) object;\r
 116                 if(!target.hasEnd())\r
 117                     return null;\r
 118                 return new java.lang.Integer(target.getEnd());\r
 119             }\r
 120             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 121                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 122             {\r
 123                 try {\r
 124                     Feature target = (Feature) object;\r
 125                     // ignore null values for non optional primitives\r
 126                     if (value == null) return;\r
 127                     \r
 128                     target.setEnd( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
 129                 }\r
 130                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 131                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 132                 }\r
 133             }\r
 134             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 135                 return null;\r
 136             }\r
 137         } );\r
 138         desc.setHandler(handler);\r
 139         desc.setRequired(true);\r
 140         addFieldDescriptor(desc);\r
 141         \r
 142         //-- validation code for: _end\r
 143         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 144         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 145         { //-- local scope\r
 146             IntegerValidator typeValidator= new IntegerValidator();\r
 147             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 148         }\r
 149         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 150         //-- _type\r
 151         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_type", "type", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 152         desc.setImmutable(true);\r
 153         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 154             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 155                 throws IllegalStateException\r
 156             {\r
 157                 Feature target = (Feature) object;\r
 158                 return target.getType();\r
 159             }\r
 160             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 161                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 162             {\r
 163                 try {\r
 164                     Feature target = (Feature) object;\r
 165                     target.setType( (java.lang.String) value);\r
 166                 }\r
 167                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 168                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 169                 }\r
 170             }\r
 171             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 172                 return null;\r
 173             }\r
 174         } );\r
 175         desc.setHandler(handler);\r
 176         desc.setRequired(true);\r
 177         addFieldDescriptor(desc);\r
 178         \r
 179         //-- validation code for: _type\r
 180         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 181         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 182         { //-- local scope\r
 183             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 184             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 185             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 186         }\r
 187         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 188         //-- _description\r
 189         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_description", "description", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 190         desc.setImmutable(true);\r
 191         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 192             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 193                 throws IllegalStateException\r
 194             {\r
 195                 Feature target = (Feature) object;\r
 196                 return target.getDescription();\r
 197             }\r
 198             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 199                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 200             {\r
 201                 try {\r
 202                     Feature target = (Feature) object;\r
 203                     target.setDescription( (java.lang.String) value);\r
 204                 }\r
 205                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 206                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 207                 }\r
 208             }\r
 209             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 210                 return null;\r
 211             }\r
 212         } );\r
 213         desc.setHandler(handler);\r
 214         addFieldDescriptor(desc);\r
 215         \r
 216         //-- validation code for: _description\r
 217         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 218         { //-- local scope\r
 219             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 220             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 221             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 222         }\r
 223         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 224         //-- _status\r
 225         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_status", "status", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 226         desc.setImmutable(true);\r
 227         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 228             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 229                 throws IllegalStateException\r
 230             {\r
 231                 Feature target = (Feature) object;\r
 232                 return target.getStatus();\r
 233             }\r
 234             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 235                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 236             {\r
 237                 try {\r
 238                     Feature target = (Feature) object;\r
 239                     target.setStatus( (java.lang.String) value);\r
 240                 }\r
 241                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 242                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 243                 }\r
 244             }\r
 245             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 246                 return null;\r
 247             }\r
 248         } );\r
 249         desc.setHandler(handler);\r
 250         addFieldDescriptor(desc);\r
 251         \r
 252         //-- validation code for: _status\r
 253         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 254         { //-- local scope\r
 255             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 256             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 257             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 258         }\r
 259         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 260         //-- _featureGroup\r
 261         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_featureGroup", "featureGroup", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 262         desc.setImmutable(true);\r
 263         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 264             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 265                 throws IllegalStateException\r
 266             {\r
 267                 Feature target = (Feature) object;\r
 268                 return target.getFeatureGroup();\r
 269             }\r
 270             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 271                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 272             {\r
 273                 try {\r
 274                     Feature target = (Feature) object;\r
 275                     target.setFeatureGroup( (java.lang.String) value);\r
 276                 }\r
 277                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 278                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 279                 }\r
 280             }\r
 281             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 282                 return null;\r
 283             }\r
 284         } );\r
 285         desc.setHandler(handler);\r
 286         addFieldDescriptor(desc);\r
 287         \r
 288         //-- validation code for: _featureGroup\r
 289         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 290         { //-- local scope\r
 291             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 292             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 293             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 294         }\r
 295         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 296         //-- _score\r
 297         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(float.class, "_score", "score", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 298         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 299             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 300                 throws IllegalStateException\r
 301             {\r
 302                 Feature target = (Feature) object;\r
 303                 if(!target.hasScore())\r
 304                     return null;\r
 305                 return new java.lang.Float(target.getScore());\r
 306             }\r
 307             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 308                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 309             {\r
 310                 try {\r
 311                     Feature target = (Feature) object;\r
 312                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 313                     if (value == null) {\r
 314                         target.deleteScore();\r
 315                         return;\r
 316                     }\r
 317                     target.setScore( ((java.lang.Float)value).floatValue());\r
 318                 }\r
 319                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 320                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 321                 }\r
 322             }\r
 323             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 324                 return null;\r
 325             }\r
 326         } );\r
 327         desc.setHandler(handler);\r
 328         addFieldDescriptor(desc);\r
 329         \r
 330         //-- validation code for: _score\r
 331         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 332         { //-- local scope\r
 333             FloatValidator typeValidator = new FloatValidator();\r
 334             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 335         }\r
 336         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 337         //-- initialize element descriptors\r
 338         \r
 339         //-- _otherDataList\r
 340         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.OtherData.class, "_otherDataList", "otherData", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 341         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 342             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 343                 throws IllegalStateException\r
 344             {\r
 345                 Feature target = (Feature) object;\r
 346                 return target.getOtherData();\r
 347             }\r
 348             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 349                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 350             {\r
 351                 try {\r
 352                     Feature target = (Feature) object;\r
 353                     target.addOtherData( (jalview.schemabinding.version2.OtherData) value);\r
 354                 }\r
 355                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 356                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 357                 }\r
 358             }\r
 359             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 360                 return new jalview.schemabinding.version2.OtherData();\r
 361             }\r
 362         } );\r
 363         desc.setHandler(handler);\r
 364         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 365         desc.setMultivalued(true);\r
 366         addFieldDescriptor(desc);\r
 367         \r
 368         //-- validation code for: _otherDataList\r
 369         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 370         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 371         { //-- local scope\r
 372         }\r
 373         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 374     } //-- jalview.schemabinding.version2.FeatureDescriptor()\r
 375 \r
 376 \r
 377       //-----------/\r
 378      //- Methods -/\r
 379     //-----------/\r
 380 \r
 381     /**\r
 382      * Method getAccessMode\r
 383      * \r
 384      * \r
 385      * \r
 386      * @return AccessMode\r
 387      */\r
 388     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 389     {\r
 390         return null;\r
 391     } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode() \r
 392 \r
 393     /**\r
 394      * Method getExtends\r
 395      * \r
 396      * \r
 397      * \r
 398      * @return ClassDescriptor\r
 399      */\r
 400     public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 401     {\r
 402         return null;\r
 403     } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends() \r
 404 \r
 405     /**\r
 406      * Method getIdentity\r
 407      * \r
 408      * \r
 409      * \r
 410      * @return FieldDescriptor\r
 411      */\r
 412     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 413     {\r
 414         return identity;\r
 415     } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity() \r
 416 \r
 417     /**\r
 418      * Method getJavaClass\r
 419      * \r
 420      * \r
 421      * \r
 422      * @return Class\r
 423      */\r
 424     public java.lang.Class getJavaClass()\r
 425     {\r
 426         return jalview.schemabinding.version2.Feature.class;\r
 427     } //-- java.lang.Class getJavaClass() \r
 428 \r
 429     /**\r
 430      * Method getNameSpacePrefix\r
 431      * \r
 432      * \r
 433      * \r
 434      * @return String\r
 435      */\r
 436     public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 437     {\r
 438         return nsPrefix;\r
 439     } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix() \r
 440 \r
 441     /**\r
 442      * Method getNameSpaceURI\r
 443      * \r
 444      * \r
 445      * \r
 446      * @return String\r
 447      */\r
 448     public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 449     {\r
 450         return nsURI;\r
 451     } //-- java.lang.String getNameSpaceURI() \r
 452 \r
 453     /**\r
 454      * Method getValidator\r
 455      * \r
 456      * \r
 457      * \r
 458      * @return TypeValidator\r
 459      */\r
 460     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 461     {\r
 462         return this;\r
 463     } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator() \r
 464 \r
 465     /**\r
 466      * Method getXMLName\r
 467      * \r
 468      * \r
 469      * \r
 470      * @return String\r
 471      */\r
 472     public java.lang.String getXMLName()\r
 473     {\r
 474         return xmlName;\r
 475     } //-- java.lang.String getXMLName() \r
 476 \r
 477 }\r