added aligned codon frames, and dataset reference ids for sequenceSet and sequences...
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / descriptors / AlcodMapDescriptor.java
1 /*\r
2  * This class was automatically generated with \r
3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
4  * Schema.\r
5  * $Id$\r
6  */\r
7 \r
8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
9 \r
10   //---------------------------------/\r
11  //- Imported classes and packages -/\r
12 //---------------------------------/\r
13 \r
14 import jalview.schemabinding.version2.AlcodMap;\r
15 \r
16 /**\r
17  * Class AlcodMapDescriptor.\r
18  * \r
19  * @version $Revision$ $Date$\r
20  */\r
21 public class AlcodMapDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
22 \r
23 \r
24       //--------------------------/\r
25      //- Class/Member Variables -/\r
26     //--------------------------/\r
27 \r
28     /**\r
29      * Field _elementDefinition.\r
30      */\r
31     private boolean _elementDefinition;\r
32 \r
33     /**\r
34      * Field _nsPrefix.\r
35      */\r
36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
37 \r
38     /**\r
39      * Field _nsURI.\r
40      */\r
41     private java.lang.String _nsURI;\r
42 \r
43     /**\r
44      * Field _xmlName.\r
45      */\r
46     private java.lang.String _xmlName;\r
47 \r
48 \r
49       //----------------/\r
50      //- Constructors -/\r
51     //----------------/\r
52 \r
53     public AlcodMapDescriptor() {\r
54         super();\r
55         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
56         _xmlName = "alcodMap";\r
57         _elementDefinition = true;\r
58         \r
59         //-- set grouping compositor\r
60         setCompositorAsSequence();\r
61         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
62         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
63         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
64         //-- initialize attribute descriptors\r
65         \r
66         //-- _dnasq\r
67         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_dnasq", "dnasq", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
68         desc.setImmutable(true);\r
69         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
70             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
71                 throws IllegalStateException\r
72             {\r
73                 AlcodMap target = (AlcodMap) object;\r
74                 return target.getDnasq();\r
75             }\r
76             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
77                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
78             {\r
79                 try {\r
80                     AlcodMap target = (AlcodMap) object;\r
81                     target.setDnasq( (java.lang.String) value);\r
82                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
83                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
84                 }\r
85             }\r
86             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
87                 return null;\r
88             }\r
89         };\r
90         desc.setHandler(handler);\r
91         desc.setRequired(true);\r
92         desc.setMultivalued(false);\r
93         addFieldDescriptor(desc);\r
94         \r
95         //-- validation code for: _dnasq\r
96         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
97         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
98         { //-- local scope\r
99             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
100             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
101             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
102             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
103         }\r
104         desc.setValidator(fieldValidator);\r
105         //-- initialize element descriptors\r
106         \r
107         //-- _mapping\r
108         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.Mapping.class, "_mapping", "Mapping", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
109         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
110             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
111                 throws IllegalStateException\r
112             {\r
113                 AlcodMap target = (AlcodMap) object;\r
114                 return target.getMapping();\r
115             }\r
116             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
117                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
118             {\r
119                 try {\r
120                     AlcodMap target = (AlcodMap) object;\r
121                     target.setMapping( (jalview.schemabinding.version2.Mapping) value);\r
122                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
123                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
124                 }\r
125             }\r
126             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
127                 return new jalview.schemabinding.version2.Mapping();\r
128             }\r
129         };\r
130         desc.setHandler(handler);\r
131         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
132         desc.setRequired(true);\r
133         desc.setMultivalued(false);\r
134         addFieldDescriptor(desc);\r
135         \r
136         //-- validation code for: _mapping\r
137         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
138         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
139         { //-- local scope\r
140         }\r
141         desc.setValidator(fieldValidator);\r
142     }\r
143 \r
144 \r
145       //-----------/\r
146      //- Methods -/\r
147     //-----------/\r
148 \r
149     /**\r
150      * Method getAccessMode.\r
151      * \r
152      * @return the access mode specified for this class.\r
153      */\r
154     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
155     ) {\r
156         return null;\r
157     }\r
158 \r
159     /**\r
160      * Method getIdentity.\r
161      * \r
162      * @return the identity field, null if this class has no\r
163      * identity.\r
164      */\r
165     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
166     ) {\r
167         return super.getIdentity();\r
168     }\r
169 \r
170     /**\r
171      * Method getJavaClass.\r
172      * \r
173      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
174      */\r
175     public java.lang.Class getJavaClass(\r
176     ) {\r
177         return jalview.schemabinding.version2.AlcodMap.class;\r
178     }\r
179 \r
180     /**\r
181      * Method getNameSpacePrefix.\r
182      * \r
183      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
184      */\r
185     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
186     ) {\r
187         return _nsPrefix;\r
188     }\r
189 \r
190     /**\r
191      * Method getNameSpaceURI.\r
192      * \r
193      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
194      * unmarshaling as XML.\r
195      */\r
196     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
197     ) {\r
198         return _nsURI;\r
199     }\r
200 \r
201     /**\r
202      * Method getValidator.\r
203      * \r
204      * @return a specific validator for the class described by this\r
205      * ClassDescriptor.\r
206      */\r
207     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
208     ) {\r
209         return this;\r
210     }\r
211 \r
212     /**\r
213      * Method getXMLName.\r
214      * \r
215      * @return the XML Name for the Class being described.\r
216      */\r
217     public java.lang.String getXMLName(\r
218     ) {\r
219         return _xmlName;\r
220     }\r
221 \r
222     /**\r
223      * Method isElementDefinition.\r
224      * \r
225      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
226      * of a global\r
227      * element or element with anonymous type definition.\r
228      */\r
229     public boolean isElementDefinition(\r
230     ) {\r
231         return _elementDefinition;\r
232     }\r
233 \r
234 }\r