src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/JGroupDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21 // ---------------------------------/\r
  22 // - Imported classes and packages -/\r
  23 // ---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.JGroup;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class JGroupDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class JGroupDescriptor extends\r
  33         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  34 {\r
  35 \r
  36   // --------------------------/\r
  37   // - Class/Member Variables -/\r
  38   // --------------------------/\r
  39 \r
  40   /**\r
  41    * Field _elementDefinition.\r
  42    */\r
  43   private boolean _elementDefinition;\r
  44 \r
  45   /**\r
  46    * Field _nsPrefix.\r
  47    */\r
  48   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  49 \r
  50   /**\r
  51    * Field _nsURI.\r
  52    */\r
  53   private java.lang.String _nsURI;\r
  54 \r
  55   /**\r
  56    * Field _xmlName.\r
  57    */\r
  58   private java.lang.String _xmlName;\r
  59 \r
  60   // ----------------/\r
  61   // - Constructors -/\r
  62   // ----------------/\r
  63 \r
  64   public JGroupDescriptor()\r
  65   {\r
  66     super();\r
  67     _nsURI = "www.jalview.org";\r
  68     _xmlName = "JGroup";\r
  69     _elementDefinition = true;\r
  70 \r
  71     // -- set grouping compositor\r
  72     setCompositorAsSequence();\r
  73     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  74     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  75     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  76     // -- initialize attribute descriptors\r
  77 \r
  78     // -- _start\r
  79     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  80             java.lang.Integer.TYPE, "_start", "start",\r
  81             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  82     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  83     {\r
  84       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  85               throws IllegalStateException\r
  86       {\r
  87         JGroup target = (JGroup) object;\r
  88         if (!target.hasStart())\r
  89         {\r
  90           return null;\r
  91         }\r
  92         return new java.lang.Integer(target.getStart());\r
  93       }\r
  94 \r
  95       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  96               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  97       {\r
  98         try\r
  99         {\r
 100           JGroup target = (JGroup) object;\r
 101           // if null, use delete method for optional primitives\r
 102           if (value == null)\r
 103           {\r
 104             target.deleteStart();\r
 105             return;\r
 106           }\r
 107           target.setStart(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 108         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 109         {\r
 110           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 111         }\r
 112       }\r
 113 \r
 114       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 115       {\r
 116         return null;\r
 117       }\r
 118     };\r
 119     desc.setHandler(handler);\r
 120     desc.setMultivalued(false);\r
 121     addFieldDescriptor(desc);\r
 122 \r
 123     // -- validation code for: _start\r
 124     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 125     { // -- local scope\r
 126       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 127       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 128       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 129       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 130       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 131     }\r
 132     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 133     // -- _end\r
 134     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 135             java.lang.Integer.TYPE, "_end", "end",\r
 136             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 137     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 138     {\r
 139       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 140               throws IllegalStateException\r
 141       {\r
 142         JGroup target = (JGroup) object;\r
 143         if (!target.hasEnd())\r
 144         {\r
 145           return null;\r
 146         }\r
 147         return new java.lang.Integer(target.getEnd());\r
 148       }\r
 149 \r
 150       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 151               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 152       {\r
 153         try\r
 154         {\r
 155           JGroup target = (JGroup) object;\r
 156           // if null, use delete method for optional primitives\r
 157           if (value == null)\r
 158           {\r
 159             target.deleteEnd();\r
 160             return;\r
 161           }\r
 162           target.setEnd(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 163         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 164         {\r
 165           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 166         }\r
 167       }\r
 168 \r
 169       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 170       {\r
 171         return null;\r
 172       }\r
 173     };\r
 174     desc.setHandler(handler);\r
 175     desc.setMultivalued(false);\r
 176     addFieldDescriptor(desc);\r
 177 \r
 178     // -- validation code for: _end\r
 179     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 180     { // -- local scope\r
 181       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 182       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 183       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 184       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 185       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 186     }\r
 187     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 188     // -- _name\r
 189     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 190             java.lang.String.class, "_name", "name",\r
 191             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 192     desc.setImmutable(true);\r
 193     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 194     {\r
 195       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 196               throws IllegalStateException\r
 197       {\r
 198         JGroup target = (JGroup) object;\r
 199         return target.getName();\r
 200       }\r
 201 \r
 202       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 203               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 204       {\r
 205         try\r
 206         {\r
 207           JGroup target = (JGroup) object;\r
 208           target.setName((java.lang.String) value);\r
 209         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 210         {\r
 211           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 212         }\r
 213       }\r
 214 \r
 215       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 216       {\r
 217         return null;\r
 218       }\r
 219     };\r
 220     desc.setHandler(handler);\r
 221     desc.setMultivalued(false);\r
 222     addFieldDescriptor(desc);\r
 223 \r
 224     // -- validation code for: _name\r
 225     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 226     { // -- local scope\r
 227       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 228       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 229       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 230       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 231     }\r
 232     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 233     // -- _colour\r
 234     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 235             java.lang.String.class, "_colour", "colour",\r
 236             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 237     desc.setImmutable(true);\r
 238     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 239     {\r
 240       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 241               throws IllegalStateException\r
 242       {\r
 243         JGroup target = (JGroup) object;\r
 244         return target.getColour();\r
 245       }\r
 246 \r
 247       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 248               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 249       {\r
 250         try\r
 251         {\r
 252           JGroup target = (JGroup) object;\r
 253           target.setColour((java.lang.String) value);\r
 254         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 255         {\r
 256           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 257         }\r
 258       }\r
 259 \r
 260       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 261       {\r
 262         return null;\r
 263       }\r
 264     };\r
 265     desc.setHandler(handler);\r
 266     desc.setMultivalued(false);\r
 267     addFieldDescriptor(desc);\r
 268 \r
 269     // -- validation code for: _colour\r
 270     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 271     { // -- local scope\r
 272       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 273       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 274       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 275       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 276     }\r
 277     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 278     // -- _consThreshold\r
 279     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 280             java.lang.Integer.TYPE, "_consThreshold", "consThreshold",\r
 281             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 282     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 283     {\r
 284       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 285               throws IllegalStateException\r
 286       {\r
 287         JGroup target = (JGroup) object;\r
 288         if (!target.hasConsThreshold())\r
 289         {\r
 290           return null;\r
 291         }\r
 292         return new java.lang.Integer(target.getConsThreshold());\r
 293       }\r
 294 \r
 295       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 296               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 297       {\r
 298         try\r
 299         {\r
 300           JGroup target = (JGroup) object;\r
 301           // if null, use delete method for optional primitives\r
 302           if (value == null)\r
 303           {\r
 304             target.deleteConsThreshold();\r
 305             return;\r
 306           }\r
 307           target.setConsThreshold(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 308         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 309         {\r
 310           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 311         }\r
 312       }\r
 313 \r
 314       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 315       {\r
 316         return null;\r
 317       }\r
 318     };\r
 319     desc.setHandler(handler);\r
 320     desc.setMultivalued(false);\r
 321     addFieldDescriptor(desc);\r
 322 \r
 323     // -- validation code for: _consThreshold\r
 324     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 325     { // -- local scope\r
 326       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 327       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 328       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 329       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 330       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 331     }\r
 332     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 333     // -- _pidThreshold\r
 334     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 335             java.lang.Integer.TYPE, "_pidThreshold", "pidThreshold",\r
 336             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 337     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 338     {\r
 339       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 340               throws IllegalStateException\r
 341       {\r
 342         JGroup target = (JGroup) object;\r
 343         if (!target.hasPidThreshold())\r
 344         {\r
 345           return null;\r
 346         }\r
 347         return new java.lang.Integer(target.getPidThreshold());\r
 348       }\r
 349 \r
 350       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 351               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 352       {\r
 353         try\r
 354         {\r
 355           JGroup target = (JGroup) object;\r
 356           // if null, use delete method for optional primitives\r
 357           if (value == null)\r
 358           {\r
 359             target.deletePidThreshold();\r
 360             return;\r
 361           }\r
 362           target.setPidThreshold(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 363         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 364         {\r
 365           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 366         }\r
 367       }\r
 368 \r
 369       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 370       {\r
 371         return null;\r
 372       }\r
 373     };\r
 374     desc.setHandler(handler);\r
 375     desc.setMultivalued(false);\r
 376     addFieldDescriptor(desc);\r
 377 \r
 378     // -- validation code for: _pidThreshold\r
 379     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 380     { // -- local scope\r
 381       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 382       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 383       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 384       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 385       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 386     }\r
 387     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 388     // -- _outlineColour\r
 389     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 390             java.lang.Integer.TYPE, "_outlineColour", "outlineColour",\r
 391             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 392     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 393     {\r
 394       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 395               throws IllegalStateException\r
 396       {\r
 397         JGroup target = (JGroup) object;\r
 398         if (!target.hasOutlineColour())\r
 399         {\r
 400           return null;\r
 401         }\r
 402         return new java.lang.Integer(target.getOutlineColour());\r
 403       }\r
 404 \r
 405       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 406               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 407       {\r
 408         try\r
 409         {\r
 410           JGroup target = (JGroup) object;\r
 411           // if null, use delete method for optional primitives\r
 412           if (value == null)\r
 413           {\r
 414             target.deleteOutlineColour();\r
 415             return;\r
 416           }\r
 417           target.setOutlineColour(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 418         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 419         {\r
 420           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 421         }\r
 422       }\r
 423 \r
 424       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 425       {\r
 426         return null;\r
 427       }\r
 428     };\r
 429     desc.setHandler(handler);\r
 430     desc.setMultivalued(false);\r
 431     addFieldDescriptor(desc);\r
 432 \r
 433     // -- validation code for: _outlineColour\r
 434     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 435     { // -- local scope\r
 436       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 437       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 438       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 439       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 440       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 441     }\r
 442     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 443     // -- _displayBoxes\r
 444     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 445             java.lang.Boolean.TYPE, "_displayBoxes", "displayBoxes",\r
 446             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 447     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 448     {\r
 449       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 450               throws IllegalStateException\r
 451       {\r
 452         JGroup target = (JGroup) object;\r
 453         if (!target.hasDisplayBoxes())\r
 454         {\r
 455           return null;\r
 456         }\r
 457         return (target.getDisplayBoxes() ? java.lang.Boolean.TRUE\r
 458                 : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 459       }\r
 460 \r
 461       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 462               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 463       {\r
 464         try\r
 465         {\r
 466           JGroup target = (JGroup) object;\r
 467           // if null, use delete method for optional primitives\r
 468           if (value == null)\r
 469           {\r
 470             target.deleteDisplayBoxes();\r
 471             return;\r
 472           }\r
 473           target\r
 474                   .setDisplayBoxes(((java.lang.Boolean) value)\r
 475                           .booleanValue());\r
 476         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 477         {\r
 478           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 479         }\r
 480       }\r
 481 \r
 482       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 483       {\r
 484         return null;\r
 485       }\r
 486     };\r
 487     desc.setHandler(handler);\r
 488     desc.setMultivalued(false);\r
 489     addFieldDescriptor(desc);\r
 490 \r
 491     // -- validation code for: _displayBoxes\r
 492     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 493     { // -- local scope\r
 494       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 495       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 496       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 497     }\r
 498     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 499     // -- _displayText\r
 500     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 501             java.lang.Boolean.TYPE, "_displayText", "displayText",\r
 502             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 503     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 504     {\r
 505       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 506               throws IllegalStateException\r
 507       {\r
 508         JGroup target = (JGroup) object;\r
 509         if (!target.hasDisplayText())\r
 510         {\r
 511           return null;\r
 512         }\r
 513         return (target.getDisplayText() ? java.lang.Boolean.TRUE\r
 514                 : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 515       }\r
 516 \r
 517       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 518               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 519       {\r
 520         try\r
 521         {\r
 522           JGroup target = (JGroup) object;\r
 523           // if null, use delete method for optional primitives\r
 524           if (value == null)\r
 525           {\r
 526             target.deleteDisplayText();\r
 527             return;\r
 528           }\r
 529           target.setDisplayText(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 530         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 531         {\r
 532           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 533         }\r
 534       }\r
 535 \r
 536       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 537       {\r
 538         return null;\r
 539       }\r
 540     };\r
 541     desc.setHandler(handler);\r
 542     desc.setMultivalued(false);\r
 543     addFieldDescriptor(desc);\r
 544 \r
 545     // -- validation code for: _displayText\r
 546     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 547     { // -- local scope\r
 548       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 549       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 550       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 551     }\r
 552     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 553     // -- _colourText\r
 554     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 555             java.lang.Boolean.TYPE, "_colourText", "colourText",\r
 556             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 557     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 558     {\r
 559       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 560               throws IllegalStateException\r
 561       {\r
 562         JGroup target = (JGroup) object;\r
 563         if (!target.hasColourText())\r
 564         {\r
 565           return null;\r
 566         }\r
 567         return (target.getColourText() ? java.lang.Boolean.TRUE\r
 568                 : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 569       }\r
 570 \r
 571       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 572               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 573       {\r
 574         try\r
 575         {\r
 576           JGroup target = (JGroup) object;\r
 577           // if null, use delete method for optional primitives\r
 578           if (value == null)\r
 579           {\r
 580             target.deleteColourText();\r
 581             return;\r
 582           }\r
 583           target.setColourText(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 584         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 585         {\r
 586           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 587         }\r
 588       }\r
 589 \r
 590       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 591       {\r
 592         return null;\r
 593       }\r
 594     };\r
 595     desc.setHandler(handler);\r
 596     desc.setMultivalued(false);\r
 597     addFieldDescriptor(desc);\r
 598 \r
 599     // -- validation code for: _colourText\r
 600     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 601     { // -- local scope\r
 602       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 603       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 604       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 605     }\r
 606     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 607     // -- _textCol1\r
 608     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 609             java.lang.Integer.TYPE, "_textCol1", "textCol1",\r
 610             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 611     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 612     {\r
 613       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 614               throws IllegalStateException\r
 615       {\r
 616         JGroup target = (JGroup) object;\r
 617         if (!target.hasTextCol1())\r
 618         {\r
 619           return null;\r
 620         }\r
 621         return new java.lang.Integer(target.getTextCol1());\r
 622       }\r
 623 \r
 624       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 625               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 626       {\r
 627         try\r
 628         {\r
 629           JGroup target = (JGroup) object;\r
 630           // if null, use delete method for optional primitives\r
 631           if (value == null)\r
 632           {\r
 633             target.deleteTextCol1();\r
 634             return;\r
 635           }\r
 636           target.setTextCol1(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 637         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 638         {\r
 639           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 640         }\r
 641       }\r
 642 \r
 643       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 644       {\r
 645         return null;\r
 646       }\r
 647     };\r
 648     desc.setHandler(handler);\r
 649     desc.setMultivalued(false);\r
 650     addFieldDescriptor(desc);\r
 651 \r
 652     // -- validation code for: _textCol1\r
 653     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 654     { // -- local scope\r
 655       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 656       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 657       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 658       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 659       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 660     }\r
 661     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 662     // -- _textCol2\r
 663     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 664             java.lang.Integer.TYPE, "_textCol2", "textCol2",\r
 665             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 666     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 667     {\r
 668       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 669               throws IllegalStateException\r
 670       {\r
 671         JGroup target = (JGroup) object;\r
 672         if (!target.hasTextCol2())\r
 673         {\r
 674           return null;\r
 675         }\r
 676         return new java.lang.Integer(target.getTextCol2());\r
 677       }\r
 678 \r
 679       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 680               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 681       {\r
 682         try\r
 683         {\r
 684           JGroup target = (JGroup) object;\r
 685           // if null, use delete method for optional primitives\r
 686           if (value == null)\r
 687           {\r
 688             target.deleteTextCol2();\r
 689             return;\r
 690           }\r
 691           target.setTextCol2(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 692         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 693         {\r
 694           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 695         }\r
 696       }\r
 697 \r
 698       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 699       {\r
 700         return null;\r
 701       }\r
 702     };\r
 703     desc.setHandler(handler);\r
 704     desc.setMultivalued(false);\r
 705     addFieldDescriptor(desc);\r
 706 \r
 707     // -- validation code for: _textCol2\r
 708     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 709     { // -- local scope\r
 710       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 711       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 712       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 713       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 714       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 715     }\r
 716     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 717     // -- _textColThreshold\r
 718     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 719             java.lang.Integer.TYPE, "_textColThreshold",\r
 720             "textColThreshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 721     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 722     {\r
 723       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 724               throws IllegalStateException\r
 725       {\r
 726         JGroup target = (JGroup) object;\r
 727         if (!target.hasTextColThreshold())\r
 728         {\r
 729           return null;\r
 730         }\r
 731         return new java.lang.Integer(target.getTextColThreshold());\r
 732       }\r
 733 \r
 734       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 735               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 736       {\r
 737         try\r
 738         {\r
 739           JGroup target = (JGroup) object;\r
 740           // if null, use delete method for optional primitives\r
 741           if (value == null)\r
 742           {\r
 743             target.deleteTextColThreshold();\r
 744             return;\r
 745           }\r
 746           target\r
 747                   .setTextColThreshold(((java.lang.Integer) value)\r
 748                           .intValue());\r
 749         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 750         {\r
 751           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 752         }\r
 753       }\r
 754 \r
 755       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 756       {\r
 757         return null;\r
 758       }\r
 759     };\r
 760     desc.setHandler(handler);\r
 761     desc.setMultivalued(false);\r
 762     addFieldDescriptor(desc);\r
 763 \r
 764     // -- validation code for: _textColThreshold\r
 765     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 766     { // -- local scope\r
 767       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 768       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 769       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 770       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 771       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 772     }\r
 773     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 774     // -- initialize element descriptors\r
 775 \r
 776     // -- _seqList\r
 777     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 778             java.lang.String.class, "_seqList", "seq",\r
 779             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 780     desc.setImmutable(true);\r
 781     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 782     {\r
 783       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 784               throws IllegalStateException\r
 785       {\r
 786         JGroup target = (JGroup) object;\r
 787         return target.getSeq();\r
 788       }\r
 789 \r
 790       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 791               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 792       {\r
 793         try\r
 794         {\r
 795           JGroup target = (JGroup) object;\r
 796           target.addSeq((java.lang.String) value);\r
 797         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 798         {\r
 799           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 800         }\r
 801       }\r
 802 \r
 803       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,\r
 804               IllegalArgumentException\r
 805       {\r
 806         try\r
 807         {\r
 808           JGroup target = (JGroup) object;\r
 809           target.removeAllSeq();\r
 810         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 811         {\r
 812           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 813         }\r
 814       }\r
 815 \r
 816       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 817       {\r
 818         return null;\r
 819       }\r
 820     };\r
 821     desc.setHandler(handler);\r
 822     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 823     desc.setRequired(true);\r
 824     desc.setMultivalued(true);\r
 825     addFieldDescriptor(desc);\r
 826 \r
 827     // -- validation code for: _seqList\r
 828     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 829     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 830     { // -- local scope\r
 831       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 832       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 833       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 834       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 835     }\r
 836     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 837   }\r
 838 \r
 839   // -----------/\r
 840   // - Methods -/\r
 841   // -----------/\r
 842 \r
 843   /**\r
 844    * Method getAccessMode.\r
 845    * \r
 846    * @return the access mode specified for this class.\r
 847    */\r
 848   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 849   {\r
 850     return null;\r
 851   }\r
 852 \r
 853   /**\r
 854    * Method getIdentity.\r
 855    * \r
 856    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 857    */\r
 858   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 859   {\r
 860     return super.getIdentity();\r
 861   }\r
 862 \r
 863   /**\r
 864    * Method getJavaClass.\r
 865    * \r
 866    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 867    */\r
 868   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 869   {\r
 870     return jalview.schemabinding.version2.JGroup.class;\r
 871   }\r
 872 \r
 873   /**\r
 874    * Method getNameSpacePrefix.\r
 875    * \r
 876    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 877    */\r
 878   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 879   {\r
 880     return _nsPrefix;\r
 881   }\r
 882 \r
 883   /**\r
 884    * Method getNameSpaceURI.\r
 885    * \r
 886    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 887    */\r
 888   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 889   {\r
 890     return _nsURI;\r
 891   }\r
 892 \r
 893   /**\r
 894    * Method getValidator.\r
 895    * \r
 896    * @return a specific validator for the class described by this\r
 897    *         ClassDescriptor.\r
 898    */\r
 899   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 900   {\r
 901     return this;\r
 902   }\r
 903 \r
 904   /**\r
 905    * Method getXMLName.\r
 906    * \r
 907    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 908    */\r
 909   public java.lang.String getXMLName()\r
 910   {\r
 911     return _xmlName;\r
 912   }\r
 913 \r
 914   /**\r
 915    * Method isElementDefinition.\r
 916    * \r
 917    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 918    *         element or element with anonymous type definition.\r
 919    */\r
 920   public boolean isElementDefinition()\r
 921   {\r
 922     return _elementDefinition;\r
 923   }\r
 924 \r
 925 }\r