src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/PdbidsDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  19 \r
  20 //---------------------------------/\r
  21 //- Imported classes and packages -/\r
  22 //---------------------------------/\r
  23 \r
  24 import jalview.schemabinding.version2.Pdbids;\r
  25 \r
  26 /**\r
  27  * Class PdbidsDescriptor.\r
  28  * \r
  29  * @version $Revision$ $Date$\r
  30  */\r
  31 public class PdbidsDescriptor extends\r
  32         jalview.schemabinding.version2.descriptors.PdbentryDescriptor\r
  33 {\r
  34 \r
  35   // --------------------------/\r
  36   // - Class/Member Variables -/\r
  37   // --------------------------/\r
  38 \r
  39   /**\r
  40    * Field _elementDefinition.\r
  41    */\r
  42   private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44   /**\r
  45    * Field _nsPrefix.\r
  46    */\r
  47   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49   /**\r
  50    * Field _nsURI.\r
  51    */\r
  52   private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54   /**\r
  55    * Field _xmlName.\r
  56    */\r
  57   private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59   // ----------------/\r
  60   // - Constructors -/\r
  61   // ----------------/\r
  62 \r
  63   public PdbidsDescriptor()\r
  64   {\r
  65     super();\r
  66     setExtendsWithoutFlatten(new jalview.schemabinding.version2.descriptors.PdbentryDescriptor());\r
  67     _nsURI = "www.jalview.org";\r
  68     _xmlName = "pdbids";\r
  69     _elementDefinition = true;\r
  70 \r
  71     // -- set grouping compositor\r
  72     setCompositorAsSequence();\r
  73     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  74     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  75     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  76     // -- initialize attribute descriptors\r
  77 \r
  78     // -- initialize element descriptors\r
  79 \r
  80     // -- _structureStateList\r
  81     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  82             jalview.schemabinding.version2.StructureState.class,\r
  83             "_structureStateList", "structureState",\r
  84             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
  85     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  86     {\r
  87       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  88               throws IllegalStateException\r
  89       {\r
  90         Pdbids target = (Pdbids) object;\r
  91         return target.getStructureState();\r
  92       }\r
  93 \r
  94       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  95               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  96       {\r
  97         try\r
  98         {\r
  99           Pdbids target = (Pdbids) object;\r
 100           target.addStructureState((jalview.schemabinding.version2.StructureState) value);\r
 101         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 102         {\r
 103           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 104         }\r
 105       }\r
 106 \r
 107       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,\r
 108               IllegalArgumentException\r
 109       {\r
 110         try\r
 111         {\r
 112           Pdbids target = (Pdbids) object;\r
 113           target.removeAllStructureState();\r
 114         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 115         {\r
 116           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 117         }\r
 118       }\r
 119 \r
 120       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 121       {\r
 122         return new jalview.schemabinding.version2.StructureState();\r
 123       }\r
 124     };\r
 125     desc.setHandler(handler);\r
 126     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 127     desc.setMultivalued(true);\r
 128     addFieldDescriptor(desc);\r
 129 \r
 130     // -- validation code for: _structureStateList\r
 131     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 132     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 133     { // -- local scope\r
 134     }\r
 135     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 136   }\r
 137 \r
 138   // -----------/\r
 139   // - Methods -/\r
 140   // -----------/\r
 141 \r
 142   /**\r
 143    * Method getAccessMode.\r
 144    * \r
 145    * @return the access mode specified for this class.\r
 146    */\r
 147   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 148   {\r
 149     return null;\r
 150   }\r
 151 \r
 152   /**\r
 153    * Method getIdentity.\r
 154    * \r
 155    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 156    */\r
 157   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 158   {\r
 159     return super.getIdentity();\r
 160   }\r
 161 \r
 162   /**\r
 163    * Method getJavaClass.\r
 164    * \r
 165    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 166    */\r
 167   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 168   {\r
 169     return jalview.schemabinding.version2.Pdbids.class;\r
 170   }\r
 171 \r
 172   /**\r
 173    * Method getNameSpacePrefix.\r
 174    * \r
 175    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 176    */\r
 177   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 178   {\r
 179     return _nsPrefix;\r
 180   }\r
 181 \r
 182   /**\r
 183    * Method getNameSpaceURI.\r
 184    * \r
 185    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 186    */\r
 187   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 188   {\r
 189     return _nsURI;\r
 190   }\r
 191 \r
 192   /**\r
 193    * Method getValidator.\r
 194    * \r
 195    * @return a specific validator for the class described by this\r
 196    *         ClassDescriptor.\r
 197    */\r
 198   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 199   {\r
 200     return this;\r
 201   }\r
 202 \r
 203   /**\r
 204    * Method getXMLName.\r
 205    * \r
 206    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 207    */\r
 208   public java.lang.String getXMLName()\r
 209   {\r
 210     return _xmlName;\r
 211   }\r
 212 \r
 213   /**\r
 214    * Method isElementDefinition.\r
 215    * \r
 216    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 217    *         element or element with anonymous type definition.\r
 218    */\r
 219   public boolean isElementDefinition()\r
 220   {\r
 221     return _elementDefinition;\r
 222   }\r
 223 \r
 224 }\r