src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/TreeDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4.1)\r
   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21   //---------------------------------/\r
  22  //- Imported classes and packages -/\r
  23 //---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.Tree;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class TreeDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class TreeDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  33 \r
  34 \r
  35       //--------------------------/\r
  36      //- Class/Member Variables -/\r
  37     //--------------------------/\r
  38 \r
  39     /**\r
  40      * Field _elementDefinition.\r
  41      */\r
  42     private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44     /**\r
  45      * Field _nsPrefix.\r
  46      */\r
  47     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49     /**\r
  50      * Field _nsURI.\r
  51      */\r
  52     private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54     /**\r
  55      * Field _xmlName.\r
  56      */\r
  57     private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59 \r
  60       //----------------/\r
  61      //- Constructors -/\r
  62     //----------------/\r
  63 \r
  64     public TreeDescriptor() {\r
  65         super();\r
  66         _nsURI = "www.jalview.org";\r
  67         _xmlName = "tree";\r
  68         _elementDefinition = true;\r
  69         \r
  70         //-- set grouping compositor\r
  71         setCompositorAsSequence();\r
  72         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  73         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  74         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  75         //-- initialize attribute descriptors\r
  76         \r
  77         //-- _width\r
  78         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_width", "width", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  79         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  80             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  81                 throws IllegalStateException\r
  82             {\r
  83                 Tree target = (Tree) object;\r
  84                 if (!target.hasWidth()) { return null; }\r
  85                 return new java.lang.Integer(target.getWidth());\r
  86             }\r
  87             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  88                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  89             {\r
  90                 try {\r
  91                     Tree target = (Tree) object;\r
  92                     // if null, use delete method for optional primitives \r
  93                     if (value == null) {\r
  94                         target.deleteWidth();\r
  95                         return;\r
  96                     }\r
  97                     target.setWidth( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
  98                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  99                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 100                 }\r
 101             }\r
 102             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 103                 return null;\r
 104             }\r
 105         };\r
 106         desc.setHandler(handler);\r
 107         desc.setMultivalued(false);\r
 108         addFieldDescriptor(desc);\r
 109         \r
 110         //-- validation code for: _width\r
 111         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 112         { //-- local scope\r
 113             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 114             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 115             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 116             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 117             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 118         }\r
 119         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 120         //-- _height\r
 121         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_height", "height", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 122         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 123             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 124                 throws IllegalStateException\r
 125             {\r
 126                 Tree target = (Tree) object;\r
 127                 if (!target.hasHeight()) { return null; }\r
 128                 return new java.lang.Integer(target.getHeight());\r
 129             }\r
 130             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 131                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 132             {\r
 133                 try {\r
 134                     Tree target = (Tree) object;\r
 135                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 136                     if (value == null) {\r
 137                         target.deleteHeight();\r
 138                         return;\r
 139                     }\r
 140                     target.setHeight( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 141                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 142                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 143                 }\r
 144             }\r
 145             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 146                 return null;\r
 147             }\r
 148         };\r
 149         desc.setHandler(handler);\r
 150         desc.setMultivalued(false);\r
 151         addFieldDescriptor(desc);\r
 152         \r
 153         //-- validation code for: _height\r
 154         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 155         { //-- local scope\r
 156             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 157             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 158             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 159             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 160             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 161         }\r
 162         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 163         //-- _xpos\r
 164         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_xpos", "xpos", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 165         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 166             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 167                 throws IllegalStateException\r
 168             {\r
 169                 Tree target = (Tree) object;\r
 170                 if (!target.hasXpos()) { return null; }\r
 171                 return new java.lang.Integer(target.getXpos());\r
 172             }\r
 173             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 174                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 175             {\r
 176                 try {\r
 177                     Tree target = (Tree) object;\r
 178                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 179                     if (value == null) {\r
 180                         target.deleteXpos();\r
 181                         return;\r
 182                     }\r
 183                     target.setXpos( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 184                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 185                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 186                 }\r
 187             }\r
 188             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 189                 return null;\r
 190             }\r
 191         };\r
 192         desc.setHandler(handler);\r
 193         desc.setMultivalued(false);\r
 194         addFieldDescriptor(desc);\r
 195         \r
 196         //-- validation code for: _xpos\r
 197         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 198         { //-- local scope\r
 199             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 200             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 201             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 202             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 203             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 204         }\r
 205         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 206         //-- _ypos\r
 207         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_ypos", "ypos", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 208         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 209             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 210                 throws IllegalStateException\r
 211             {\r
 212                 Tree target = (Tree) object;\r
 213                 if (!target.hasYpos()) { return null; }\r
 214                 return new java.lang.Integer(target.getYpos());\r
 215             }\r
 216             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 217                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 218             {\r
 219                 try {\r
 220                     Tree target = (Tree) object;\r
 221                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 222                     if (value == null) {\r
 223                         target.deleteYpos();\r
 224                         return;\r
 225                     }\r
 226                     target.setYpos( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 227                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 228                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 229                 }\r
 230             }\r
 231             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 232                 return null;\r
 233             }\r
 234         };\r
 235         desc.setHandler(handler);\r
 236         desc.setMultivalued(false);\r
 237         addFieldDescriptor(desc);\r
 238         \r
 239         //-- validation code for: _ypos\r
 240         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 241         { //-- local scope\r
 242             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 243             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 244             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 245             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 246             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 247         }\r
 248         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 249         //-- _fontName\r
 250         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_fontName", "fontName", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 251         desc.setImmutable(true);\r
 252         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 253             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 254                 throws IllegalStateException\r
 255             {\r
 256                 Tree target = (Tree) object;\r
 257                 return target.getFontName();\r
 258             }\r
 259             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 260                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 261             {\r
 262                 try {\r
 263                     Tree target = (Tree) object;\r
 264                     target.setFontName( (java.lang.String) value);\r
 265                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 266                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 267                 }\r
 268             }\r
 269             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 270                 return null;\r
 271             }\r
 272         };\r
 273         desc.setHandler(handler);\r
 274         desc.setMultivalued(false);\r
 275         addFieldDescriptor(desc);\r
 276         \r
 277         //-- validation code for: _fontName\r
 278         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 279         { //-- local scope\r
 280             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 281             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 282             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 283             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 284         }\r
 285         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 286         //-- _fontSize\r
 287         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_fontSize", "fontSize", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 288         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 289             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 290                 throws IllegalStateException\r
 291             {\r
 292                 Tree target = (Tree) object;\r
 293                 if (!target.hasFontSize()) { return null; }\r
 294                 return new java.lang.Integer(target.getFontSize());\r
 295             }\r
 296             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 297                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 298             {\r
 299                 try {\r
 300                     Tree target = (Tree) object;\r
 301                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 302                     if (value == null) {\r
 303                         target.deleteFontSize();\r
 304                         return;\r
 305                     }\r
 306                     target.setFontSize( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 307                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 308                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 309                 }\r
 310             }\r
 311             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 312                 return null;\r
 313             }\r
 314         };\r
 315         desc.setHandler(handler);\r
 316         desc.setMultivalued(false);\r
 317         addFieldDescriptor(desc);\r
 318         \r
 319         //-- validation code for: _fontSize\r
 320         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 321         { //-- local scope\r
 322             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 323             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 324             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 325             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 326             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 327         }\r
 328         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 329         //-- _fontStyle\r
 330         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_fontStyle", "fontStyle", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 331         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 332             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 333                 throws IllegalStateException\r
 334             {\r
 335                 Tree target = (Tree) object;\r
 336                 if (!target.hasFontStyle()) { return null; }\r
 337                 return new java.lang.Integer(target.getFontStyle());\r
 338             }\r
 339             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 340                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 341             {\r
 342                 try {\r
 343                     Tree target = (Tree) object;\r
 344                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 345                     if (value == null) {\r
 346                         target.deleteFontStyle();\r
 347                         return;\r
 348                     }\r
 349                     target.setFontStyle( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 350                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 351                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 352                 }\r
 353             }\r
 354             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 355                 return null;\r
 356             }\r
 357         };\r
 358         desc.setHandler(handler);\r
 359         desc.setMultivalued(false);\r
 360         addFieldDescriptor(desc);\r
 361         \r
 362         //-- validation code for: _fontStyle\r
 363         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 364         { //-- local scope\r
 365             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 366             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 367             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 368             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 369             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 370         }\r
 371         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 372         //-- _threshold\r
 373         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Float.TYPE, "_threshold", "threshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 374         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 375             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 376                 throws IllegalStateException\r
 377             {\r
 378                 Tree target = (Tree) object;\r
 379                 if (!target.hasThreshold()) { return null; }\r
 380                 return new java.lang.Float(target.getThreshold());\r
 381             }\r
 382             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 383                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 384             {\r
 385                 try {\r
 386                     Tree target = (Tree) object;\r
 387                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 388                     if (value == null) {\r
 389                         target.deleteThreshold();\r
 390                         return;\r
 391                     }\r
 392                     target.setThreshold( ((java.lang.Float) value).floatValue());\r
 393                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 394                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 395                 }\r
 396             }\r
 397             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 398                 return null;\r
 399             }\r
 400         };\r
 401         desc.setHandler(handler);\r
 402         desc.setMultivalued(false);\r
 403         addFieldDescriptor(desc);\r
 404         \r
 405         //-- validation code for: _threshold\r
 406         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 407         { //-- local scope\r
 408             org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;\r
 409             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();\r
 410             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 411             typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);\r
 412             typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);\r
 413         }\r
 414         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 415         //-- _showBootstrap\r
 416         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_showBootstrap", "showBootstrap", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 417         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 418             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 419                 throws IllegalStateException\r
 420             {\r
 421                 Tree target = (Tree) object;\r
 422                 if (!target.hasShowBootstrap()) { return null; }\r
 423                 return (target.getShowBootstrap() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 424             }\r
 425             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 426                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 427             {\r
 428                 try {\r
 429                     Tree target = (Tree) object;\r
 430                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 431                     if (value == null) {\r
 432                         target.deleteShowBootstrap();\r
 433                         return;\r
 434                     }\r
 435                     target.setShowBootstrap( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 436                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 437                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 438                 }\r
 439             }\r
 440             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 441                 return null;\r
 442             }\r
 443         };\r
 444         desc.setHandler(handler);\r
 445         desc.setMultivalued(false);\r
 446         addFieldDescriptor(desc);\r
 447         \r
 448         //-- validation code for: _showBootstrap\r
 449         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 450         { //-- local scope\r
 451             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 452             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 453             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 454         }\r
 455         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 456         //-- _showDistances\r
 457         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_showDistances", "showDistances", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 458         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 459             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 460                 throws IllegalStateException\r
 461             {\r
 462                 Tree target = (Tree) object;\r
 463                 if (!target.hasShowDistances()) { return null; }\r
 464                 return (target.getShowDistances() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 465             }\r
 466             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 467                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 468             {\r
 469                 try {\r
 470                     Tree target = (Tree) object;\r
 471                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 472                     if (value == null) {\r
 473                         target.deleteShowDistances();\r
 474                         return;\r
 475                     }\r
 476                     target.setShowDistances( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 477                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 478                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 479                 }\r
 480             }\r
 481             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 482                 return null;\r
 483             }\r
 484         };\r
 485         desc.setHandler(handler);\r
 486         desc.setMultivalued(false);\r
 487         addFieldDescriptor(desc);\r
 488         \r
 489         //-- validation code for: _showDistances\r
 490         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 491         { //-- local scope\r
 492             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 493             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 494             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 495         }\r
 496         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 497         //-- _markUnlinked\r
 498         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_markUnlinked", "markUnlinked", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 499         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 500             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 501                 throws IllegalStateException\r
 502             {\r
 503                 Tree target = (Tree) object;\r
 504                 if (!target.hasMarkUnlinked()) { return null; }\r
 505                 return (target.getMarkUnlinked() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 506             }\r
 507             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 508                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 509             {\r
 510                 try {\r
 511                     Tree target = (Tree) object;\r
 512                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 513                     if (value == null) {\r
 514                         target.deleteMarkUnlinked();\r
 515                         return;\r
 516                     }\r
 517                     target.setMarkUnlinked( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 518                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 519                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 520                 }\r
 521             }\r
 522             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 523                 return null;\r
 524             }\r
 525         };\r
 526         desc.setHandler(handler);\r
 527         desc.setMultivalued(false);\r
 528         addFieldDescriptor(desc);\r
 529         \r
 530         //-- validation code for: _markUnlinked\r
 531         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 532         { //-- local scope\r
 533             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 534             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 535             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 536         }\r
 537         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 538         //-- _fitToWindow\r
 539         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_fitToWindow", "fitToWindow", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 540         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 541             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 542                 throws IllegalStateException\r
 543             {\r
 544                 Tree target = (Tree) object;\r
 545                 if (!target.hasFitToWindow()) { return null; }\r
 546                 return (target.getFitToWindow() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 547             }\r
 548             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 549                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 550             {\r
 551                 try {\r
 552                     Tree target = (Tree) object;\r
 553                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 554                     if (value == null) {\r
 555                         target.deleteFitToWindow();\r
 556                         return;\r
 557                     }\r
 558                     target.setFitToWindow( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 559                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 560                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 561                 }\r
 562             }\r
 563             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 564                 return null;\r
 565             }\r
 566         };\r
 567         desc.setHandler(handler);\r
 568         desc.setMultivalued(false);\r
 569         addFieldDescriptor(desc);\r
 570         \r
 571         //-- validation code for: _fitToWindow\r
 572         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 573         { //-- local scope\r
 574             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 575             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 576             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 577         }\r
 578         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 579         //-- _currentTree\r
 580         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_currentTree", "currentTree", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 581         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 582             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 583                 throws IllegalStateException\r
 584             {\r
 585                 Tree target = (Tree) object;\r
 586                 if (!target.hasCurrentTree()) { return null; }\r
 587                 return (target.getCurrentTree() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 588             }\r
 589             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 590                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 591             {\r
 592                 try {\r
 593                     Tree target = (Tree) object;\r
 594                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 595                     if (value == null) {\r
 596                         target.deleteCurrentTree();\r
 597                         return;\r
 598                     }\r
 599                     target.setCurrentTree( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 600                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 601                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 602                 }\r
 603             }\r
 604             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 605                 return null;\r
 606             }\r
 607         };\r
 608         desc.setHandler(handler);\r
 609         desc.setMultivalued(false);\r
 610         addFieldDescriptor(desc);\r
 611         \r
 612         //-- validation code for: _currentTree\r
 613         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 614         { //-- local scope\r
 615             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 616             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 617             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 618         }\r
 619         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 620         //-- _id\r
 621         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 622         super.setIdentity(desc);\r
 623         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 624             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 625                 throws IllegalStateException\r
 626             {\r
 627                 Tree target = (Tree) object;\r
 628                 return target.getId();\r
 629             }\r
 630             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 631                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 632             {\r
 633                 try {\r
 634                     Tree target = (Tree) object;\r
 635                     target.setId( (java.lang.String) value);\r
 636                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 637                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 638                 }\r
 639             }\r
 640             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 641                 return new java.lang.String();\r
 642             }\r
 643         };\r
 644         desc.setHandler(handler);\r
 645         desc.setMultivalued(false);\r
 646         addFieldDescriptor(desc);\r
 647         \r
 648         //-- validation code for: _id\r
 649         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 650         { //-- local scope\r
 651             org.exolab.castor.xml.validators.IdValidator typeValidator;\r
 652             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IdValidator();\r
 653             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 654         }\r
 655         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 656         //-- initialize element descriptors\r
 657         \r
 658         //-- _title\r
 659         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_title", "title", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 660         desc.setImmutable(true);\r
 661         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 662             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 663                 throws IllegalStateException\r
 664             {\r
 665                 Tree target = (Tree) object;\r
 666                 return target.getTitle();\r
 667             }\r
 668             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 669                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 670             {\r
 671                 try {\r
 672                     Tree target = (Tree) object;\r
 673                     target.setTitle( (java.lang.String) value);\r
 674                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 675                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 676                 }\r
 677             }\r
 678             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 679                 return null;\r
 680             }\r
 681         };\r
 682         desc.setHandler(handler);\r
 683         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 684         desc.setMultivalued(false);\r
 685         addFieldDescriptor(desc);\r
 686         \r
 687         //-- validation code for: _title\r
 688         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 689         { //-- local scope\r
 690             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 691             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 692             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 693             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 694         }\r
 695         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 696         //-- _newick\r
 697         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_newick", "newick", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 698         desc.setImmutable(true);\r
 699         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 700             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 701                 throws IllegalStateException\r
 702             {\r
 703                 Tree target = (Tree) object;\r
 704                 return target.getNewick();\r
 705             }\r
 706             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 707                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 708             {\r
 709                 try {\r
 710                     Tree target = (Tree) object;\r
 711                     target.setNewick( (java.lang.String) value);\r
 712                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 713                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 714                 }\r
 715             }\r
 716             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 717                 return null;\r
 718             }\r
 719         };\r
 720         desc.setHandler(handler);\r
 721         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 722         desc.setMultivalued(false);\r
 723         addFieldDescriptor(desc);\r
 724         \r
 725         //-- validation code for: _newick\r
 726         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 727         { //-- local scope\r
 728             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 729             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 730             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 731             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 732         }\r
 733         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 734     }\r
 735 \r
 736 \r
 737       //-----------/\r
 738      //- Methods -/\r
 739     //-----------/\r
 740 \r
 741     /**\r
 742      * Method getAccessMode.\r
 743      * \r
 744      * @return the access mode specified for this class.\r
 745      */\r
 746     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 747     ) {\r
 748         return null;\r
 749     }\r
 750 \r
 751     /**\r
 752      * Method getIdentity.\r
 753      * \r
 754      * @return the identity field, null if this class has no\r
 755      * identity.\r
 756      */\r
 757     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 758     ) {\r
 759         return super.getIdentity();\r
 760     }\r
 761 \r
 762     /**\r
 763      * Method getJavaClass.\r
 764      * \r
 765      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 766      */\r
 767     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 768     ) {\r
 769         return jalview.schemabinding.version2.Tree.class;\r
 770     }\r
 771 \r
 772     /**\r
 773      * Method getNameSpacePrefix.\r
 774      * \r
 775      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 776      */\r
 777     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 778     ) {\r
 779         return _nsPrefix;\r
 780     }\r
 781 \r
 782     /**\r
 783      * Method getNameSpaceURI.\r
 784      * \r
 785      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 786      * unmarshaling as XML.\r
 787      */\r
 788     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 789     ) {\r
 790         return _nsURI;\r
 791     }\r
 792 \r
 793     /**\r
 794      * Method getValidator.\r
 795      * \r
 796      * @return a specific validator for the class described by this\r
 797      * ClassDescriptor.\r
 798      */\r
 799     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 800     ) {\r
 801         return this;\r
 802     }\r
 803 \r
 804     /**\r
 805      * Method getXMLName.\r
 806      * \r
 807      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 808      */\r
 809     public java.lang.String getXMLName(\r
 810     ) {\r
 811         return _xmlName;\r
 812     }\r
 813 \r
 814     /**\r
 815      * Method isElementDefinition.\r
 816      * \r
 817      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 818      * of a global\r
 819      * element or element with anonymous type definition.\r
 820      */\r
 821     public boolean isElementDefinition(\r
 822     ) {\r
 823         return _elementDefinition;\r
 824     }\r
 825 \r
 826 }\r