src/jalview/schemes/SecondaryColourScheme.java

   1 package jalview.schemes;\r
   2 \r
   3 import jalview.gui.DrawableSequence;\r
   4 \r
   5 import java.util.*;\r
   6 import java.awt.*;\r
   7 \r
   8 \r
   9 public class SecondaryColourScheme extends ResidueColourScheme {\r
  10 \r
  11   public Color getColor(DrawableSequence seq, int j, Vector aa) {\r
  12     Color c = Color.white;\r
  13 \r
  14     String s = seq.getSequence().substring(j,j+1);\r
  15 \r
  16     if (ResidueProperties.ssHash.containsKey(s)) {\r
  17         c = (Color)ResidueProperties.ssHash.get(s);\r
  18     } else {\r
  19         c = Color.white;\r
  20     }\r
  21     return c;\r
  22   }\r
  23 }\r
  24 \r
  25 \r
  26 \r
  27 \r
  28 \r