src/jalview/ws/dbsources/das/api/DasSourceRegistryI.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
   3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
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   6  *
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  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package jalview.ws.dbsources.das.api;
  19
  20 import java.util.Hashtable;
  21 import java.util.List;
  22 import java.util.Map;
  23
  24 import org.biodas.jdas.client.ConnectionPropertyProviderI;
  25 import org.biodas.jdas.client.threads.MultipleConnectionPropertyProviderI;
  26 import org.biodas.jdas.schema.sources.SOURCE;
  27
  28 /**
  29  * API for a registry that provides datasources that jalview can access
  30  *
  31  * @author jprocter
  32  *
  33  */
  34 public interface DasSourceRegistryI
  35 {
  36
  37   List<jalviewSourceI> getSources();
  38
  39   String getDasRegistryURL();
  40
  41   jalviewSourceI getSource(String nickname);
  42
  43   // TODO: re JAL-424 - introduce form where local source is queried for
  44   // metadata, rather than have it all provided by caller.
  45   jalviewSourceI createLocalSource(String uri, String name,
  46           boolean sequence, boolean features);
  47
  48   boolean removeLocalSource(jalviewSourceI source);
  49
  50   void refreshSources();
  51
  52   String getLocalSourceString();
  53
  54   List<jalviewSourceI> resolveSourceNicknames(List<String> sources);
  55
  56   // TODO: refactor to jDAS specific interface
  57   MultipleConnectionPropertyProviderI getSessionHandler();
  58 }