src/org/biojava/dasobert/eventmodel/FeatureEvent.java

   1 /*
   2  *                  BioJava development code
   3  *
   4  * This code may be freely distributed and modified under the
   5  * terms of the GNU Lesser General Public Licence.  This should
   6  * be distributed with the code.  If you do not have a copy,
   7  * see:
   8  *
   9  *      http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
  10  *
  11  * Copyright for this code is held jointly by the individual
  12  * authors.  These should be listed in @author doc comments.
  13  *
  14  * For more information on the BioJava project and its aims,
  15  * or to join the biojava-l mailing list, visit the home page
  16  * at:
  17  *
  18  *      http://www.biojava.org/
  19  *
  20  * Created on Oct 28, 2005
  21  *
  22  */
  23 package org.biojava.dasobert.eventmodel;
  24
  25 import java.util.*;
  26
  27 import org.biojava.dasobert.dasregistry.*;
  28
  29 public class FeatureEvent extends AbstractDasEvent
  30 {
  31
  32   Map[] features;
  33
  34   int comeBackLater;
  35
  36   String version;
  37
  38   public FeatureEvent(Map[] features, Das1Source dasSource, String version)
  39   {
  40     super();
  41     this.features = features;
  42     this.dasSource = dasSource;
  43     comeBackLater = -1;
  44     this.version = version;
  45   }
  46
  47   public int getComeBackLater()
  48   {
  49     return comeBackLater;
  50   }
  51
  52   public void setComeBackLater(int comeBackLater)
  53   {
  54     this.comeBackLater = comeBackLater;
  55   }
  56
  57   /**
  58    * get the features that have been found.
  59    *
  60    * do something like Map[] features = event.getFeatures();
  61    *
  62    * <pre>
  63    * for (int i = 0; i &lt; features; i++)
  64    * {
  65    *   Map f = features[i];
  66    *   String type = (String) f.get(&quot;TYPE&quot;);
  67    *   System.out.println(type);
  68    * }
  69    * </pre>
  70    *
  71    * @return a Map containng the features
  72    */
  73   public Map[] getFeatures()
  74   {
  75     return features;
  76   }
  77
  78   /**
  79    * Get the version of the reference object that has been annotated. Compare
  80    * the version string with the version string obtained from the reference
  81    * server. If they don;t match there is a version problem between the
  82    * annotation and the reference!
  83    *
  84    * @return the version string (e.g. an MD5 digest of the reference sequence)
  85    */
  86   public String getVersion()
  87   {
  88     return version;
  89   }
  90
  91   public void setVersion(String version)
  92   {
  93     this.version = version;
  94   }
  95
  96 }